RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460331.5

ZNF3-211, Transcript of zinc finger protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF3, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3-211ENST00000460331 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.15■■■□□ 2.26
ZNF3-211ENST00000460331 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.7■■□□□ 1.7
ZNF3-211ENST00000460331 ABCC9O60706 1549 aa24.66■■□□□ 1.54
ZNF3-211ENST00000460331 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
ZNF3-211ENST00000460331 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.25■■□□□ 1.47
ZNF3-211ENST00000460331 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.16■■□□□ 1.46
ZNF3-211ENST00000460331 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.1■■□□□ 1.45
ZNF3-211ENST00000460331 NACADO15069 1562 aa24.08■■□□□ 1.44
ZNF3-211ENST00000460331 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.98■■□□□ 1.43
ZNF3-211ENST00000460331 SCRIBQ14160 1630 aa23.46■■□□□ 1.35
ZNF3-211ENST00000460331 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.35■■□□□ 1.33
ZNF3-211ENST00000460331 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.33■■□□□ 1.32
ZNF3-211ENST00000460331 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.15■■□□□ 1.3
ZNF3-211ENST00000460331 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.15■■□□□ 1.3
ZNF3-211ENST00000460331 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.63■■□□□ 1.21
ZNF3-211ENST00000460331 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
ZNF3-211ENST00000460331 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
ZNF3-211ENST00000460331 SMARCA4P51532 1647 aa22.5■■□□□ 1.19
ZNF3-211ENST00000460331 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.46■■□□□ 1.19
ZNF3-211ENST00000460331 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
ZNF3-211ENST00000460331 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.31■■□□□ 1.16
ZNF3-211ENST00000460331 SMARCA2P51531 1590 aa22.29■■□□□ 1.16
ZNF3-211ENST00000460331 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
ZNF3-211ENST00000460331 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.27■■□□□ 1.16
ZNF3-211ENST00000460331 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.27■■□□□ 1.16
ZNF3-211ENST00000460331 WIZO95785 1651 aa22.23■■□□□ 1.15
ZNF3-211ENST00000460331 NCAPD3P42695 1498 aa22.2■■□□□ 1.14
ZNF3-211ENST00000460331 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.14■■□□□ 1.13
ZNF3-211ENST00000460331 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ZNF3-211ENST00000460331 HMGXB3Q12766 1538 aa22.12■■□□□ 1.13
ZNF3-211ENST00000460331 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ZNF3-211ENST00000460331 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.79■■□□□ 1.08
ZNF3-211ENST00000460331 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.6■■□□□ 1.05
ZNF3-211ENST00000460331 CFTRP13569 1480 aa21.55■■□□□ 1.04
ZNF3-211ENST00000460331 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.53■■□□□ 1.04
ZNF3-211ENST00000460331 NESP48681 1621 aa21.46■■□□□ 1.03
ZNF3-211ENST00000460331 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.41■■□□□ 1.02
ZNF3-211ENST00000460331 PRDM2Q13029 1718 aa21.38■■□□□ 1.01
ZNF3-211ENST00000460331 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.32■■□□□ 1
ZNF3-211ENST00000460331 ERCC6Q03468 1493 aa21.26■□□□□ 0.99
ZNF3-211ENST00000460331 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.26■□□□□ 0.99
ZNF3-211ENST00000460331 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.21■□□□□ 0.99
ZNF3-211ENST00000460331 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.14■□□□□ 0.98
ZNF3-211ENST00000460331 ABCC8Q09428 1581 aa21.14■□□□□ 0.97
ZNF3-211ENST00000460331 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.13■□□□□ 0.97
ZNF3-211ENST00000460331 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.08■□□□□ 0.97
ZNF3-211ENST00000460331 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.06■□□□□ 0.96
