RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513095.5

SH3BP2-226, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP2, Length 609 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-226ENST00000513095 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.31■■■■□ 3.08
SH3BP2-226ENST00000513095 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.47■■■□□ 2.47
SH3BP2-226ENST00000513095 ABCC9O60706 1549 aa29.76■■■□□ 2.36
SH3BP2-226ENST00000513095 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.64■■■□□ 2.18
SH3BP2-226ENST00000513095 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.64■■■□□ 2.18
SH3BP2-226ENST00000513095 NACADO15069 1562 aa28.62■■■□□ 2.17
SH3BP2-226ENST00000513095 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
SH3BP2-226ENST00000513095 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.48■■■□□ 2.15
SH3BP2-226ENST00000513095 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.38■■■□□ 2.13
SH3BP2-226ENST00000513095 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.02■■■□□ 2.08
SH3BP2-226ENST00000513095 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.83■■■□□ 2.05
SH3BP2-226ENST00000513095 SCRIBQ14160 1630 aa27.81■■■□□ 2.04
SH3BP2-226ENST00000513095 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.8■■■□□ 2.04
SH3BP2-226ENST00000513095 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-226ENST00000513095 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.29■■□□□ 1.96
SH3BP2-226ENST00000513095 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
SH3BP2-226ENST00000513095 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-226ENST00000513095 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-226ENST00000513095 SMARCA4P51532 1647 aa26.61■■□□□ 1.85
SH3BP2-226ENST00000513095 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
SH3BP2-226ENST00000513095 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-226ENST00000513095 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-226ENST00000513095 NCAPD3P42695 1498 aa26.42■■□□□ 1.82
SH3BP2-226ENST00000513095 SMARCA2P51531 1590 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP2-226ENST00000513095 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-226ENST00000513095 HMGXB3Q12766 1538 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-226ENST00000513095 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
SH3BP2-226ENST00000513095 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2-226ENST00000513095 WIZO95785 1651 aa26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2-226ENST00000513095 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-226ENST00000513095 NESP48681 1621 aa25.78■■□□□ 1.72
SH3BP2-226ENST00000513095 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.71■■□□□ 1.71
SH3BP2-226ENST00000513095 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.66■■□□□ 1.7
SH3BP2-226ENST00000513095 ERCC6Q03468 1493 aa25.63■■□□□ 1.69
SH3BP2-226ENST00000513095 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.6■■□□□ 1.69
SH3BP2-226ENST00000513095 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
SH3BP2-226ENST00000513095 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.53■■□□□ 1.68
SH3BP2-226ENST00000513095 CFTRP13569 1480 aa25.52■■□□□ 1.68
SH3BP2-226ENST00000513095 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-226ENST00000513095 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-226ENST00000513095 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP2-226ENST00000513095 CUX2O14529 1486 aa25.34■■□□□ 1.65
SH3BP2-226ENST00000513095 PRDM2Q13029 1718 aa25.32■■□□□ 1.64
SH3BP2-226ENST00000513095 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP2-226ENST00000513095 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP2-226ENST00000513095 WDR62O43379 1518 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2-226ENST00000513095 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SH3BP2-226ENST00000513095 TOPBP1Q92547 1522 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2-226ENST00000513095 ABCC8Q09428 1581 aa24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2-226ENST00000513095 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-226ENST00000513095 CUX1P39880 1505 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-226ENST00000513095 IFT140Q96RY7 1462 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-226ENST00000513095 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-226ENST00000513095 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP2-226ENST00000513095 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
SH3BP2-226ENST00000513095 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
SH3BP2-226ENST00000513095 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP2-226ENST00000513095 SOGA1O94964 1423 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP2-226ENST00000513095 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.66■■□□□ 1.54
SH3BP2-226ENST00000513095 SYNJ1O43426 1573 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-226ENST00000513095 TOP2BQ02880 1626 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2-226ENST00000513095 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2-226ENST00000513095 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
SH3BP2-226ENST00000513095 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-226ENST00000513095 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-226ENST00000513095 WDR97A6NE52 1622 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP2-226ENST00000513095 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP2-226ENST00000513095 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BP2-226ENST00000513095 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.37■■□□□ 1.49
SH3BP2-226ENST00000513095 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.37■■□□□ 1.49
SH3BP2-226ENST00000513095 GRIN2BQ13224 1484 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP2-226ENST00000513095 PBRM1Q86U86 1689 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP2-226ENST00000513095 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP2-226ENST00000513095 OSCARQ8IYS5 282 aa24.3■■□□□ 1.48
SH3BP2-226ENST00000513095 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SH3BP2-226ENST00000513095 CHD1O14646 1710 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP2-226ENST00000513095 FBLN2P98095 1184 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP2-226ENST00000513095 SYNJ2O15056 1496 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-226ENST00000513095 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-226ENST00000513095 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-226ENST00000513095 KIF27Q86VH2 1401 aa24.14■■□□□ 1.45
SH3BP2-226ENST00000513095 ADAMTS12P58397 1594 aa24.13■■□□□ 1.45
SH3BP2-226ENST00000513095 TRIM41Q8WV44 630 aa24.13■■□□□ 1.45
SH3BP2-226ENST00000513095 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP2-226ENST00000513095 IGF1RP08069 1367 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-226ENST00000513095 GRIN2AQ12879 1464 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-226ENST00000513095 CLASP1Q7Z460 1538 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-226ENST00000513095 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BP2-226ENST00000513095 CUL7Q14999 1698 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP2-226ENST00000513095 NUP160Q12769 1436 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP2-226ENST00000513095 CEP170Q5SW79 1584 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP2-226ENST00000513095 ARHGEF11O15085 1522 aa23.92■■□□□ 1.42
SH3BP2-226ENST00000513095 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.92■■□□□ 1.42
SH3BP2-226ENST00000513095 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.92■■□□□ 1.42
SH3BP2-226ENST00000513095 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.92■■□□□ 1.42
SH3BP2-226ENST00000513095 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP2-226ENST00000513095 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP2-226ENST00000513095 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-226ENST00000513095 SHROOM2Q13796 1616 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-226ENST00000513095 ARAP1Q96P48 1450 aa23.74■■□□□ 1.39
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