Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY50

SEC11C, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC11CQ9BY50 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC11CQ9BY50 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEC11CQ9BY50 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEC11CQ9BY50 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC11CQ9BY50 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC11CQ9BY50 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC11CQ9BY50 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC11CQ9BY50 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC11CQ9BY50 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC11CQ9BY50 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC11CQ9BY50 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC11CQ9BY50 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC11CQ9BY50 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC11CQ9BY50 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC11CQ9BY50 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC11CQ9BY50 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC11CQ9BY50 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC11CQ9BY50 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC11CQ9BY50 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC11CQ9BY50 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC11CQ9BY50 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC11CQ9BY50 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC11CQ9BY50 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC11CQ9BY50 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC11CQ9BY50 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms