RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TTL-201ENST00000233336 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
TTL-201ENST00000233336 NEFMP07197 916 aa13.67□□□□□ -0.22
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TTL-201ENST00000233336 MRS2Q9HD23 443 aa13.65□□□□□ -0.22
TTL-201ENST00000233336 TMC1Q8TDI8 760 aa13.64□□□□□ -0.23
TTL-201ENST00000233336 ARID3CA6NKF2 412 aa13.62□□□□□ -0.23
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TTL-201ENST00000233336 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
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TTL-201ENST00000233336 BECN1Q14457 450 aa13.53□□□□□ -0.24
TTL-201ENST00000233336 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
TTL-201ENST00000233336 ERICH6BQ5W0A0 696 aa13.53□□□□□ -0.24
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TTL-201ENST00000233336 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
TTL-201ENST00000233336 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP13.5□□□□□ -0.25
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