RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409972.5

RBMS1-205, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RBMS1, Length 1,815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1-205ENST00000409972 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.65■■■■■ 5.54
RBMS1-205ENST00000409972 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.28■■■■■ 4.52
RBMS1-205ENST00000409972 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.68■■■■■ 4.26
RBMS1-205ENST00000409972 ABCC9O60706 1549 aa41.08■■■■■ 4.17
RBMS1-205ENST00000409972 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.06■■■■■ 4.16
RBMS1-205ENST00000409972 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41■■■■■ 4.15
RBMS1-205ENST00000409972 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.53■■■■■ 4.08
RBMS1-205ENST00000409972 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.5■■■■■ 4.07
RBMS1-205ENST00000409972 NACADO15069 1562 aa40.33■■■■■ 4.05
RBMS1-205ENST00000409972 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40■■■■□ 3.99
RBMS1-205ENST00000409972 SCRIBQ14160 1630 aa39.86■■■■□ 3.97
RBMS1-205ENST00000409972 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.34■■■■□ 3.89
RBMS1-205ENST00000409972 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.91■■■■□ 3.82
RBMS1-205ENST00000409972 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.9■■■■□ 3.82
RBMS1-205ENST00000409972 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.77■■■■□ 3.8
RBMS1-205ENST00000409972 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.66■■■■□ 3.78
RBMS1-205ENST00000409972 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.51■■■■□ 3.75
RBMS1-205ENST00000409972 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.4■■■■□ 3.74
RBMS1-205ENST00000409972 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.3■■■■□ 3.72
RBMS1-205ENST00000409972 SMARCA4P51532 1647 aa38.18■■■■□ 3.7
RBMS1-205ENST00000409972 WIZO95785 1651 aa38.1■■■■□ 3.69
RBMS1-205ENST00000409972 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.71■■■■□ 3.63
RBMS1-205ENST00000409972 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.69■■■■□ 3.62
RBMS1-205ENST00000409972 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.62■■■■□ 3.61
RBMS1-205ENST00000409972 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.58■■■■□ 3.61
RBMS1-205ENST00000409972 SMARCA2P51531 1590 aa37.5■■■■□ 3.59
RBMS1-205ENST00000409972 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
RBMS1-205ENST00000409972 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.28■■■■□ 3.56
RBMS1-205ENST00000409972 NCAPD3P42695 1498 aa37.25■■■■□ 3.55
RBMS1-205ENST00000409972 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.22■■■■□ 3.55
RBMS1-205ENST00000409972 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.17■■■■□ 3.54
RBMS1-205ENST00000409972 HMGXB3Q12766 1538 aa37.17■■■■□ 3.54
RBMS1-205ENST00000409972 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.6■■■■□ 3.45
RBMS1-205ENST00000409972 TRIM41Q8WV44 630 aa36.54■■■■□ 3.44
RBMS1-205ENST00000409972 ABCC8Q09428 1581 aa36.5■■■■□ 3.43
RBMS1-205ENST00000409972 CFTRP13569 1480 aa36.41■■■■□ 3.42
RBMS1-205ENST00000409972 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.3■■■■□ 3.4
RBMS1-205ENST00000409972 PRDM2Q13029 1718 aa36.22■■■■□ 3.39
RBMS1-205ENST00000409972 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.21■■■■□ 3.39
RBMS1-205ENST00000409972 SYNJ1O43426 1573 aa36.12■■■■□ 3.37
RBMS1-205ENST00000409972 NESP48681 1621 aa36.09■■■■□ 3.37
RBMS1-205ENST00000409972 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.98■■■■□ 3.35
RBMS1-205ENST00000409972 TOP2BQ02880 1626 aa35.94■■■■□ 3.34
RBMS1-205ENST00000409972 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
RBMS1-205ENST00000409972 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.9■■■■□ 3.34
RBMS1-205ENST00000409972 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.9■■■■□ 3.34
RBMS1-205ENST00000409972 CUX1P39880 1505 aa35.89■■■■□ 3.34
RBMS1-205ENST00000409972 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.84■■■■□ 3.33
