RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
RABGGTB-211ENST00000489450 CHIC1Q5VXU3 224 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGGTB-211ENST00000489450 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RABGGTB-211ENST00000489450 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
RABGGTB-211ENST00000489450 FOXD1Q16676 465 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGGTB-211ENST00000489450 PLPPR3Q6T4P5 718 aa12.96□□□□□ -0.33
RABGGTB-211ENST00000489450 MSH5O43196 834 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGGTB-211ENST00000489450 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP6R1Q9UPN7 881 aa12.8□□□□□ -0.36
RABGGTB-211ENST00000489450 POTEDQ86YR6 584 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGGTB-211ENST00000489450 ADRA2BP18089 450 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGGTB-211ENST00000489450 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
RABGGTB-211ENST00000489450 DMRT2Q9Y5R5 561 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGGTB-211ENST00000489450 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa11.46□□□□□ -0.57
RABGGTB-211ENST00000489450 KCNA4P22459 653 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGGTB-211ENST00000489450 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-211ENST00000489450 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
RABGGTB-211ENST00000489450 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGGTB-211ENST00000489450 DCAF8L1A6NGE4 600 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGGTB-211ENST00000489450 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
RABGGTB-211ENST00000489450 NPM3O75607 178 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF39Q9H2S5 420 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
RABGGTB-211ENST00000489450 DNAJC5BQ9UF47 199 aa10.83□□□□□ -0.68
RABGGTB-211ENST00000489450 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
RABGGTB-211ENST00000489450 EHMT2Q96KQ7 1210 aa10.79□□□□□ -0.68
RABGGTB-211ENST00000489450 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-211ENST00000489450 CSRNP3Q8WYN3 585 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-211ENST00000489450 ZBTB22O15209 634 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGGTB-211ENST00000489450 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-211ENST00000489450 FOXD4L1Q9NU39 408 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC4A2P04920 1241 aa10.4□□□□□ -0.74
RABGGTB-211ENST00000489450 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-211ENST00000489450 CAPN15O75808 1086 aa10.27□□□□□ -0.77
RABGGTB-211ENST00000489450 DSG3P32926 999 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGGTB-211ENST00000489450 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-211ENST00000489450 TRHP20396 242 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
RABGGTB-211ENST00000489450 APLP2Q06481 763 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGGTB-211ENST00000489450 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-211ENST00000489450 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-211ENST00000489450 ABCB7O75027 752 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-211ENST00000489450 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-211ENST00000489450 ATXN8OSP0DMR3 200 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTB-211ENST00000489450 POTEHQ6S545 545 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-211ENST00000489450 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-211ENST00000489450 POLA2Q14181 598 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-211ENST00000489450 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-211ENST00000489450 CHRDL2Q6WN34 429 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-211ENST00000489450 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
RABGGTB-211ENST00000489450 FKBP8Q14318 412 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-211ENST00000489450 AKT1S1Q96B36 256 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-211ENST00000489450 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-211ENST00000489450 OSCARQ8IYS5 282 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-211ENST00000489450 FBLN2P98095 1184 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-211ENST00000489450 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-211ENST00000489450 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGGTB-211ENST00000489450 SPDYE4A6NLX3 237 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-211ENST00000489450 PITPNM1O00562 1244 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-211ENST00000489450 SPDYE2BA6NHP3 402 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-211ENST00000489450 SPDYE6P0CI01 402 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-211ENST00000489450 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-211ENST00000489450 SPDYE2Q495Y8 402 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-211ENST00000489450 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
RABGGTB-211ENST00000489450 PROM2Q8N271 834 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-211ENST00000489450 HAX1O00165 279 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-211ENST00000489450 SSUH2Q9Y2M2 353 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-211ENST00000489450 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-211ENST00000489450 CLEC11AQ9Y240 323 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-211ENST00000489450 EVX2Q03828 476 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGGTB-211ENST00000489450 FBXO3Q9UK99 471 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGGTB-211ENST00000489450 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-211ENST00000489450 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-211ENST00000489450 VASPP50552 380 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-211ENST00000489450 C19orf67A6NJJ6 358 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-211ENST00000489450 CHADLQ6NUI6 762 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-211ENST00000489450 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-211ENST00000489450 PRR29P0C7W0 189 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-211ENST00000489450 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-211ENST00000489450 STAG3Q9UJ98 1225 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGGTB-211ENST00000489450 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
RABGGTB-211ENST00000489450 GABBR2O75899 941 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-211ENST00000489450 PLCD3Q8N3E9 789 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-211ENST00000489450 MIER1Q8N108 512 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-211ENST00000489450 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-211ENST00000489450 KLHL34Q8N239 644 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-211ENST00000489450 CD44P16070 742 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
RABGGTB-211ENST00000489450 PLEKHG5O94827 1062 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGGTB-211ENST00000489450 SPOCK2Q92563 424 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGGTB-211ENST00000489450 CREBZFQ9NS37 354 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGGTB-211ENST00000489450 POTEIP0CG38 1075 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGGTB-211ENST00000489450 LHX8Q68G74 356 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGGTB-211ENST00000489450 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
RABGGTB-211ENST00000489450 CLCN6P51797 869 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-211ENST00000489450 PKD2Q13563 968 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-211ENST00000489450 ZRANB1Q9UGI0 708 aa8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms