RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463237.5

SACM1L-208, Transcript of SAC1 like phosphatidylinositide phosphatase, human

TSL 2

Gene SACM1L, Length 962 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SACM1L-208	ENST00000463237	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		57.6	■■■■■ 6.81
SACM1L-208	ENST00000463237	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		51.06	■■■■■ 5.76
SACM1L-208	ENST00000463237	ABCC9	O60706	1549 aa		49.11	■■■■■ 5.45
SACM1L-208	ENST00000463237	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	48.18	■■■■■ 5.3
SACM1L-208	ENST00000463237	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		47.76	■■■■■ 5.24
SACM1L-208	ENST00000463237	NACAD	O15069	1562 aa		47.74	■■■■■ 5.23
SACM1L-208	ENST00000463237	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		47.72	■■■■■ 5.23
SACM1L-208	ENST00000463237	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		47.62	■■■■■ 5.21
SACM1L-208	ENST00000463237	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		47.47	■■■■■ 5.19
SACM1L-208	ENST00000463237	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		46.76	■■■■■ 5.08
SACM1L-208	ENST00000463237	SCRIB	Q14160	1630 aa		46.53	■■■■■ 5.04
SACM1L-208	ENST00000463237	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		46.26	■■■■■ 5
SACM1L-208	ENST00000463237	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	45.88	■■■■■ 4.94
SACM1L-208	ENST00000463237	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		45.8	■■■■■ 4.92
SACM1L-208	ENST00000463237	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	44.9	■■■■■ 4.78
SACM1L-208	ENST00000463237	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		44.78	■■■■■ 4.76
SACM1L-208	ENST00000463237	SMARCA4	P51532	1647 aa		44.62	■■■■■ 4.73
SACM1L-208	ENST00000463237	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	44.6	■■■■■ 4.73
SACM1L-208	ENST00000463237	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		44.56	■■■■■ 4.72
SACM1L-208	ENST00000463237	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		44.45	■■■■■ 4.71
SACM1L-208	ENST00000463237	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		44.41	■■■■■ 4.7
SACM1L-208	ENST00000463237	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		44.22	■■■■■ 4.67
SACM1L-208	ENST00000463237	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		44.13	■■■■■ 4.65
SACM1L-208	ENST00000463237	SMARCA2	P51531	1590 aa		44.13	■■■■■ 4.65
SACM1L-208	ENST00000463237	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	44.08	■■■■■ 4.65
SACM1L-208	ENST00000463237	NCAPD3	P42695	1498 aa		44	■■■■■ 4.63
SACM1L-208	ENST00000463237	WIZ	O95785	1651 aa		44	■■■■■ 4.63
SACM1L-208	ENST00000463237	HMGXB3	Q12766	1538 aa		43.94	■■■■■ 4.62
SACM1L-208	ENST00000463237	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	43.76	■■■■■ 4.6
SACM1L-208	ENST00000463237	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	43.58	■■■■■ 4.57
SACM1L-208	ENST00000463237	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	43.22	■■■■■ 4.51
SACM1L-208	ENST00000463237	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		42.97	■■■■■ 4.47
SACM1L-208	ENST00000463237	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		42.79	■■■■■ 4.44
SACM1L-208	ENST00000463237	NES	P48681	1621 aa		42.75	■■■■■ 4.43
SACM1L-208	ENST00000463237	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		42.68	■■■■■ 4.42
SACM1L-208	ENST00000463237	CFTR	P13569	1480 aa		42.64	■■■■■ 4.42
SACM1L-208	ENST00000463237	PRDM2	Q13029	1718 aa		42.61	■■■■■ 4.41
SACM1L-208	ENST00000463237	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		42.39	■■■■■ 4.38
SACM1L-208	ENST00000463237	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		42.34	■■■■■ 4.37
SACM1L-208	ENST00000463237	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		42.23	■■■■■ 4.35
SACM1L-208	ENST00000463237	ERCC6	Q03468	1493 aa		42.23	■■■■■ 4.35
SACM1L-208	ENST00000463237	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		42.13	■■■■■ 4.34
SACM1L-208	ENST00000463237	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	42.1	■■■■■ 4.33
SACM1L-208	ENST00000463237	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		41.96	■■■■■ 4.31
SACM1L-208	ENST00000463237	WDR62	O43379	1518 aa		41.86	■■■■■ 4.29
SACM1L-208	ENST00000463237	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	41.84	■■■■■ 4.29
SACM1L-208	ENST00000463237	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		41.73	■■■■■ 4.27