RBMS1-205ENST00000409972 SOGA1O94964 1423 aa35.79■■■■□ 3.32
RBMS1-205ENST00000409972 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.71■■■■□ 3.31
RBMS1-205ENST00000409972 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.69■■■■□ 3.3
RBMS1-205ENST00000409972 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.65■■■■□ 3.3
RBMS1-205ENST00000409972 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.63■■■■□ 3.29
RBMS1-205ENST00000409972 EEA1Q15075 1411 aa35.57■■■■□ 3.29
RBMS1-205ENST00000409972 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.55■■■■□ 3.28
RBMS1-205ENST00000409972 TOPBP1Q92547 1522 aa35.51■■■■□ 3.28
RBMS1-205ENST00000409972 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
RBMS1-205ENST00000409972 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.49■■■■□ 3.27
RBMS1-205ENST00000409972 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.48■■■■□ 3.27
RBMS1-205ENST00000409972 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.46■■■■□ 3.27
RBMS1-205ENST00000409972 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
RBMS1-205ENST00000409972 KIF27Q86VH2 1401 aa35.27■■■■□ 3.24
RBMS1-205ENST00000409972 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.26■■■■□ 3.24
RBMS1-205ENST00000409972 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.25■■■■□ 3.23
RBMS1-205ENST00000409972 CUX2O14529 1486 aa35.23■■■■□ 3.23
RBMS1-205ENST00000409972 KIF21BO75037 1637 aa35.18■■■■□ 3.22
RBMS1-205ENST00000409972 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.16■■■■□ 3.22
RBMS1-205ENST00000409972 ERCC6Q03468 1493 aa35.16■■■■□ 3.22
RBMS1-205ENST00000409972 GOLGA3Q08378 1498 aa35.12■■■■□ 3.21
RBMS1-205ENST00000409972 WDR62O43379 1518 aa35.09■■■■□ 3.21
RBMS1-205ENST00000409972 WDR97A6NE52 1622 aa35.08■■■■□ 3.21
RBMS1-205ENST00000409972 PRXQ9BXM0 1461 aa35.06■■■■□ 3.2
RBMS1-205ENST00000409972 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.05■■■■□ 3.2
RBMS1-205ENST00000409972 IGF1RP08069 1367 aa35.04■■■■□ 3.2
RBMS1-205ENST00000409972 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
RBMS1-205ENST00000409972 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.02■■■■□ 3.2
RBMS1-205ENST00000409972 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
RBMS1-205ENST00000409972 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
RBMS1-205ENST00000409972 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.94■■■■□ 3.18
RBMS1-205ENST00000409972 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
RBMS1-205ENST00000409972 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.9■■■■□ 3.18
RBMS1-205ENST00000409972 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.83■■■■□ 3.17
RBMS1-205ENST00000409972 CEP162Q5TB80 1403 aa34.83■■■■□ 3.17
RBMS1-205ENST00000409972 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.81■■■■□ 3.16
RBMS1-205ENST00000409972 IFT140Q96RY7 1462 aa34.8■■■■□ 3.16
RBMS1-205ENST00000409972 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.72■■■■□ 3.157e-7■■□□□ 14
RBMS1-205ENST00000409972 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
RBMS1-205ENST00000409972 CUL7Q14999 1698 aa34.7■■■■□ 3.15
RBMS1-205ENST00000409972 PBRM1Q86U86 1689 aa34.65■■■■□ 3.14
RBMS1-205ENST00000409972 CLIP1P30622 1438 aa34.57■■■■□ 3.13
RBMS1-205ENST00000409972 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.54■■■■□ 3.12
RBMS1-205ENST00000409972 GRIN2BQ13224 1484 aa34.54■■■■□ 3.12
RBMS1-205ENST00000409972 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.51■■■■□ 3.12
RBMS1-205ENST00000409972 ADAMTS12P58397 1594 aa34.44■■■■□ 3.1
RBMS1-205ENST00000409972 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.42■■■■□ 3.1
RBMS1-205ENST00000409972 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.35■■■■□ 3.09
RBMS1-205ENST00000409972 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.35■■■■□ 3.09
RBMS1-205ENST00000409972 ARAP1Q96P48 1450 aa34.3■■■■□ 3.08
RBMS1-205ENST00000409972 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.3■■■■□ 3.08
RBMS1-205ENST00000409972 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.25■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9 ms