Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 NUP214-208ENST00000483497 3275 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.185e-11■■■■□ 22.2
ILF3Q12906 SH3GL3-204ENST00000492099 1170 ntTSL 1 (best)27.01■■□□□ 1.911e-11■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 SH3GL3-205ENST00000563901 1647 ntTSL 1 (best)26.47■■□□□ 1.831e-11■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.671e-11■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 SH3GL3-201ENST00000324537 2012 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.031e-11■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 NUP214-203ENST00000451030 5021 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.716e-7■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 NUP214-201ENST00000359428 7600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.066e-7■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.186e-7■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 MMS19-210ENST00000439048 609 ntTSL 518.21■□□□□ 0.517e-7■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 MMS19-211ENST00000441194 916 ntTSL 518.09■□□□□ 0.497e-7■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 MMS19-208ENST00000437002 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.85■□□□□ 0.457e-7■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 MMS19-205ENST00000422685 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.85■□□□□ 0.457e-7■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 MMS19-213ENST00000448660 776 ntTSL 516.06■□□□□ 0.167e-7■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.372e-8■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.372e-8■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.52e-8■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 MMS19-214ENST00000477575 986 ntTSL 211.49□□□□□ -0.577e-7■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 MMS19-201ENST00000327238 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.717e-7■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 MMS19-204ENST00000415383 3401 ntTSL 1 (best)10.52□□□□□ -0.737e-7■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 MMS19-209ENST00000438925 3797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.777e-7■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 MMS19-203ENST00000370782 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.777e-7■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 MMS19-217ENST00000483626 884 ntTSL 510.2□□□□□ -0.787e-7■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 MMS19-202ENST00000355839 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.927e-7■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 MCU-207ENST00000604152 556 ntTSL 55.39□□□□□ -1.556e-7■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 AP003108.2-202ENST00000541135 580 ntAPPRIS P1 TSL 419.22■□□□□ 0.672e-9■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 AP003108.2-206ENST00000544801 875 ntTSL 516.42■□□□□ 0.222e-9■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 AP003108.2-207ENST00000544880 591 ntTSL 415.66■□□□□ 0.12e-9■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 AP003108.2-203ENST00000536670 449 ntTSL 59.23□□□□□ -0.932e-9■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 AP003108.2-208ENST00000543044 883 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.982e-9■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 AP003108.2-201ENST00000544025 563 ntTSL 48.65□□□□□ -1.022e-9■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 AP003108.2-205ENST00000538594 569 ntTSL 48.48□□□□□ -1.052e-9■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 NUP107-205ENST00000535718 2655 ntTSL 1 (best)10.02□□□□□ -0.84e-6■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 NUP107-201ENST00000229179 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.054e-6■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 NUP107-204ENST00000535333 683 ntTSL 37.02□□□□□ -1.294e-6■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.424e-6■■■■□ 22.1
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ILF3Q12906 NUP107-208ENST00000538549 678 ntTSL 55.08□□□□□ -1.64e-6■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.64e-6■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.094e-7■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.814e-7■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.911e-10■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.881e-10■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.881e-10■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 CD58-204ENST00000464088 874 ntTSL 1 (best)20.49■□□□□ 0.871e-10■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.761e-8■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.617e-7■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 LDLR-206ENST00000557958 1881 ntTSL 216.1■□□□□ 0.173e-7■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 KLHDC4-218ENST00000567298 4572 ntTSL 514.12□□□□□ -0.154e-7■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 KLHDC4-205ENST00000446344 4444 ntBASIC11.74□□□□□ -0.531e-13■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 ARID2-201ENST00000334344 8642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.962e-6■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.532e-6■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 PLCG1-211ENST00000490253 527 ntTSL 218.02■□□□□ 0.484e-11■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.434e-11■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.424e-11■■■■□ 22.1
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ILF3Q12906 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.414e-8■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.012e-7■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.42e-7■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.867e-8■■■■□ 22.1
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ILF3Q12906 ST3GAL2-206ENST00000567822 689 ntTSL 316.78■□□□□ 0.281e-6■■■■□ 22.1
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ILF3Q12906 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.181e-6■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 SLC9A1-201ENST00000263980 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.651e-6■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 SLC9A1-202ENST00000374084 695 ntTSL 58.44□□□□□ -1.061e-6■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 MED13L-203ENST00000548743 568 ntTSL 37.62□□□□□ -1.191e-6■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.341e-6■■■■□ 22.1
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ILF3Q12906 TPRN-204ENST00000541945 130 ntTSL 43.02□□□□□ -1.937e-8■■■■□ 22.1
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ILF3Q12906 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.686e-7■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 UMAD1-207ENST00000638342 941 ntTSL 517.88■□□□□ 0.456e-7■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 UMAD1-205ENST00000493246 570 ntTSL 511.95□□□□□ -0.56e-7■■■■□ 22.1
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ILF3Q12906 UMAD1-208ENST00000639110 2386 ntTSL 510.87□□□□□ -0.676e-7■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 UMAD1-206ENST00000636849 2157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.296e-7■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.836e-7■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 LINC00963-205ENST00000444184 1887 ntTSL 1 (best)18.43■□□□□ 0.542e-6■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.192e-6■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.152e-6■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 LINC00963-217ENST00000624009 663 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.432e-6■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 LINC00963-220ENST00000625171 830 ntTSL 511.41□□□□□ -0.582e-6■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 LINC00963-211ENST00000608369 961 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.622e-6■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 LINC00963-214ENST00000622680 781 ntTSL 1 (best)10.95□□□□□ -0.662e-6■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 LINC00963-207ENST00000454635 910 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.712e-6■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 LINC00963-202ENST00000419300 9557 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.852e-6■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 LINC00963-219ENST00000624390 472 ntTSL 58.3□□□□□ -1.082e-6■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 LINC00963-218ENST00000624138 261 ntTSL 57.24□□□□□ -1.252e-6■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 LINC00963-215ENST00000622972 444 ntTSL 55.82□□□□□ -1.482e-6■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 EVA1A-211ENST00000490746 589 ntTSL 517.46■□□□□ 0.393e-6■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 EVA1A-208ENST00000485891 479 ntTSL 516.45■□□□□ 0.223e-6■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.23e-6■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 EVA1A-206ENST00000432649 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.27■□□□□ 0.043e-6■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.13e-6■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.243e-6■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.373e-6■■■■□ 22.1
ILF3Q12906 EVA1A-210ENST00000486696 585 ntTSL 36.81□□□□□ -1.323e-6■■■■□ 22.1
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