RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338134.7

KPTN-201, Transcript of kaptin, actin binding protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KPTN, Length 1,691 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPTN-201ENST00000338134 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.4■■■■■ 5.5
KPTN-201ENST00000338134 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.07■■■■■ 4.49
KPTN-201ENST00000338134 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
KPTN-201ENST00000338134 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.88■■■■■ 4.14
KPTN-201ENST00000338134 ABCC9O60706 1549 aa40.88■■■■■ 4.13
KPTN-201ENST00000338134 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.83■■■■■ 4.13
KPTN-201ENST00000338134 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.39■■■■■ 4.06
KPTN-201ENST00000338134 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.24■■■■■ 4.03
KPTN-201ENST00000338134 NACADO15069 1562 aa40.18■■■■■ 4.02
KPTN-201ENST00000338134 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.84■■■■□ 3.97
KPTN-201ENST00000338134 SCRIBQ14160 1630 aa39.62■■■■□ 3.93
KPTN-201ENST00000338134 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.04■■■■□ 3.84
KPTN-201ENST00000338134 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.69■■■■□ 3.78
KPTN-201ENST00000338134 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.67■■■■□ 3.78
KPTN-201ENST00000338134 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.57■■■■□ 3.76
KPTN-201ENST00000338134 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.41■■■■□ 3.74
KPTN-201ENST00000338134 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.3■■■■□ 3.72
KPTN-201ENST00000338134 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.17■■■■□ 3.7
KPTN-201ENST00000338134 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.13■■■■□ 3.69
KPTN-201ENST00000338134 SMARCA4P51532 1647 aa37.97■■■■□ 3.67
KPTN-201ENST00000338134 WIZO95785 1651 aa37.84■■■■□ 3.65
KPTN-201ENST00000338134 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.52■■■■□ 3.6
KPTN-201ENST00000338134 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.5■■■■□ 3.59
KPTN-201ENST00000338134 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.43■■■■□ 3.58
KPTN-201ENST00000338134 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.41■■■■□ 3.58
KPTN-201ENST00000338134 SMARCA2P51531 1590 aa37.35■■■■□ 3.57
KPTN-201ENST00000338134 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
KPTN-201ENST00000338134 NCAPD3P42695 1498 aa37.11■■■■□ 3.53
KPTN-201ENST00000338134 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.08■■■■□ 3.53
KPTN-201ENST00000338134 HMGXB3Q12766 1538 aa37.01■■■■□ 3.51
KPTN-201ENST00000338134 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.99■■■■□ 3.51
KPTN-201ENST00000338134 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.98■■■■□ 3.51
KPTN-201ENST00000338134 TRIM41Q8WV44 630 aa36.39■■■■□ 3.42
KPTN-201ENST00000338134 CFTRP13569 1480 aa36.25■■■■□ 3.39
KPTN-201ENST00000338134 ABCC8Q09428 1581 aa36.25■■■■□ 3.39
KPTN-201ENST00000338134 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.21■■■■□ 3.39
KPTN-201ENST00000338134 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.16■■■■□ 3.38
KPTN-201ENST00000338134 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.04■■■■□ 3.36
KPTN-201ENST00000338134 PRDM2Q13029 1718 aa36■■■■□ 3.35
KPTN-201ENST00000338134 SYNJ1O43426 1573 aa35.88■■■■□ 3.33
KPTN-201ENST00000338134 NESP48681 1621 aa35.86■■■■□ 3.33
KPTN-201ENST00000338134 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.83■■■■□ 3.33
KPTN-201ENST00000338134 TOP2BQ02880 1626 aa35.74■■■■□ 3.31
KPTN-201ENST00000338134 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.74■■■■□ 3.31
KPTN-201ENST00000338134 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
KPTN-201ENST00000338134 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.7■■■■□ 3.31
KPTN-201ENST00000338134 CUX1P39880 1505 aa35.68■■■■□ 3.3
KPTN-201ENST00000338134 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.59■■■■□ 3.29
