RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292393.9

ZNF3-201, Transcript of zinc finger protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF3, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3-201ENST00000292393 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.22■■■□□ 2.11
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ZNF3-201ENST00000292393 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
ZNF3-201ENST00000292393 ABCC9O60706 1549 aa23.54■■□□□ 1.36
ZNF3-201ENST00000292393 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.45■■□□□ 1.34
ZNF3-201ENST00000292393 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.32■■□□□ 1.32
ZNF3-201ENST00000292393 NACADO15069 1562 aa23.18■■□□□ 1.3
ZNF3-201ENST00000292393 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.17■■□□□ 1.3
ZNF3-201ENST00000292393 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.01■■□□□ 1.27
ZNF3-201ENST00000292393 SCRIBQ14160 1630 aa22.61■■□□□ 1.21
ZNF3-201ENST00000292393 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.58■■□□□ 1.2
ZNF3-201ENST00000292393 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.42■■□□□ 1.18
ZNF3-201ENST00000292393 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.28■■□□□ 1.16
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ZNF3-201ENST00000292393 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.86■■□□□ 1.09
ZNF3-201ENST00000292393 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
ZNF3-201ENST00000292393 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
ZNF3-201ENST00000292393 SMARCA4P51532 1647 aa21.73■■□□□ 1.07
ZNF3-201ENST00000292393 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.73■■□□□ 1.07
ZNF3-201ENST00000292393 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
ZNF3-201ENST00000292393 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
ZNF3-201ENST00000292393 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.58■■□□□ 1.05
ZNF3-201ENST00000292393 WIZO95785 1651 aa21.5■■□□□ 1.03
ZNF3-201ENST00000292393 SMARCA2P51531 1590 aa21.48■■□□□ 1.03
ZNF3-201ENST00000292393 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.46■■□□□ 1.03
ZNF3-201ENST00000292393 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
ZNF3-201ENST00000292393 NCAPD3P42695 1498 aa21.38■■□□□ 1.01
ZNF3-201ENST00000292393 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.35■■□□□ 1.01
ZNF3-201ENST00000292393 HMGXB3Q12766 1538 aa21.34■■□□□ 1.01
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ZNF3-201ENST00000292393 NESP48681 1621 aa20.57■□□□□ 0.88
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ZNF3-201ENST00000292393 ABCC8Q09428 1581 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF3-201ENST00000292393 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
ZNF3-201ENST00000292393 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.43■□□□□ 0.86
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ZNF3-201ENST00000292393 TOP2BQ02880 1626 aa20.38■□□□□ 0.85
ZNF3-201ENST00000292393 SYNJ1O43426 1573 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF3-201ENST00000292393 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.36■□□□□ 0.85
ZNF3-201ENST00000292393 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.35■□□□□ 0.85
ZNF3-201ENST00000292393 CUX1P39880 1505 aa20.34■□□□□ 0.85
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ZNF3-201ENST00000292393 TOPBP1Q92547 1522 aa20.27■□□□□ 0.83
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ZNF3-201ENST00000292393 CUX2O14529 1486 aa20.01■□□□□ 0.79
ZNF3-201ENST00000292393 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20■□□□□ 0.79
ZNF3-201ENST00000292393 IFT140Q96RY7 1462 aa19.99■□□□□ 0.79
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ZNF3-201ENST00000292393 WDR97A6NE52 1622 aa19.98■□□□□ 0.79
ZNF3-201ENST00000292393 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.97■□□□□ 0.79
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ZNF3-201ENST00000292393 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.9■□□□□ 0.78
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ZNF3-201ENST00000292393 IGF1RP08069 1367 aa19.83■□□□□ 0.77
ZNF3-201ENST00000292393 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
ZNF3-201ENST00000292393 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.82■□□□□ 0.76
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ZNF3-201ENST00000292393 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa19.7■□□□□ 0.74
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ZNF3-201ENST00000292393 GRIN2AQ12879 1464 aa19.51■□□□□ 0.71
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ZNF3-201ENST00000292393 NUP160Q12769 1436 aa19.41■□□□□ 0.7
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