RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437002.5

MMS19-208, Transcript of MMS19 homolog, cytosolic iron-sulfur assembly component, human

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene MMS19, Length 933 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MMS19-208	ENST00000437002	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		45.27	■■■■■ 4.84
MMS19-208	ENST00000437002	ABCC9	O60706	1549 aa		40.77	■■■■■ 4.12
MMS19-208	ENST00000437002	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		40.6	■■■■■ 4.09
MMS19-208	ENST00000437002	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		38.68	■■■■□ 3.78
MMS19-208	ENST00000437002	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		38.45	■■■■□ 3.75
MMS19-208	ENST00000437002	NACAD	O15069	1562 aa		38.4	■■■■□ 3.74
MMS19-208	ENST00000437002	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		38.19	■■■■□ 3.7
MMS19-208	ENST00000437002	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	37.97	■■■■□ 3.67
MMS19-208	ENST00000437002	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		37.87	■■■■□ 3.65
MMS19-208	ENST00000437002	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		37.87	■■■■□ 3.65
MMS19-208	ENST00000437002	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		37.7	■■■■□ 3.63
MMS19-208	ENST00000437002	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	37.52	■■■■□ 3.6
MMS19-208	ENST00000437002	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		37.36	■■■■□ 3.57
MMS19-208	ENST00000437002	SCRIB	Q14160	1630 aa		37.06	■■■■□ 3.52
MMS19-208	ENST00000437002	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		37.03	■■■■□ 3.52
MMS19-208	ENST00000437002	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		36.81	■■■■□ 3.48
MMS19-208	ENST00000437002	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	36.71	■■■■□ 3.47
MMS19-208	ENST00000437002	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		36.71	■■■■□ 3.47
MMS19-208	ENST00000437002	NCAPD3	P42695	1498 aa		35.51	■■■■□ 3.28
MMS19-208	ENST00000437002	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		35.41	■■■■□ 3.26
MMS19-208	ENST00000437002	SMARCA4	P51532	1647 aa		35.33	■■■■□ 3.25
MMS19-208	ENST00000437002	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		35.26	■■■■□ 3.24
MMS19-208	ENST00000437002	SMARCA2	P51531	1590 aa		35.22	■■■■□ 3.23
MMS19-208	ENST00000437002	HMGXB3	Q12766	1538 aa		35.21	■■■■□ 3.23
MMS19-208	ENST00000437002	ERCC6	Q03468	1493 aa		35.13	■■■■□ 3.21
MMS19-208	ENST00000437002	CUX2	O14529	1486 aa		35.11	■■■■□ 3.21
MMS19-208	ENST00000437002	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	35.09	■■■■□ 3.21
MMS19-208	ENST00000437002	NES	P48681	1621 aa		35.05	■■■■□ 3.2
MMS19-208	ENST00000437002	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	35.01	■■■■□ 3.19
MMS19-208	ENST00000437002	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		34.99	■■■■□ 3.19
MMS19-208	ENST00000437002	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		34.93	■■■■□ 3.18
MMS19-208	ENST00000437002	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	34.67	■■■■□ 3.14
MMS19-208	ENST00000437002	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		34.67	■■■■□ 3.14
MMS19-208	ENST00000437002	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		34.52	■■■■□ 3.12
MMS19-208	ENST00000437002	WIZ	O95785	1651 aa		34.48	■■■■□ 3.11
MMS19-208	ENST00000437002	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		34.47	■■■■□ 3.11
MMS19-208	ENST00000437002	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		34.41	■■■■□ 3.1
MMS19-208	ENST00000437002	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		34.21	■■■■□ 3.07
MMS19-208	ENST00000437002	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	34.16	■■■■□ 3.06
MMS19-208	ENST00000437002	WDR62	O43379	1518 aa		34.15	■■■■□ 3.06
MMS19-208	ENST00000437002	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		34.04	■■■■□ 3.04
MMS19-208	ENST00000437002	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		34.03	■■■■□ 3.04
MMS19-208	ENST00000437002	CFTR	P13569	1480 aa		34.02	■■■■□ 3.04
MMS19-208	ENST00000437002	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	34	■■■■□ 3.03
MMS19-208	ENST00000437002	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	33.81	■■■■□ 3
MMS19-208	ENST00000437002	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		33.66	■■■□□ 2.98
MMS19-208	ENST00000437002	TRIM41	Q8WV44	630 aa		33.64	■■■□□ 2.98
