Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 PARP6-207ENST00000565443 2305 ntTSL 211.16□□□□□ -0.621e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 CEPT1-210ENST00000545121 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.631e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 CLCN6-202ENST00000346436 5583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.642e-9■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 CCDC12-203ENST00000446836 412 ntTSL 311.04□□□□□ -0.641e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 CCDC12-204ENST00000460035 572 ntTSL 211.02□□□□□ -0.651e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 CNOT4-203ENST00000361528 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 BAZ2A-216ENST00000551996 849 ntTSL 510.93□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 NSD2-202ENST00000353275 7980 ntTSL 1 (best)10.86□□□□□ -0.671e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 PAPD4-201ENST00000296783 3129 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 USP32-211ENST00000590133 2563 ntTSL 210.61□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 PARP6-223ENST00000616176 2102 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.751e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 HARS-209ENST00000506579 3482 ntTSL 210.34□□□□□ -0.751e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 TTL-201ENST00000233336 14269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.751e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 DDX6-201ENST00000525082 1232 ntTSL 210.33□□□□□ -0.761e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 NASP-206ENST00000453748 2080 ntTSL 210.26□□□□□ -0.773e-8■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 EIF4A1-217ENST00000581384 642 ntTSL 510.24□□□□□ -0.771e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 NSD2-201ENST00000312087 8050 ntTSL 1 (best)10.2□□□□□ -0.781e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 HARS-208ENST00000504366 3494 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.781e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 NASP-202ENST00000351223 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.783e-8■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 PARP6-218ENST00000568360 596 ntTSL 510.12□□□□□ -0.791e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 BRD9-209ENST00000490814 3477 ntTSL 1 (best)10.12□□□□□ -0.791e-14■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 UNC13D-217ENST00000592386 930 ntTSL 59.89□□□□□ -0.831e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 PARP6-203ENST00000413097 2750 ntTSL 29.83□□□□□ -0.841e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 CDK5RAP2-203ENST00000360822 5551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.841e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 CDK5RAP2-216ENST00000483412 6235 ntTSL 1 (best)9.7□□□□□ -0.861e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 ZRANB2-202ENST00000370920 3078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.871e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 CNOT4-212ENST00000541284 3563 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.881e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 NASP-216ENST00000528238 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.51□□□□□ -0.893e-8■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 QKI-208ENST00000537041 583 ntTSL 59.44□□□□□ -0.91e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 TARDBP-227ENST00000622057 706 ntTSL 59.28□□□□□ -0.922e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 TTL-203ENST00000476615 725 ntTSL 39.13□□□□□ -0.951e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 PARP6-201ENST00000260376 2142 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.961e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 NSD2-219ENST00000508803 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.981e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 QKI-209ENST00000537124 551 ntTSL 58.77□□□□□ -1.011e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 QKI-210ENST00000537883 1106 ntTSL 38.74□□□□□ -1.011e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 PAPD4-202ENST00000423041 3223 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.021e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 PAPD4-204ENST00000453514 3523 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.021e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 CDK5RAP2-204ENST00000416449 3902 ntTSL 58.65□□□□□ -1.021e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 BAZ2A-205ENST00000547650 614 ntTSL 38.52□□□□□ -1.051e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 NASP-201ENST00000350030 3207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.053e-8■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 NASP-224ENST00000537798 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.063e-8■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 NASP-203ENST00000372052 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.143e-8■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 TARDBP-205ENST00000473118 701 ntTSL 37.85□□□□□ -1.152e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 CDK5RAP2-209ENST00000473282 5956 ntTSL 1 (best)7.85□□□□□ -1.151e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 PAPD4-206ENST00000503620 582 ntTSL 37.64□□□□□ -1.191e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 CNOT4-201ENST00000315544 