Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 CANX-213ENST00000507307 582 ntTSL 520.47■□□□□ 0.873e-8■■■■■ 42.1
UTP3Q9NQZ2 CANX-217ENST00000513246 727 ntTSL 519.27■□□□□ 0.683e-8■■■■■ 42.1
UTP3Q9NQZ2 KLHDC10-202ENST00000463413 503 ntTSL 227.26■■□□□ 1.952e-6■■■■■ 42.1
UTP3Q9NQZ2 RAB6A-206ENST00000540771 699 ntTSL 523.94■■□□□ 1.424e-7■■■■■ 42.1
UTP3Q9NQZ2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.334e-7■■■■■ 42.1
UTP3Q9NQZ2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.674e-7■■■■■ 42.1
UTP3Q9NQZ2 RAB6A-201ENST00000310653 3389 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.064e-7■■■■■ 42.1
UTP3Q9NQZ2 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.274e-7■■■■■ 42.1
UTP3Q9NQZ2 DNAJC8-204ENST00000488868 786 ntTSL 414.87□□□□□ -0.036e-9■■■■■ 42.1
UTP3Q9NQZ2 DNAJC8-203ENST00000482674 721 ntTSL 212.92□□□□□ -0.346e-9■■■■■ 42.1
UTP3Q9NQZ2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.748e-8■■■■■ 42
UTP3Q9NQZ2 DDX5-205ENST00000577922 996 ntTSL 521.45■■□□□ 1.022e-6■■■■■ 42
UTP3Q9NQZ2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 42
UTP3Q9NQZ2 DDX5-220ENST00000581806 576 ntTSL 417.43■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 42
UTP3Q9NQZ2 DDX5-219ENST00000581697 580 ntTSL 516.32■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 42
UTP3Q9NQZ2 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 42
UTP3Q9NQZ2 DDX5-207ENST00000578400 575 ntTSL 514.83□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 42
UTP3Q9NQZ2 DDX5-218ENST00000581693 2156 ntTSL 512.59□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 42
UTP3Q9NQZ2 DDX5-203ENST00000540698 2225 ntTSL 512.27□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 42
UTP3Q9NQZ2 DDX5-202ENST00000450599 2077 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 42
UTP3Q9NQZ2 DDX5-231ENST00000585060 572 ntTSL 49.95□□□□□ -0.822e-6■■■■■ 42
UTP3Q9NQZ2 DDX5-215ENST00000581230 3558 ntTSL 28.54□□□□□ -1.042e-6■■■■■ 42
UTP3Q9NQZ2 NUP214-204ENST00000453861 3208 ntTSL 510.82□□□□□ -0.681e-7■■■■■ 42
UTP3Q9NQZ2 NUP214-208ENST00000483497 3275 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.021e-7■■■■■ 42
UTP3Q9NQZ2 SACM1L-208ENST00000463237 962 ntTSL 225.74■■□□□ 1.712e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 SACM1L-209ENST00000463347 854 ntTSL 223.59■■□□□ 1.372e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 SACM1L-204ENST00000438671 542 ntTSL 423.3■■□□□ 1.322e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 ATG2A-204ENST00000461701 2031 ntTSL 221.08■□□□□ 0.972e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 CDK2AP2-202ENST00000525402 1692 ntTSL 220.09■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 C21orf2-206ENST00000478674 485 ntTSL 318.76■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 SLC25A37-205ENST00000519192 479 ntTSL 218.42■□□□□ 0.541e-10■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 WDR59-214ENST00000568323 558 ntTSL 518.31■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 SACM1L-214ENST00000478586 534 ntTSL 417.42■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 TRAFD1-203ENST00000547063 867 ntTSL 316.97■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 WDR59-211ENST00000564859 488 ntTSL 316.78■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 EIF4G1-234ENST00000478291 564 ntTSL 216.49■□□□□ 0.231e-10■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 CDK2AP2-204ENST00000531178 923 ntTSL 1 (best)16.47■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 IQGAP1-212ENST00000560418 559 ntTSL 515.92■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 EIF4G1-231ENST00000464548 637 ntTSL 513.58□□□□□ -0.241e-10■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 CLCN3-210ENST00000515420 735 ntTSL 313.54□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 41.9
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UTP3Q9NQZ2 TRAFD1-209ENST00000552896 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 312.49□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 ANAPC7-204ENST00000464697 734 ntTSL 312.24□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 WDR59-208ENST00000563111 583 ntTSL 411.95□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 TRAFD1-206ENST00000549358 532 ntAPPRIS ALT2 TSL 411.42□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 EIF4G1-211ENST00000422614 750 ntTSL 511.2□□□□□ -0.621e-10■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 WDR59-204ENST00000562331 570 ntTSL 411.17□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 ANAPC7-212ENST00000552170 579 ntTSL 410.52□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 41.9
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UTP3Q9NQZ2 RAPGEF2-204ENST00000504604 693 ntTSL 510.2□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 TTC3-205ENST00000411496 893 ntTSL 39.67□□□□□ -0.862e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 SAMD4B-211ENST00000601613 2690 nt9.04□□□□□ -0.962e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 SACM1L-206ENST00000445499 583 ntTSL 48.68□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 CLCN3-202ENST00000360642 3208 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.042e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 CLCN3-206ENST00000507875 2485 ntTSL 28.56□□□□□ -1.042e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 41.9
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UTP3Q9NQZ2 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.172e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 SACM1L-212ENST00000464524 571 ntTSL 47.67□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 41.9
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UTP3Q9NQZ2 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.342e-6■■■■■ 41.9
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UTP3Q9NQZ2 TTC3-214ENST00000472398 2305 ntTSL 1 (best)4.18□□□□□ -1.742e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.752e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.58■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 MOB1B-205ENST00000511449 627 ntTSL 317.87■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.341e-6■■■■■ 41.9
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UTP3Q9NQZ2 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.096e-8■■■■■ 41.9
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UTP3Q9NQZ2 UBE2A-201ENST00000346330 718 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.546e-8■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 UBE2A-209ENST00000629303 557 ntTSL 411.36□□□□□ -0.596e-8■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 ATN1-202ENST00000396684 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.322e-9■■■■■ 41.9
UTP3Q9NQZ2 LSS-210ENST00000491729 2143 ntTSL 213.96□□□□□ -0.185e-7■■■■■ 41.8
UTP3Q9NQZ2 LSS-208ENST00000474319 3601 ntTSL 211.92□□□□□ -0.55e-7■■■■■ 41.8
UTP3Q9NQZ2 LSS-203ENST00000419093 517 ntTSL 310.57□□□□□ -0.725e-7■■■■■ 41.8
UTP3Q9NQZ2 UFD1-209ENST00000489406 994 ntTSL 215.92■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 41.8
UTP3Q9NQZ2 UBAC1-202ENST00000465873 882 ntTSL 217.26■□□□□ 0.352e-9■■■■■ 41.8
UTP3Q9NQZ2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.121e-6■■■■■ 41.8
UTP3Q9NQZ2 APLP2-219ENST00000533616 2041 ntTSL 220.5■□□□□ 0.871e-6■■■■■ 41.8
UTP3Q9NQZ2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.851e-6■■■■■ 41.8
UTP3Q9NQZ2 KIF14-201ENST00000367350 7274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 41.7
UTP3Q9NQZ2 LMNA-222ENST00000508500 848 ntTSL 1 (best)17.23■□□□□ 0.354e-7■■■■■ 41.7
UTP3Q9NQZ2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.281e-6■■■■■ 41.7
UTP3Q9NQZ2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.871e-6■■■■■ 41.7
UTP3Q9NQZ2 PLPPR3-203ENST00000519502 782 ntTSL 226.4■■□□□ 1.821e-6■■■■■ 41.7
UTP3Q9NQZ2 SYNJ1-205ENST00000429236 2212 ntTSL 1 (best)21.39■■□□□ 1.015e-6■■■■■ 41.7
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