KPTN-201ENST00000338134 SOGA1O94964 1423 aa35.58■■■■□ 3.29
KPTN-201ENST00000338134 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.58■■■■□ 3.29
KPTN-201ENST00000338134 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.5■■■■□ 3.27
KPTN-201ENST00000338134 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.46■■■■□ 3.27
KPTN-201ENST00000338134 EEA1Q15075 1411 aa35.44■■■■□ 3.26
KPTN-201ENST00000338134 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.4■■■■□ 3.26
KPTN-201ENST00000338134 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.38■■■■□ 3.25
KPTN-201ENST00000338134 TOPBP1Q92547 1522 aa35.34■■■■□ 3.25
KPTN-201ENST00000338134 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.33■■■■□ 3.25
KPTN-201ENST00000338134 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.31■■■■□ 3.24
KPTN-201ENST00000338134 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
KPTN-201ENST00000338134 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.21■■■■□ 3.23
KPTN-201ENST00000338134 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
KPTN-201ENST00000338134 KIF27Q86VH2 1401 aa35.14■■■■□ 3.22
KPTN-201ENST00000338134 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.11■■■■□ 3.21
KPTN-201ENST00000338134 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.06■■■■□ 3.2
KPTN-201ENST00000338134 CUX2O14529 1486 aa35.06■■■■□ 3.2
KPTN-201ENST00000338134 ERCC6Q03468 1493 aa35.04■■■■□ 3.2
KPTN-201ENST00000338134 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35■■■■□ 3.19
KPTN-201ENST00000338134 KIF21BO75037 1637 aa34.98■■■■□ 3.19
KPTN-201ENST00000338134 GOLGA3Q08378 1498 aa34.95■■■■□ 3.19
KPTN-201ENST00000338134 WDR62O43379 1518 aa34.93■■■■□ 3.18
KPTN-201ENST00000338134 PRXQ9BXM0 1461 aa34.88■■■■□ 3.17
KPTN-201ENST00000338134 IGF1RP08069 1367 aa34.88■■■■□ 3.17
KPTN-201ENST00000338134 WDR97A6NE52 1622 aa34.86■■■■□ 3.17
KPTN-201ENST00000338134 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.86■■■■□ 3.17
KPTN-201ENST00000338134 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
KPTN-201ENST00000338134 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.84■■■■□ 3.17
KPTN-201ENST00000338134 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
KPTN-201ENST00000338134 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.82■■■■□ 3.16
KPTN-201ENST00000338134 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.77■■■■□ 3.16
KPTN-201ENST00000338134 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
KPTN-201ENST00000338134 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.7■■■■□ 3.15
KPTN-201ENST00000338134 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.68■■■■□ 3.14
KPTN-201ENST00000338134 IFT140Q96RY7 1462 aa34.68■■■■□ 3.14
KPTN-201ENST00000338134 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.66■■■■□ 3.14
KPTN-201ENST00000338134 CEP162Q5TB80 1403 aa34.64■■■■□ 3.14
KPTN-201ENST00000338134 CUL7Q14999 1698 aa34.54■■■■□ 3.12
KPTN-201ENST00000338134 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.54■■■■□ 3.12
KPTN-201ENST00000338134 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.51■■■■□ 3.11
KPTN-201ENST00000338134 PBRM1Q86U86 1689 aa34.43■■■■□ 3.1
KPTN-201ENST00000338134 CLIP1P30622 1438 aa34.4■■■■□ 3.1
KPTN-201ENST00000338134 GRIN2BQ13224 1484 aa34.4■■■■□ 3.1
KPTN-201ENST00000338134 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
KPTN-201ENST00000338134 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.08
KPTN-201ENST00000338134 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.29■■■■□ 3.08
KPTN-201ENST00000338134 ADAMTS12P58397 1594 aa34.24■■■■□ 3.07
KPTN-201ENST00000338134 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.18■■■■□ 3.06
KPTN-201ENST00000338134 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.13■■■■□ 3.05
KPTN-201ENST00000338134 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
KPTN-201ENST00000338134 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.1■■■■□ 3.05
KPTN-201ENST00000338134 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.08■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.1 ms