RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465073.6

USP42-205, Transcript of ubiquitin specific peptidase 42, humanhuman

TSL 5

Gene USP42, Length 1,490 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP42-205ENST00000465073 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.99■■■■■ 6.71
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USP42-205ENST00000465073 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.65■■■■■ 5.38
USP42-205ENST00000465073 NACADO15069 1562 aa48.35■■■■■ 5.33
USP42-205ENST00000465073 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.14■■■■■ 5.3
USP42-205ENST00000465073 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.95■■■■■ 5.27
USP42-205ENST00000465073 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.72■■■■■ 5.23
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USP42-205ENST00000465073 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.21■■■■■ 5.15
USP42-205ENST00000465073 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.19■■■■■ 5.15
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USP42-205ENST00000465073 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.65■■■■■ 5.06
USP42-205ENST00000465073 SCRIBQ14160 1630 aa46.52■■■■■ 5.04
USP42-205ENST00000465073 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.13■■■■■ 4.97
USP42-205ENST00000465073 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.05■■■■■ 4.96
USP42-205ENST00000465073 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.05■■■■■ 4.96
USP42-205ENST00000465073 NCAPD3P42695 1498 aa44.66■■■■■ 4.74
USP42-205ENST00000465073 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.5■■■■■ 4.71
USP42-205ENST00000465073 SMARCA4P51532 1647 aa44.4■■■■■ 4.7
USP42-205ENST00000465073 SMARCA2P51531 1590 aa44.38■■■■■ 4.69
USP42-205ENST00000465073 HMGXB3Q12766 1538 aa44.28■■■■■ 4.68
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USP42-205ENST00000465073 ERCC6Q03468 1493 aa44.14■■■■■ 4.66
USP42-205ENST00000465073 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.07■■■■■ 4.65
USP42-205ENST00000465073 CUX2O14529 1486 aa44.06■■■■■ 4.64
USP42-205ENST00000465073 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.06■■■■■ 4.64
USP42-205ENST00000465073 PEG3Q9GZU2 1588 aa44■■■■■ 4.63
USP42-205ENST00000465073 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.89■■■■■ 4.62
USP42-205ENST00000465073 NESP48681 1621 aa43.87■■■■■ 4.61
USP42-205ENST00000465073 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.6■■■■■ 4.57
USP42-205ENST00000465073 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.41■■■■■ 4.54
USP42-205ENST00000465073 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.4■■■■■ 4.54
USP42-205ENST00000465073 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.32■■■■■ 4.52
USP42-205ENST00000465073 WIZO95785 1651 aa43.31■■■■■ 4.52
USP42-205ENST00000465073 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.24■■■■■ 4.51
USP42-205ENST00000465073 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.03■■■■■ 4.48
USP42-205ENST00000465073 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.99■■■■■ 4.47
USP42-205ENST00000465073 WDR62O43379 1518 aa42.86■■■■■ 4.45
USP42-205ENST00000465073 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.82■■■■■ 4.45
USP42-205ENST00000465073 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.81■■■■■ 4.44
USP42-205ENST00000465073 CFTRP13569 1480 aa42.8■■■■■ 4.44
USP42-205ENST00000465073 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.78■■■■■ 4.44
USP42-205ENST00000465073 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.41■■■■■ 4.38
USP42-205ENST00000465073 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.36■■■■■ 4.37
USP42-205ENST00000465073 PRDM2Q13029 1718 aa42.23■■■■■ 4.35
USP42-205ENST00000465073 OSCARQ8IYS5 282 aa42.12■■■■■ 4.33
USP42-205ENST00000465073 TRIM41Q8WV44 630 aa42.1■■■■■ 4.33
USP42-205ENST00000465073 IFT140Q96RY7 1462 aa41.99■■■■■ 4.31
USP42-205ENST00000465073 TOPBP1Q92547 1522 aa41.97■■■■■ 4.31
USP42-205ENST00000465073 ABCC8Q09428 1581 aa41.94■■■■■ 4.3
USP42-205ENST00000465073 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.87■■■■■ 4.29
USP42-205ENST00000465073 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.8■■■■■ 4.28
USP42-205ENST00000465073 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.6■■■■■ 4.25
USP42-205ENST00000465073 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
USP42-205ENST00000465073 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.53■■■■■ 4.243e-6■■■□□ 17.1
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USP42-205ENST00000465073 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.43■■■■■ 4.22
USP42-205ENST00000465073 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.43■■■■■ 4.22
USP42-205ENST00000465073 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.43■■■■■ 4.22
USP42-205ENST00000465073 SOGA1O94964 1423 aa41.39■■■■■ 4.22
USP42-205ENST00000465073 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.37■■■■■ 4.21
USP42-205ENST00000465073 ARHGEF11O15085 1522 aa41.35■■■■■ 4.21
USP42-205ENST00000465073 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
USP42-205ENST00000465073 FBLN2P98095 1184 aa41.29■■■■■ 4.2
USP42-205ENST00000465073 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.27■■■■■ 4.2
USP42-205ENST00000465073 CHD1O14646 1710 aa41.25■■■■■ 4.19
USP42-205ENST00000465073 CUX1P39880 1505 aa41.23■■■■■ 4.19
USP42-205ENST00000465073 WDR97A6NE52 1622 aa41.18■■■■■ 4.18
USP42-205ENST00000465073 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
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USP42-205ENST00000465073 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.08■■■■■ 4.17
USP42-205ENST00000465073 GRIN2BQ13224 1484 aa41.02■■■■■ 4.16
USP42-205ENST00000465073 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
USP42-205ENST00000465073 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.16
USP42-205ENST00000465073 ARAP1Q96P48 1450 aa40.94■■■■■ 4.14
USP42-205ENST00000465073 SYNJ2O15056 1496 aa40.87■■■■■ 4.13
USP42-205ENST00000465073 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.87■■■■■ 4.13
USP42-205ENST00000465073 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.85■■■■■ 4.13
USP42-205ENST00000465073 SYNJ1O43426 1573 aa40.84■■■■■ 4.13
USP42-205ENST00000465073 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.83■■■■■ 4.13
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USP42-205ENST00000465073 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.71■■■■■ 4.11
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USP42-205ENST00000465073 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
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USP42-205ENST00000465073 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.54■■■■■ 4.08
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USP42-205ENST00000465073 ADAMTS12P58397 1594 aa40.4■■■■■ 4.06
USP42-205ENST00000465073 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.37■■■■■ 4.05
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USP42-205ENST00000465073 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.32■■■■■ 4.05
USP42-205ENST00000465073 CEP170Q5SW79 1584 aa40.28■■■■■ 4.04
USP42-205ENST00000465073 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.19■■■■■ 4.02
USP42-205ENST00000465073 SHROOM2Q13796 1616 aa40.11■■■■■ 4.01
USP42-205ENST00000465073 JPH4Q96JJ6 628 aa39.99■■■■□ 3.99
USP42-205ENST00000465073 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.97■■■■□ 3.99
USP42-205ENST00000465073 IGF1RP08069 1367 aa39.85■■■■□ 3.97
USP42-205ENST00000465073 KIF27Q86VH2 1401 aa39.85■■■■□ 3.97
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