Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6L3A6NEY3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms