Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 RNF216P1-206ENST00000406608 576 ntTSL 44.48□□□□□ -1.691e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 RABGGTB-213ENST00000496055 3863 ntTSL 24.46□□□□□ -1.71e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 ALCAM-206ENST00000481337 1242 ntTSL 24.3□□□□□ -1.721e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 RABGGTB-204ENST00000461653 1702 ntTSL 54.26□□□□□ -1.731e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 RABGGTB-207ENST00000470201 848 ntTSL 34.21□□□□□ -1.741e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 RABGGTB-210ENST00000485459 788 ntTSL 54.2□□□□□ -1.741e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 NAP1L1-218ENST00000550934 851 ntTSL 54.14□□□□□ -1.753e-23■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.761e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.771e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 HGD-208ENST00000488183 572 ntTSL 43.76□□□□□ -1.814e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 DNAH14-214ENST00000474127 773 ntTSL 33.39□□□□□ -1.871e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 RABGGTB-211ENST00000489450 586 ntTSL 53.13□□□□□ -1.911e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 MBD5-209ENST00000488372 548 ntTSL 42.93□□□□□ -1.941e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.981e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.021e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 NCOR1-218ENST00000579974 406 ntTSL 1 (best)2.28□□□□□ -2.041e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.061e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.114e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 CIT-203ENST00000392521 8708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.534e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 CIT-201ENST00000261833 8578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.914e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 CIT-207ENST00000536325 329 ntTSL 33.84□□□□□ -1.794e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 MATR3-210ENST00000504643 2560 ntTSL 27.81□□□□□ -1.161e-8■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 MATR3-218ENST00000511978 573 ntTSL 34.99□□□□□ -1.611e-8■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 MATR3-214ENST00000509918 377 ntTSL 44.69□□□□□ -1.661e-8■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.31e-7■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 CCDC144NL-AS1-212ENST00000580056 521 ntTSL 415.8■□□□□ 0.125e-7■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 CCDC144NL-AS1-216ENST00000582583 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.465e-7■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 CCDC144NL-AS1-202ENST00000423473 839 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.955e-7■■■■□ 22.3
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ILF3Q12906 CCDC144NL-AS1-203ENST00000433763 647 ntTSL 36.6□□□□□ -1.355e-7■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 MGAT5-203ENST00000468758 816 ntTSL 524.66■■□□□ 1.542e-7■■■■□ 22.3
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ILF3Q12906 MGAT5-202ENST00000409645 8252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.092e-7■■■■□ 22.3
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ILF3Q12906 RBM39-232ENST00000481037 687 ntTSL 35.31□□□□□ -1.562e-7■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 RBM39-210ENST00000425184 526 ntTSL 33.85□□□□□ -1.792e-7■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.131e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 SEC31B-205ENST00000479697 5087 ntTSL 1 (best)10.9□□□□□ -0.661e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 SEC31B-203ENST00000469546 4396 ntTSL 510.62□□□□□ -0.711e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 SEC31B-201ENST00000370345 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.851e-6■■■■□ 22.3