SACM1L-208	ENST00000463237	TOPBP1	Q92547	1522 aa		41.69	■■■■■ 4.26
SACM1L-208	ENST00000463237	CUX2	O14529	1486 aa		41.66	■■■■■ 4.26
SACM1L-208	ENST00000463237	ABCC8	Q09428	1581 aa		41.66	■■■■■ 4.26
SACM1L-208	ENST00000463237	CUX1	P39880	1505 aa		41.64	■■■■■ 4.26
SACM1L-208	ENST00000463237	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		41.53	■■■■■ 4.24
SACM1L-208	ENST00000463237	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	41.52	■■■■■ 4.24
SACM1L-208	ENST00000463237	SYNJ1	O43426	1573 aa		41.5	■■■■■ 4.23
SACM1L-208	ENST00000463237	TOP2B	Q02880	1626 aa		41.47	■■■■■ 4.23
SACM1L-208	ENST00000463237	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	41.36	■■■■■ 4.21
SACM1L-208	ENST00000463237	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		41.34	■■■■■ 4.21
SACM1L-208	ENST00000463237	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	41.26	■■■■■ 4.19
SACM1L-208	ENST00000463237	IFT140	Q96RY7	1462 aa		41.22	■■■■■ 4.19
SACM1L-208	ENST00000463237	WDR97	A6NE52	1622 aa		41.18	■■■■■ 4.18
SACM1L-208	ENST00000463237	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		41.13	■■■■■ 4.17
SACM1L-208	ENST00000463237	SOGA1	O94964	1423 aa		41.1	■■■■■ 4.17
SACM1L-208	ENST00000463237	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		41.02	■■■■■ 4.16
SACM1L-208	ENST00000463237	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	40.99	■■■■■ 4.15
SACM1L-208	ENST00000463237	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	40.95	■■■■■ 4.15
SACM1L-208	ENST00000463237	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		40.88	■■■■■ 4.13
SACM1L-208	ENST00000463237	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		40.83	■■■■■ 4.13
SACM1L-208	ENST00000463237	TRIM41	Q8WV44	630 aa		40.79	■■■■■ 4.12
SACM1L-208	ENST00000463237	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	40.77	■■■■■ 4.12
SACM1L-208	ENST00000463237	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	40.76	■■■■■ 4.12
SACM1L-208	ENST00000463237	PBRM1	Q86U86	1689 aa		40.75	■■■■■ 4.11
SACM1L-208	ENST00000463237	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		40.69	■■■■■ 4.1
SACM1L-208	ENST00000463237	GRIN2B	Q13224	1484 aa		40.6	■■■■■ 4.09
SACM1L-208	ENST00000463237	KIF27	Q86VH2	1401 aa		40.56	■■■■■ 4.08
SACM1L-208	ENST00000463237	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		40.54	■■■■■ 4.08
SACM1L-208	ENST00000463237	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		40.48	■■■■■ 4.07
SACM1L-208	ENST00000463237	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	40.47	■■■■■ 4.07
SACM1L-208	ENST00000463237	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		40.46	■■■■■ 4.07
SACM1L-208	ENST00000463237	ADAMTS12	P58397	1594 aa		40.42	■■■■■ 4.06
SACM1L-208	ENST00000463237	CHD1	O14646	1710 aa		40.36	■■■■■ 4.05
SACM1L-208	ENST00000463237	CUL7	Q14999	1698 aa		40.34	■■■■■ 4.05
SACM1L-208	ENST00000463237	IGF1R	P08069	1367 aa		40.33	■■■■■ 4.05
SACM1L-208	ENST00000463237	SYNJ2	O15056	1496 aa		40.28	■■■■■ 4.04
SACM1L-208	ENST00000463237	EEA1	Q15075	1411 aa		40.26	■■■■■ 4.04
SACM1L-208	ENST00000463237	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		40.25	■■■■■ 4.03
SACM1L-208	ENST00000463237	GRIN2A	Q12879	1464 aa		40.11	■■■■■ 4.01
SACM1L-208	ENST00000463237	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		40.08	■■■■■ 4.01
SACM1L-208	ENST00000463237	PRX	Q9BXM0	1461 aa		40.05	■■■■■ 4
SACM1L-208	ENST00000463237	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	40.02	■■■■■ 4
SACM1L-208	ENST00000463237	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		39.99	■■■■□ 3.99
SACM1L-208	ENST00000463237	FBLN2	P98095	1184 aa		39.97	■■■■□ 3.99
SACM1L-208	ENST00000463237	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		39.96	■■■■□ 3.99
SACM1L-208	ENST00000463237	CEP170	Q5SW79	1584 aa		39.96	■■■■□ 3.99
SACM1L-208	ENST00000463237	NUP160	Q12769	1436 aa		39.94	■■■■□ 3.98
SACM1L-208	ENST00000463237	KIF21B	O75037	1637 aa		39.91	■■■■□ 3.98
SACM1L-208	ENST00000463237	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		39.91	■■■■□ 3.98
SACM1L-208	ENST00000463237	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	39.9	■■■■□ 3.98
SACM1L-208	ENST00000463237	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		39.85	■■■■□ 3.97
SACM1L-208	ENST00000463237	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		39.74	■■■■□ 3.95
SACM1L-208	ENST00000463237	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		39.66	■■■■□ 3.94

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.9 ms