Protein–RNA interactions for Protein: Q8N302

AGGF1, Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, humanhuman

eCLIP

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGGF1Q8N302 CCDC18-AS1-210ENST00000436200 492 ntTSL 36.37□□□□□ -1.393e-9■■■■□ 20.5
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AGGF1Q8N302 CCDC18-AS1-209ENST00000432741 535 ntTSL 36.13□□□□□ -1.433e-9■■■■□ 20.5
AGGF1Q8N302 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.433e-9■■■■□ 20.5
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AGGF1Q8N302 SMARCA2-263ENST00000637806 7061 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.984e-14■■■■□ 20.5
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AGGF1Q8N302 ADARB1-207ENST00000460734 2523 ntTSL 1 (best)25.89■■□□□ 1.732e-7■■■■□ 20.4
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AGGF1Q8N302 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.81e-6■■■■□ 20.4
AGGF1Q8N302 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.693e-8■■■■□ 20.4
AGGF1Q8N302 CASC3-208ENST00000583649 577 ntTSL 39.85□□□□□ -0.837e-9■■■■□ 20.4
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AGGF1Q8N302 AP002495.1-201ENST00000532852 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 36.88□□□□□ -1.313e-6■■■■□ 20.3
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AGGF1Q8N302 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.121e-6■■■■□ 20.3
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AGGF1Q8N302 CLPB-208ENST00000538021 1108 ntTSL 1 (best)10.09□□□□□ -0.791e-6■■■■□ 20.3
AGGF1Q8N302 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.73e-8■■■■□ 20.3
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AGGF1Q8N302 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.244e-6■■■■□ 20.3
AGGF1Q8N302 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.164e-6■■■■□ 20.3
AGGF1Q8N302 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.153e-8■■■■□ 20.3
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AGGF1Q8N302 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.645e-8■■■■□ 20.3
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AGGF1Q8N302 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.865e-8■■■■□ 20.3
AGGF1Q8N302 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.895e-8■■■■□ 20.3
AGGF1Q8N302 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.95e-8■■■■□ 20.3
AGGF1Q8N302 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.975e-8■■■■□ 20.3
AGGF1Q8N302 KPNA1-210ENST00000494339 1923 ntTSL 220.94■□□□□ 0.944e-7■■■■□ 20.3
AGGF1Q8N302 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.114e-7■■■■□ 20.3
AGGF1Q8N302 KPNA1-208ENST00000485027 1843 ntTSL 26.48□□□□□ -1.374e-7■■■■□ 20.3
AGGF1Q8N302 KPNA1-205ENST00000470904 3060 ntTSL 26.05□□□□□ -1.444e-7■■■■□ 20.3
AGGF1Q8N302 KPNA1-204ENST00000466923 3316 ntTSL 24.94□□□□□ -1.624e-7■■■■□ 20.3
AGGF1Q8N302 UBE2J2-213ENST00000471154 336 ntTSL 54.86□□□□□ -1.635e-7■■■■□ 20.2
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AGGF1Q8N302 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.243e-6■■■■□ 20.2
AGGF1Q8N302 CHCHD3-202ENST00000423635 1310 ntTSL 1 (best)15.41■□□□□ 0.063e-6■■■■□ 20.2
AGGF1Q8N302 CHCHD3-206ENST00000496427 721 ntTSL 56.4□□□□□ -1.383e-6■■■■□ 20.2
AGGF1Q8N302 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.332e-7■■■■□ 20.2
AGGF1Q8N302 C2CD2-201ENST00000329623 5844 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.474e-15■■■■□ 20.2
AGGF1Q8N302 C2CD2-204ENST00000467074 1952 ntTSL 511.99□□□□□ -0.494e-15■■■■□ 20.2
AGGF1Q8N302 C2CD2-208ENST00000490479 761 ntTSL 311.71□□□□□ -0.534e-15■■■■□ 20.2
AGGF1Q8N302 ARID4B-204ENST00000418304 1759 ntTSL 517.84■□□□□ 0.452e-6■■■■□ 20.1
AGGF1Q8N302 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.32e-7■■■■□ 20.1
AGGF1Q8N302 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.248e-12■■■■□ 20.1
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