3783 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.191e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 CNOT4-207ENST00000451834 3507 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.211e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 DDX6-204ENST00000531971 4373 ntTSL 37.52□□□□□ -1.211e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.221e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 PKM-225ENST00000570166 626 ntTSL 27.22□□□□□ -1.252e-8■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.321e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 NSD2-211ENST00000502425 421 ntTSL 36.49□□□□□ -1.371e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 BRD9-211ENST00000494422 449 ntTSL 36.47□□□□□ -1.371e-14■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.41e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.421e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 XPO1-212ENST00000457483 488 ntTSL 46.17□□□□□ -1.424e-18■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.431e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 MSI2-219ENST00000584476 465 ntTSL 35.95□□□□□ -1.461e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 MLH1-215ENST00000458009 660 ntTSL 1 (best)5.9□□□□□ -1.461e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 MLH1-209ENST00000447829 608 ntTSL 1 (best)5.9□□□□□ -1.461e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 PTH2R-202ENST00000419079 811 ntTSL 25.86□□□□□ -1.471e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 ANAPC5-215ENST00000539612 654 ntTSL 35.82□□□□□ -1.481e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 NKTR-208ENST00000464315 544 ntTSL 35.77□□□□□ -1.491e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 PUM1-220ENST00000529846 683 ntTSL 35.38□□□□□ -1.551e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 PUM1-216ENST00000525997 650 ntTSL 35.33□□□□□ -1.561e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 XPO1-205ENST00000422552 382 ntTSL 55.3□□□□□ -1.562e-9■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 MSI2-214ENST00000581776 493 ntTSL 25.29□□□□□ -1.561e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.571e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.571e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 ANAPC5-217ENST00000541652 753 ntTSL 25.15□□□□□ -1.591e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 CLTC-207ENST00000483176 760 ntTSL 34.88□□□□□ -1.631e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 CEPT1-206ENST00000478042 2175 ntTSL 54.85□□□□□ -1.631e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.71e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 USP15-205ENST00000546694 799 ntTSL 54.43□□□□□ -1.71e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 MSI2-212ENST00000579590 452 ntTSL 54.41□□□□□ -1.71e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 NASP-222ENST00000534101 754 ntTSL 34.18□□□□□ -1.744e-17■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 MSI2-213ENST00000581523 534 ntTSL 24.17□□□□□ -1.741e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.791e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 QKI-216ENST00000545346 457 ntTSL 53.76□□□□□ -1.811e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 NKTR-218ENST00000508351 876 ntTSL 23.74□□□□□ -1.811e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 NKTR-206ENST00000460807 894 ntTSL 23.74□□□□□ -1.811e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 MSI2-211ENST00000579531 472 ntTSL 23.64□□□□□ -1.831e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 MLH1-207ENST00000441265 917 ntTSL 53.52□□□□□ -1.851e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 RAD23B-205ENST00000457811 811 ntTSL 33.49□□□□□ -1.851e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 QKI-214ENST00000544436 495 ntTSL 33.21□□□□□ -1.91e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 PUM1-219ENST00000527498 652 ntTSL 33.18□□□□□ -1.91e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 ATXN2L-206ENST00000561539 509 ntTSL 33.03□□□□□ -1.921e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 XPO1-224ENST00000495003 568 ntTSL 22.89□□□□□ -1.952e-9■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 MSI2-215ENST00000582453 496 ntTSL 32.85□□□□□ -1.951e-8■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 XPO1-204ENST00000420673 682 ntTSL 22.84□□□□□ -1.952e-9■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.961e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 ANAPC5-212ENST00000538223 292 ntTSL 52.77□□□□□ -1.971e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 PAPD4-209ENST00000505571 781 ntTSL 32.56□□□□□ -21e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 EIF3E-217ENST00000523646 544 ntTSL 22.42□□□□□ -2.021e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 EIF3E-214ENST00000522352 611 ntTSL 32.35□□□□□ -2.031e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 SMCHD1-202ENST00000577300 506 ntTSL 32.23□□□□□ -2.051e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 RPL17-214ENST00000582588 401 ntTSL 22.21□□□□□ -2.061e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 RBM39-231ENST00000477334 949 ntTSL 22.2□□□□□ -2.062e-13■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 QKI-215ENST00000544823 597 ntTSL 22.14□□□□□ -2.071e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 GOLGA4-207ENST00000437131 6947 ntTSL 1 (best)2.1□□□□□ -2.079e-7■■■■■ 31.6
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