RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418756.5

PMS2P3-202, Transcript of PMS1 homolog 2, mismatch repair system component pseudogene 3, humanhuman

TSL 3

Gene PMS2P3, Length 1,490 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3-202ENST00000418756 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.05■■■■■ 6.56
PMS2P3-202ENST00000418756 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.57■■■■■ 5.53
PMS2P3-202ENST00000418756 ABCC9O60706 1549 aa48.38■■■■■ 5.33
PMS2P3-202ENST00000418756 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.91■■■■■ 5.1
PMS2P3-202ENST00000418756 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.74■■■■■ 5.07
PMS2P3-202ENST00000418756 NACADO15069 1562 aa46.56■■■■■ 5.04
PMS2P3-202ENST00000418756 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.55■■■■■ 5.04
PMS2P3-202ENST00000418756 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.33■■■■■ 5.01
PMS2P3-202ENST00000418756 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.29■■■■■ 5
PMS2P3-202ENST00000418756 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.53■■■■■ 4.88
PMS2P3-202ENST00000418756 SCRIBQ14160 1630 aa45.42■■■■■ 4.86
PMS2P3-202ENST00000418756 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.35■■■■■ 4.85
PMS2P3-202ENST00000418756 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.18■■■■■ 4.82
PMS2P3-202ENST00000418756 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.68■■■■■ 4.74
PMS2P3-202ENST00000418756 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.16■■■■■ 4.66
PMS2P3-202ENST00000418756 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.95■■■■■ 4.63
PMS2P3-202ENST00000418756 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.72■■■■■ 4.59
PMS2P3-202ENST00000418756 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.71■■■■■ 4.59
PMS2P3-202ENST00000418756 SMARCA4P51532 1647 aa43.41■■■■■ 4.54
PMS2P3-202ENST00000418756 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.39■■■■■ 4.54
PMS2P3-202ENST00000418756 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.25■■■■■ 4.51
PMS2P3-202ENST00000418756 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.11■■■■■ 4.49
PMS2P3-202ENST00000418756 SMARCA2P51531 1590 aa43.02■■■■■ 4.48
PMS2P3-202ENST00000418756 NCAPD3P42695 1498 aa43■■■■■ 4.47
PMS2P3-202ENST00000418756 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.91■■■■■ 4.46
PMS2P3-202ENST00000418756 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.88■■■■■ 4.45
PMS2P3-202ENST00000418756 WIZO95785 1651 aa42.81■■■■■ 4.44
PMS2P3-202ENST00000418756 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.78■■■■■ 4.44
PMS2P3-202ENST00000418756 HMGXB3Q12766 1538 aa42.78■■■■■ 4.44
PMS2P3-202ENST00000418756 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.31■■■■■ 4.36
PMS2P3-202ENST00000418756 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.21■■■■■ 4.35
PMS2P3-202ENST00000418756 NESP48681 1621 aa41.98■■■■■ 4.31
PMS2P3-202ENST00000418756 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.88■■■■■ 4.29
PMS2P3-202ENST00000418756 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.8■■■■■ 4.28
PMS2P3-202ENST00000418756 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.78■■■■■ 4.28
PMS2P3-202ENST00000418756 ERCC6Q03468 1493 aa41.63■■■■■ 4.25
PMS2P3-202ENST00000418756 CFTRP13569 1480 aa41.6■■■■■ 4.25
PMS2P3-202ENST00000418756 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.53■■■■■ 4.24
PMS2P3-202ENST00000418756 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.41■■■■■ 4.22
PMS2P3-202ENST00000418756 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.34■■■■■ 4.21
PMS2P3-202ENST00000418756 PRDM2Q13029 1718 aa41.24■■■■■ 4.19
PMS2P3-202ENST00000418756 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.23■■■■■ 4.19
PMS2P3-202ENST00000418756 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
PMS2P3-202ENST00000418756 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.09■■■■■ 4.17
PMS2P3-202ENST00000418756 CUX2O14529 1486 aa40.97■■■■■ 4.15
PMS2P3-202ENST00000418756 WDR62O43379 1518 aa40.91■■■■■ 4.14
PMS2P3-202ENST00000418756 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