ZNF3-211ENST00000460331 TRIM41Q8WV44 630 aa21.05■□□□□ 0.96
ZNF3-211ENST00000460331 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
ZNF3-211ENST00000460331 TOPBP1Q92547 1522 aa21.04■□□□□ 0.96
ZNF3-211ENST00000460331 CUX1P39880 1505 aa21.03■□□□□ 0.96
ZNF3-211ENST00000460331 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.95
ZNF3-211ENST00000460331 TOP2BQ02880 1626 aa21■□□□□ 0.95
ZNF3-211ENST00000460331 WDR62O43379 1518 aa21■□□□□ 0.95
ZNF3-211ENST00000460331 SYNJ1O43426 1573 aa20.99■□□□□ 0.95
ZNF3-211ENST00000460331 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.99■□□□□ 0.95
ZNF3-211ENST00000460331 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.91■□□□□ 0.94
ZNF3-211ENST00000460331 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
ZNF3-211ENST00000460331 SOGA1O94964 1423 aa20.86■□□□□ 0.93
ZNF3-211ENST00000460331 CUX2O14529 1486 aa20.85■□□□□ 0.93
ZNF3-211ENST00000460331 IFT140Q96RY7 1462 aa20.81■□□□□ 0.92
ZNF3-211ENST00000460331 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.78■□□□□ 0.92
ZNF3-211ENST00000460331 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.74■□□□□ 0.91
ZNF3-211ENST00000460331 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
ZNF3-211ENST00000460331 KIF27Q86VH2 1401 aa20.69■□□□□ 0.9
ZNF3-211ENST00000460331 WDR97A6NE52 1622 aa20.67■□□□□ 0.9
ZNF3-211ENST00000460331 EEA1Q15075 1411 aa20.65■□□□□ 0.9
ZNF3-211ENST00000460331 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
ZNF3-211ENST00000460331 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.61■□□□□ 0.89
ZNF3-211ENST00000460331 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
ZNF3-211ENST00000460331 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.891e-7■■■■■ 43.3
ZNF3-211ENST00000460331 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.57■□□□□ 0.88
ZNF3-211ENST00000460331 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
ZNF3-211ENST00000460331 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.57■□□□□ 0.88
ZNF3-211ENST00000460331 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF3-211ENST00000460331 GRIN2BQ13224 1484 aa20.55■□□□□ 0.88
ZNF3-211ENST00000460331 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
ZNF3-211ENST00000460331 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.52■□□□□ 0.87
ZNF3-211ENST00000460331 IGF1RP08069 1367 aa20.51■□□□□ 0.87
ZNF3-211ENST00000460331 PBRM1Q86U86 1689 aa20.48■□□□□ 0.87
ZNF3-211ENST00000460331 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF3-211ENST00000460331 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
ZNF3-211ENST00000460331 CUL7Q14999 1698 aa20.42■□□□□ 0.86
ZNF3-211ENST00000460331 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.41■□□□□ 0.86
ZNF3-211ENST00000460331 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.4■□□□□ 0.86
ZNF3-211ENST00000460331 PRXQ9BXM0 1461 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF3-211ENST00000460331 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
ZNF3-211ENST00000460331 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.35■□□□□ 0.85
ZNF3-211ENST00000460331 ADAMTS12P58397 1594 aa20.34■□□□□ 0.85
ZNF3-211ENST00000460331 SYNJ2O15056 1496 aa20.34■□□□□ 0.85
ZNF3-211ENST00000460331 KIF21BO75037 1637 aa20.33■□□□□ 0.84
ZNF3-211ENST00000460331 FBLN2P98095 1184 aa20.32■□□□□ 0.84
ZNF3-211ENST00000460331 GOLGA3Q08378 1498 aa20.29■□□□□ 0.84
ZNF3-211ENST00000460331 GRIN2AQ12879 1464 aa20.25■□□□□ 0.83
ZNF3-211ENST00000460331 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
ZNF3-211ENST00000460331 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.24■□□□□ 0.83
ZNF3-211ENST00000460331 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.2■□□□□ 0.82
ZNF3-211ENST00000460331 CHD1O14646 1710 aa20.19■□□□□ 0.82
ZNF3-211ENST00000460331 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.14■□□□□ 0.81
ZNF3-211ENST00000460331 OSCARQ8IYS5 282 aa20.14■□□□□ 0.81
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