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ILF3Q12906 ELOA-AS1-201ENST00000427796 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.941e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 SEC31B-207ENST00000482456 3916 ntTSL 59.2□□□□□ -0.941e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 RBM39-208ENST00000416108 577 ntTSL 48.24□□□□□ -1.091e-8■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 RBM39-220ENST00000455343 441 ntTSL 53.64□□□□□ -1.831e-8■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.018e-7■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 18e-7■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 18e-7■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.968e-7■■■■□ 22.3
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ILF3Q12906 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.98e-7■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.888e-7■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.878e-7■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.268e-7■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.188e-7■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.058e-7■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.493e-7■■■■□ 22.2
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ILF3Q12906 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.412e-7■■■■□ 22.2
ILF3Q12906 CS-214ENST00000548849 1028 ntTSL 317.01■□□□□ 0.312e-7■■■■□ 22.2
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ILF3Q12906 RPS6KA1-215ENST00000529454 544 ntTSL 514.58□□□□□ -0.082e-7■■■■□ 22.2
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ILF3Q12906 CS-221ENST00000550734 747 ntTSL 511.43□□□□□ -0.582e-7■■■■□ 22.2
ILF3Q12906 SFXN2-201ENST00000369893 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.772e-7■■■■□ 22.2
ILF3Q12906 CS-202ENST00000542324 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.852e-7■■■■□ 22.2
ILF3Q12906 CS-205ENST00000546891 911 ntTSL 29.15□□□□□ -0.942e-7■■■■□ 22.2
ILF3Q12906 CS-211ENST00000548041 561 ntTSL 48.51□□□□□ -1.052e-7■■■■□ 22.2
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ILF3Q12906 CS-206ENST00000546930 568 ntTSL 48.11□□□□□ -1.112e-7■■■■□ 22.2
ILF3Q12906 CS-215ENST00000549143 2811 ntTSL 28.09□□□□□ -1.112e-7■■■■□ 22.2
ILF3Q12906 CS-216ENST00000549221 553 ntTSL 47.95□□□□□ -1.142e-7■■■■□ 22.2
ILF3Q12906 CS-212ENST00000548567 3057 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.212e-7■■■■□ 22.2
ILF3Q12906 CS-204ENST00000546621 1513 ntTSL 27.33□□□□□ -1.242e-7■■■■□ 22.2
ILF3Q12906 CS-225ENST00000551253 676 ntTSL 36.88□□□□□ -1.312e-7■■■■□ 22.2
ILF3Q12906 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.342e-7■■■■□ 22.2
ILF3Q12906 CS-232ENST00000552331 526 ntTSL 23.04□□□□□ -1.922e-7■■■■□ 22.2
ILF3Q12906 PIEZO1-208ENST00000484567 2464 ntTSL 216.76■□□□□ 0.272e-7■■■■□ 22.2
ILF3Q12906 SETD2-203ENST00000412450 4231 ntTSL 210.99□□□□□ -0.651e-6■■■■□ 22.2
ILF3Q12906 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.386e-7■■■■□ 22.2
ILF3Q12906 RPS6KA3-202ENST00000438357 530 ntTSL 514.87□□□□□ -0.031e-7■■■■□ 22.2
ILF3Q12906 RPS6KA3-206ENST00000492128 553 ntTSL 49.44□□□□□ -0.91e-7■■■■□ 22.2
ILF3Q12906 ATP11A-210ENST00000471555 5786 ntTSL 1 (best)11.24□□□□□ -0.619e-10■■■■□ 22.2
ILF3Q12906 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.441e-7■■■■□ 22.2
ILF3Q12906 ZFPM1-202ENST00000562417 497 ntTSL 317.44■□□□□ 0.381e-7■■■■□ 22.2
ILF3Q12906 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.321e-7■■■■□ 22.2
ILF3Q12906 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.311e-7■■■■□ 22.2
ILF3Q12906 ADGRG6-208ENST00000472054 1247 ntTSL 25.36□□□□□ -1.553e-7■■■■□ 22.2
ILF3Q12906 NEDD4L-212ENST00000585594 220 ntTSL 1 (best)1.74□□□□□ -2.132e-6■■■■□ 22.2
ILF3Q12906 APOL1-203ENST00000397279 1564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.041e-8■■■■□ 22.2
ILF3Q12906 YWHAE-204ENST00000486241 691 ntTSL 214.7□□□□□ -0.069e-7■■■■□ 22.2
ILF3Q12906 YWHAE-205ENST00000489287 465 ntTSL 211.04□□□□□ -0.649e-7■■■■□ 22.2
ILF3Q12906 YWHAE-203ENST00000469398 676 ntTSL 28.92□□□□□ -0.989e-7■■■■□ 22.2
ILF3Q12906 ATF7IP2-211ENST00000564797 450 ntTSL 34.28□□□□□ -1.729e-7■■■■□ 22.2
ILF3Q12906 NUP214-204ENST00000453861 3208 ntTSL 59.16□□□□□ -0.945e-11■■■■□ 22.2
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