PMS2P3-202ENST00000418756 TOPBP1Q92547 1522 aa40.7■■■■■ 4.11
PMS2P3-202ENST00000418756 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.65■■■■■ 4.1
PMS2P3-202ENST00000418756 ABCC8Q09428 1581 aa40.63■■■■■ 4.1
PMS2P3-202ENST00000418756 CUX1P39880 1505 aa40.54■■■■■ 4.08
PMS2P3-202ENST00000418756 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.41■■■■■ 4.06
PMS2P3-202ENST00000418756 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
PMS2P3-202ENST00000418756 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.36■■■■■ 4.05
PMS2P3-202ENST00000418756 IFT140Q96RY7 1462 aa40.33■■■■■ 4.05
PMS2P3-202ENST00000418756 SYNJ1O43426 1573 aa40.3■■■■■ 4.04
PMS2P3-202ENST00000418756 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.27■■■■■ 4.04
PMS2P3-202ENST00000418756 SOGA1O94964 1423 aa40.26■■■■■ 4.03
PMS2P3-202ENST00000418756 TOP2BQ02880 1626 aa40.23■■■■■ 4.03
PMS2P3-202ENST00000418756 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.21■■■■■ 4.03
PMS2P3-202ENST00000418756 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.21■■■■■ 4.03
PMS2P3-202ENST00000418756 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.2■■■■■ 4.03
PMS2P3-202ENST00000418756 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.04■■■■■ 41e-6■■■■■ 43.9
PMS2P3-202ENST00000418756 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.04■■■■■ 4
PMS2P3-202ENST00000418756 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
PMS2P3-202ENST00000418756 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.93■■■■□ 3.98
PMS2P3-202ENST00000418756 WDR97A6NE52 1622 aa39.93■■■■□ 3.98
PMS2P3-202ENST00000418756 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.81■■■■□ 3.96
PMS2P3-202ENST00000418756 TRIM41Q8WV44 630 aa39.78■■■■□ 3.96
PMS2P3-202ENST00000418756 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.77■■■■□ 3.96
PMS2P3-202ENST00000418756 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.73■■■■□ 3.95
PMS2P3-202ENST00000418756 GRIN2BQ13224 1484 aa39.7■■■■□ 3.95
PMS2P3-202ENST00000418756 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.63■■■■□ 3.93
PMS2P3-202ENST00000418756 PBRM1Q86U86 1689 aa39.62■■■■□ 3.93
PMS2P3-202ENST00000418756 FBLN2P98095 1184 aa39.56■■■■□ 3.92
PMS2P3-202ENST00000418756 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.54■■■■□ 3.92
PMS2P3-202ENST00000418756 KIF27Q86VH2 1401 aa39.52■■■■□ 3.92
PMS2P3-202ENST00000418756 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.52■■■■□ 3.92
PMS2P3-202ENST00000418756 OSCARQ8IYS5 282 aa39.45■■■■□ 3.91
PMS2P3-202ENST00000418756 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.44■■■■□ 3.9
PMS2P3-202ENST00000418756 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.44■■■■□ 3.9
PMS2P3-202ENST00000418756 CHD1O14646 1710 aa39.43■■■■□ 3.9
PMS2P3-202ENST00000418756 SYNJ2O15056 1496 aa39.39■■■■□ 3.9
PMS2P3-202ENST00000418756 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.38■■■■□ 3.89
PMS2P3-202ENST00000418756 IGF1RP08069 1367 aa39.36■■■■□ 3.89
PMS2P3-202ENST00000418756 ADAMTS12P58397 1594 aa39.33■■■■□ 3.89
PMS2P3-202ENST00000418756 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.31■■■■□ 3.88
PMS2P3-202ENST00000418756 GRIN2AQ12879 1464 aa39.19■■■■□ 3.86
PMS2P3-202ENST00000418756 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.13■■■■□ 3.85
PMS2P3-202ENST00000418756 CUL7Q14999 1698 aa39.13■■■■□ 3.85
PMS2P3-202ENST00000418756 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.05■■■■□ 3.84
PMS2P3-202ENST00000418756 CEP170Q5SW79 1584 aa39■■■■□ 3.83
PMS2P3-202ENST00000418756 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.98■■■■□ 3.83
PMS2P3-202ENST00000418756 NUP160Q12769 1436 aa38.98■■■■□ 3.83
PMS2P3-202ENST00000418756 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.97■■■■□ 3.83
PMS2P3-202ENST00000418756 EEA1Q15075 1411 aa38.93■■■■□ 3.82
PMS2P3-202ENST00000418756 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.9■■■■□ 3.82
PMS2P3-202ENST00000418756 PRXQ9BXM0 1461 aa38.84■■■■□ 3.81
PMS2P3-202ENST00000418756 ARHGEF11O15085 1522 aa38.77■■■■□ 3.8
PMS2P3-202ENST00000418756 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.74■■■■□ 3.79
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