Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.012e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-246ENST00000637291 2662 ntTSL 514.8□□□□□ -0.042e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-229ENST00000636070 1827 ntTSL 214.71□□□□□ -0.062e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-257ENST00000638092 2448 ntTSL 514.58□□□□□ -0.072e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.082e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-241ENST00000636978 1613 ntTSL 514.22□□□□□ -0.132e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.162e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.172e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-237ENST00000636725 2677 ntTSL 513.98□□□□□ -0.172e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.182e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-242ENST00000636991 2403 ntTSL 513.82□□□□□ -0.22e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.22e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.212e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-205ENST00000430521 798 ntTSL 513.73□□□□□ -0.212e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-214ENST00000478594 2110 ntTSL 513.72□□□□□ -0.212e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-203ENST00000399379 977 ntTSL 513.68□□□□□ -0.222e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-215ENST00000480957 3243 ntTSL 413.3□□□□□ -0.282e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.292e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.32e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-228ENST00000636023 1780 ntTSL 512.95□□□□□ -0.342e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AC104452.1-209ENST00000485108 596 ntTSL 512.94□□□□□ -0.342e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-220ENST00000498571 619 ntTSL 212.94□□□□□ -0.342e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AC104452.1-202ENST00000636204 3240 ntTSL 512.87□□□□□ -0.352e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-218ENST00000493046 3504 ntTSL 512.71□□□□□ -0.372e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.382e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-217ENST00000491800 3780 nt12.57□□□□□ -0.42e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-245ENST00000637268 2855 ntTSL 512.44□□□□□ -0.422e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-208ENST00000462048 546 ntTSL 411.62□□□□□ -0.552e-6■□□□□ 9.9
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SF3B4Q15427 AMT-219ENST00000495436 843 ntTSL 211.51□□□□□ -0.572e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-216ENST00000487589 811 ntTSL 511.44□□□□□ -0.582e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-210ENST00000473163 4544 ntTSL 211.21□□□□□ -0.622e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AC104452.1-204ENST00000637442 4178 ntTSL 511.14□□□□□ -0.632e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-230ENST00000636148 3865 ntTSL 59.96□□□□□ -0.822e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-236ENST00000636597 1509 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.872e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AMT-209ENST00000465925 3976 ntTSL 58.72□□□□□ -1.012e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 OGFOD2-213ENST00000540324 1828 ntTSL 1 (best)17.44■□□□□ 0.382e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.322e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.282e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.212e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.212e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.12e-6■□□□□ 9.9
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SF3B4Q15427 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.325e-7■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 UCHL5-211ENST00000443327 785 ntTSL 54.09□□□□□ -1.755e-7■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 PDCD2-201ENST00000167218 1118 ntTSL 525.46■■□□□ 1.673e-8■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 PDCD2-211ENST00000544336 1164 ntTSL 1 (best)25.09■■□□□ 1.613e-8■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.613e-8■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.43e-8■□□□□ 9.9
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SF3B4Q15427 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.613e-8■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.573e-8■□□□□ 9.9
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SF3B4Q15427 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.453e-8■□□□□ 9.9
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SF3B4Q15427 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.293e-8■□□□□ 9.9
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SF3B4Q15427 ADPGK-206ENST00000563907 1041 ntTSL 315.32■□□□□ 0.043e-8■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 PDCD2-213ENST00000544866 710 ntTSL 515.16■□□□□ 0.023e-8■□□□□ 9.9
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SF3B4Q15427 PSMD11-208ENST00000579451 582 ntTSL 213.89□□□□□ -0.193e-8■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 ADPGK-209ENST00000567733 525 ntTSL 513.06□□□□□ -0.323e-8■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 KANSL1-221ENST00000638902 1971 ntTSL 212.71□□□□□ -0.373e-8■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.523e-8■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 ADPGK-202ENST00000456471 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.543e-8■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 RBM33-204ENST00000392755 552 ntAPPRIS ALT2 TSL 411.53□□□□□ -0.563e-8■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 KANSL1-217ENST00000638269 3365 ntTSL 510.6□□□□□ -0.713e-8■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 ADPGK-214ENST00000569693 1820 ntTSL 1 (best)10.49□□□□□ -0.733e-8■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 RNF10-225ENST00000551139 583 ntTSL 39.21□□□□□ -0.943e-8■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 PNISR-207ENST00000478777 2422 ntTSL 28.63□□□□□ -1.033e-8■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 ADPGK-204ENST00000562621 4576 ntTSL 1 (best)8.05□□□□□ -1.123e-8■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 PDCD2-206ENST00000538195 560 ntTSL 56.43□□□□□ -1.383e-8■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 SUZ12-203ENST00000578106 1367 ntTSL 25.57□□□□□ -1.523e-8■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 RNF10-210ENST00000537997 583 ntTSL 45.45□□□□□ -1.543e-8■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 ZCCHC11-212ENST00000481133 521 ntTSL 34.08□□□□□ -1.763e-8■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 PPIG-210ENST00000482772 982 ntTSL 53.59□□□□□ -1.833e-8■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 PNISR-204ENST00000463021 1939 ntTSL 1 (best)3.54□□□□□ -1.843e-8■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 USP42-202ENST00000404008 1380 ntTSL 226.35■■□□□ 1.814e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 USP42-204ENST00000451154 520 ntTSL 524.74■■□□□ 1.554e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 USP42-205ENST00000465073 1490 ntTSL 520.88■□□□□ 0.934e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 USP42-207ENST00000521713 5017 ntTSL 515.28■□□□□ 0.044e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.034e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 IDH3G-209ENST00000491235 589 ntTSL 314.71□□□□□ -0.052e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 USP42-206ENST00000479544 4286 ntTSL 1 (best)13.26□□□□□ -0.294e-6■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AEN-204ENST00000558327 883 ntTSL 223.26■■□□□ 1.315e-7■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.165e-7■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AEN-205ENST00000559528 895 ntTSL 221.79■■□□□ 1.085e-7■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 AEN-206ENST00000560174 461 ntTSL 321.51■■□□□ 1.035e-7■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.795e-7■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 PSMG1-203ENST00000411828 959 ntTSL 318.02■□□□□ 0.485e-7■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.455e-7■□□□□ 9.9
SF3B4Q15427 PSMG1-204ENST00000431628 760 ntTSL 1 (best)15.66■□□□□ 0.15e-7■□□□□ 9.9
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