MMS19-208	ENST00000437002	PRDM2	Q13029	1718 aa		33.58	■■■□□ 2.97
MMS19-208	ENST00000437002	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		33.48	■■■□□ 2.95
MMS19-208	ENST00000437002	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
MMS19-208	ENST00000437002	TOPBP1	Q92547	1522 aa		33.39	■■■□□ 2.94
MMS19-208	ENST00000437002	IFT140	Q96RY7	1462 aa		33.37	■■■□□ 2.93
MMS19-208	ENST00000437002	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		33.22	■■■□□ 2.91
MMS19-208	ENST00000437002	ABCC8	Q09428	1581 aa		33.2	■■■□□ 2.91
MMS19-208	ENST00000437002	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
MMS19-208	ENST00000437002	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		33.13	■■■□□ 2.89
MMS19-208	ENST00000437002	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		33.13	■■■□□ 2.89
MMS19-208	ENST00000437002	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		33.13	■■■□□ 2.89
MMS19-208	ENST00000437002	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
MMS19-208	ENST00000437002	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	33.07	■■■□□ 2.88	6e-8	■■■■■ 26.8
MMS19-208	ENST00000437002	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
MMS19-208	ENST00000437002	ARHGEF11	O15085	1522 aa		33.01	■■■□□ 2.87
MMS19-208	ENST00000437002	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		32.96	■■■□□ 2.87
MMS19-208	ENST00000437002	CHD1	O14646	1710 aa		32.93	■■■□□ 2.86
MMS19-208	ENST00000437002	SOGA1	O94964	1423 aa		32.86	■■■□□ 2.85
MMS19-208	ENST00000437002	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
MMS19-208	ENST00000437002	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		32.82	■■■□□ 2.84
MMS19-208	ENST00000437002	CUX1	P39880	1505 aa		32.82	■■■□□ 2.84
MMS19-208	ENST00000437002	FBLN2	P98095	1184 aa		32.79	■■■□□ 2.84
MMS19-208	ENST00000437002	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		32.75	■■■□□ 2.83
MMS19-208	ENST00000437002	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		32.72	■■■□□ 2.83
MMS19-208	ENST00000437002	ARAP1	Q96P48	1450 aa		32.72	■■■□□ 2.83
MMS19-208	ENST00000437002	WDR97	A6NE52	1622 aa		32.66	■■■□□ 2.82
MMS19-208	ENST00000437002	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		32.6	■■■□□ 2.81
MMS19-208	ENST00000437002	GRIN2B	Q13224	1484 aa		32.58	■■■□□ 2.81
MMS19-208	ENST00000437002	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
MMS19-208	ENST00000437002	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
MMS19-208	ENST00000437002	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
MMS19-208	ENST00000437002	SYNJ2	O15056	1496 aa		32.48	■■■□□ 2.79
MMS19-208	ENST00000437002	SYNJ1	O43426	1573 aa		32.47	■■■□□ 2.79
MMS19-208	ENST00000437002	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		32.46	■■■□□ 2.79
MMS19-208	ENST00000437002	PBRM1	Q86U86	1689 aa		32.43	■■■□□ 2.78
MMS19-208	ENST00000437002	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		32.43	■■■□□ 2.78
MMS19-208	ENST00000437002	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		32.41	■■■□□ 2.78
MMS19-208	ENST00000437002	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
MMS19-208	ENST00000437002	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	32.25	■■■□□ 2.75
MMS19-208	ENST00000437002	TOP2B	Q02880	1626 aa		32.21	■■■□□ 2.75
MMS19-208	ENST00000437002	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		32.21	■■■□□ 2.75
MMS19-208	ENST00000437002	GRIN2A	Q12879	1464 aa		32.18	■■■□□ 2.74
MMS19-208	ENST00000437002	ADAMTS12	P58397	1594 aa		32.16	■■■□□ 2.74
MMS19-208	ENST00000437002	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		32.15	■■■□□ 2.74
MMS19-208	ENST00000437002	CEP170	Q5SW79	1584 aa		32.11	■■■□□ 2.73
MMS19-208	ENST00000437002	NUP160	Q12769	1436 aa		32.1	■■■□□ 2.73
MMS19-208	ENST00000437002	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		32.04	■■■□□ 2.72
MMS19-208	ENST00000437002	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		31.99	■■■□□ 2.71
MMS19-208	ENST00000437002	SHROOM2	Q13796	1616 aa		31.96	■■■□□ 2.71
MMS19-208	ENST00000437002	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	31.77	■■■□□ 2.68
MMS19-208	ENST00000437002	JPH4	Q96JJ6	628 aa		31.74	■■■□□ 2.67
MMS19-208	ENST00000437002	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		31.72	■■■□□ 2.67
MMS19-208	ENST00000437002	IGF1R	P08069	1367 aa		31.63	■■■□□ 2.65

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