RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563901.5

SH3GL3-205, Transcript of SH3 domain containing GRB2 like 3, endophilin A3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SH3GL3, Length 1,647 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3GL3-205ENST00000563901 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.81■■■■■ 5.4
SH3GL3-205ENST00000563901 SMARCA2P51531 1590 aa48.76■■■■■ 5.4
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SH3GL3-205ENST00000563901 WDR62O43379 1518 aa46.14■■■■■ 4.98
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SH3GL3-205ENST00000563901 WDR97A6NE52 1622 aa45.51■■■■■ 4.88
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SH3GL3-205ENST00000563901 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.38■■■■■ 4.86
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SH3GL3-205ENST00000563901 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.22■■■■■ 4.83
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SH3GL3-205ENST00000563901 CEP170Q5SW79 1584 aa44.21■■■■■ 4.67
SH3GL3-205ENST00000563901 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa44.17■■■■■ 4.66
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SH3GL3-205ENST00000563901 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.11■■■■■ 4.65
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