Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC39.77■■■■□ 3.96
GOLGA6L3A6NEY3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
GOLGA6L3A6NEY3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
GOLGA6L3A6NEY3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC38.54■■■■□ 3.76
GOLGA6L3A6NEY3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
GOLGA6L3A6NEY3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
GOLGA6L3A6NEY3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
GOLGA6L3A6NEY3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
GOLGA6L3A6NEY3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
GOLGA6L3A6NEY3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
GOLGA6L3A6NEY3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
GOLGA6L3A6NEY3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
GOLGA6L3A6NEY3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
GOLGA6L3A6NEY3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
GOLGA6L3A6NEY3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
GOLGA6L3A6NEY3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
GOLGA6L3A6NEY3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
GOLGA6L3A6NEY3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
GOLGA6L3A6NEY3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
GOLGA6L3A6NEY3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
GOLGA6L3A6NEY3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
GOLGA6L3A6NEY3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
GOLGA6L3A6NEY3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
GOLGA6L3A6NEY3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
GOLGA6L3A6NEY3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
GOLGA6L3A6NEY3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
GOLGA6L3A6NEY3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
GOLGA6L3A6NEY3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
GOLGA6L3A6NEY3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
GOLGA6L3A6NEY3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
GOLGA6L3A6NEY3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
GOLGA6L3A6NEY3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
GOLGA6L3A6NEY3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
GOLGA6L3A6NEY3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
GOLGA6L3A6NEY3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
GOLGA6L3A6NEY3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
GOLGA6L3A6NEY3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
GOLGA6L3A6NEY3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
GOLGA6L3A6NEY3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
GOLGA6L3A6NEY3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
GOLGA6L3A6NEY3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
GOLGA6L3A6NEY3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
GOLGA6L3A6NEY3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
GOLGA6L3A6NEY3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
GOLGA6L3A6NEY3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
GOLGA6L3A6NEY3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
GOLGA6L3A6NEY3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
GOLGA6L3A6NEY3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
GOLGA6L3A6NEY3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
GOLGA6L3A6NEY3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
GOLGA6L3A6NEY3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
GOLGA6L3A6NEY3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
GOLGA6L3A6NEY3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GOLGA6L3A6NEY3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GOLGA6L3A6NEY3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
GOLGA6L3A6NEY3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GOLGA6L3A6NEY3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GOLGA6L3A6NEY3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
GOLGA6L3A6NEY3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
GOLGA6L3A6NEY3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
GOLGA6L3A6NEY3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
GOLGA6L3A6NEY3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
GOLGA6L3A6NEY3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
GOLGA6L3A6NEY3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GOLGA6L3A6NEY3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GOLGA6L3A6NEY3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
GOLGA6L3A6NEY3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
GOLGA6L3A6NEY3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GOLGA6L3A6NEY3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
GOLGA6L3A6NEY3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
GOLGA6L3A6NEY3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GOLGA6L3A6NEY3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
GOLGA6L3A6NEY3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
GOLGA6L3A6NEY3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
GOLGA6L3A6NEY3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GOLGA6L3A6NEY3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GOLGA6L3A6NEY3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GOLGA6L3A6NEY3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GOLGA6L3A6NEY3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
GOLGA6L3A6NEY3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GOLGA6L3A6NEY3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
GOLGA6L3A6NEY3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
GOLGA6L3A6NEY3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GOLGA6L3A6NEY3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GOLGA6L3A6NEY3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GOLGA6L3A6NEY3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
GOLGA6L3A6NEY3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
GOLGA6L3A6NEY3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
GOLGA6L3A6NEY3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
GOLGA6L3A6NEY3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
GOLGA6L3A6NEY3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
GOLGA6L3A6NEY3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GOLGA6L3A6NEY3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GOLGA6L3A6NEY3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GOLGA6L3A6NEY3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GOLGA6L3A6NEY3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
GOLGA6L3A6NEY3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
GOLGA6L3A6NEY3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
GOLGA6L3A6NEY3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms