RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
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RABGGTB-211ENST00000489450 MSH5O43196 834 aa12.87□□□□□ -0.35
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RABGGTB-211ENST00000489450 ADRA2BP18089 450 aa12.73□□□□□ -0.37
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RABGGTB-211ENST00000489450 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa11.46□□□□□ -0.57
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RABGGTB-211ENST00000489450 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGGTB-211ENST00000489450 DCAF8L1A6NGE4 600 aa11.15□□□□□ -0.62
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RABGGTB-211ENST00000489450 RNF39Q9H2S5 420 aa10.99□□□□□ -0.65
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RABGGTB-211ENST00000489450 EHMT2Q96KQ7 1210 aa10.79□□□□□ -0.68
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RABGGTB-211ENST00000489450 FOXD4L1Q9NU39 408 aa10.42□□□□□ -0.74
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RABGGTB-211ENST00000489450 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
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RABGGTB-211ENST00000489450 SPDYE6P0CI01 402 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-211ENST00000489450 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-211ENST00000489450 SPDYE2Q495Y8 402 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-211ENST00000489450 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
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RABGGTB-211ENST00000489450 HAX1O00165 279 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-211ENST00000489450 SSUH2Q9Y2M2 353 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-211ENST00000489450 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-211ENST00000489450 CLEC11AQ9Y240 323 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-211ENST00000489450 EVX2Q03828 476 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGGTB-211ENST00000489450 FBXO3Q9UK99 471 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGGTB-211ENST00000489450 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-211ENST00000489450 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP9.09□□□□□ -0.95
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RABGGTB-211ENST00000489450 CHADLQ6NUI6 762 aa9□□□□□ -0.97
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RABGGTB-211ENST00000489450 PRR29P0C7W0 189 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-211ENST00000489450 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
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RABGGTB-211ENST00000489450 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
RABGGTB-211ENST00000489450 GABBR2O75899 941 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-211ENST00000489450 PLCD3Q8N3E9 789 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-211ENST00000489450 MIER1Q8N108 512 aa8.85□□□□□ -0.99
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RABGGTB-211ENST00000489450 KLHL34Q8N239 644 aa8.82□□□□□ -1
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RABGGTB-211ENST00000489450 CREBZFQ9NS37 354 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGGTB-211ENST00000489450 POTEIP0CG38 1075 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGGTB-211ENST00000489450 LHX8Q68G74 356 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGGTB-211ENST00000489450 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
RABGGTB-211ENST00000489450 CLCN6P51797 869 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-211ENST00000489450 PKD2Q13563 968 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-211ENST00000489450 ZRANB1Q9UGI0 708 aa8.67□□□□□ -1.02
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