RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484288.5

PXK-211, Transcript of PX domain containing serine/threonine kinase like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PXK, Length 2,031 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXK-211ENST00000484288 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.17■■■■■ 5.14
PXK-211ENST00000484288 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.93■■■■■ 4.14
PXK-211ENST00000484288 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.67■■■■□ 3.94
PXK-211ENST00000484288 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.07■■■■□ 3.85
PXK-211ENST00000484288 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.91■■■■□ 3.82
PXK-211ENST00000484288 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.87■■■■□ 3.81
PXK-211ENST00000484288 ABCC9O60706 1549 aa38.59■■■■□ 3.77
PXK-211ENST00000484288 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.32■■■■□ 3.72
PXK-211ENST00000484288 NACADO15069 1562 aa38.06■■■■□ 3.68
PXK-211ENST00000484288 SCRIBQ14160 1630 aa37.82■■■■□ 3.64
PXK-211ENST00000484288 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.69■■■■□ 3.62
PXK-211ENST00000484288 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.56■■■■□ 3.6
PXK-211ENST00000484288 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.06■■■■□ 3.52
PXK-211ENST00000484288 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
PXK-211ENST00000484288 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.7■■■■□ 3.47
PXK-211ENST00000484288 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.59■■■■□ 3.45
PXK-211ENST00000484288 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.51■■■■□ 3.44
PXK-211ENST00000484288 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.5■■■■□ 3.43
PXK-211ENST00000484288 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
PXK-211ENST00000484288 WIZO95785 1651 aa36.26■■■■□ 3.4
PXK-211ENST00000484288 SMARCA4P51532 1647 aa36.22■■■■□ 3.39
PXK-211ENST00000484288 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.04■■■■□ 3.36
PXK-211ENST00000484288 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
PXK-211ENST00000484288 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.69■■■■□ 3.3
PXK-211ENST00000484288 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.54■■■■□ 3.28
PXK-211ENST00000484288 SMARCA2P51531 1590 aa35.51■■■■□ 3.27
PXK-211ENST00000484288 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.49■■■■□ 3.27
PXK-211ENST00000484288 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
PXK-211ENST00000484288 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
PXK-211ENST00000484288 TRIM41Q8WV44 630 aa35.23■■■■□ 3.23
PXK-211ENST00000484288 NCAPD3P42695 1498 aa35.15■■■■□ 3.22
PXK-211ENST00000484288 HMGXB3Q12766 1538 aa35.11■■■■□ 3.21
PXK-211ENST00000484288 ABCC8Q09428 1581 aa34.9■■■■□ 3.18
PXK-211ENST00000484288 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.9■■■■□ 3.18
PXK-211ENST00000484288 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.76■■■■□ 3.15
PXK-211ENST00000484288 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.68■■■■□ 3.14
PXK-211ENST00000484288 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.58■■■■□ 3.13
PXK-211ENST00000484288 CFTRP13569 1480 aa34.47■■■■□ 3.11
PXK-211ENST00000484288 SYNJ1O43426 1573 aa34.44■■■■□ 3.1
PXK-211ENST00000484288 PRDM2Q13029 1718 aa34.34■■■■□ 3.09
PXK-211ENST00000484288 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.31■■■■□ 3.08
PXK-211ENST00000484288 SOGA1O94964 1423 aa34.3■■■■□ 3.08
PXK-211ENST00000484288 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.26■■■■□ 3.08
PXK-211ENST00000484288 TOP2BQ02880 1626 aa34.24■■■■□ 3.07
PXK-211ENST00000484288 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.19■■■■□ 3.06
PXK-211ENST00000484288 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.17■■■■□ 3.06
PXK-211ENST00000484288 EEA1Q15075 1411 aa34.16■■■■□ 3.06
PXK-211ENST00000484288 CUX1P39880 1505 aa34.1■■■■□ 3.05
PXK-211ENST00000484288 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.06■■■■□ 3.04
PXK-211ENST00000484288 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.04■■■■□ 3.04
PXK-211ENST00000484288 NESP48681 1621 aa33.99■■■■□ 3.03
PXK-211ENST00000484288 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.95■■■■□ 3.02
PXK-211ENST00000484288 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.91■■■■□ 3.02
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PXK-211ENST00000484288 KIF21BO75037 1637 aa33.74■■■□□ 2.99
PXK-211ENST00000484288 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.73■■■□□ 2.99
PXK-211ENST00000484288 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.72■■■□□ 2.99
PXK-211ENST00000484288 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.71■■■□□ 2.99
PXK-211ENST00000484288 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.68■■■□□ 2.98
PXK-211ENST00000484288 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.67■■■□□ 2.98
PXK-211ENST00000484288 KIF27Q86VH2 1401 aa33.66■■■□□ 2.98
PXK-211ENST00000484288 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.65■■■□□ 2.98
PXK-211ENST00000484288 TOPBP1Q92547 1522 aa33.61■■■□□ 2.97
PXK-211ENST00000484288 CEP162Q5TB80 1403 aa33.6■■■□□ 2.97
PXK-211ENST00000484288 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.57■■■□□ 2.96
PXK-211ENST00000484288 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.57■■■□□ 2.96
PXK-211ENST00000484288 CUX2O14529 1486 aa33.54■■■□□ 2.96
PXK-211ENST00000484288 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.51■■■□□ 2.96
PXK-211ENST00000484288 PRXQ9BXM0 1461 aa33.49■■■□□ 2.95
PXK-211ENST00000484288 PCGF6Q9BYE7 350 aa33.48■■■□□ 2.95
PXK-211ENST00000484288 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.48■■■□□ 2.95
PXK-211ENST00000484288 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.45■■■□□ 2.95
PXK-211ENST00000484288 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.42■■■□□ 2.94
PXK-211ENST00000484288 IGF1RP08069 1367 aa33.35■■■□□ 2.93
PXK-211ENST00000484288 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.35■■■□□ 2.93
PXK-211ENST00000484288 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP33.31■■■□□ 2.92
PXK-211ENST00000484288 CLIP1P30622 1438 aa33.27■■■□□ 2.92
PXK-211ENST00000484288 WDR97A6NE52 1622 aa33.23■■■□□ 2.91
PXK-211ENST00000484288 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.2■■■□□ 2.9
PXK-211ENST00000484288 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.19■■■□□ 2.9
PXK-211ENST00000484288 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.17■■■□□ 2.9
PXK-211ENST00000484288 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP33.16■■■□□ 2.9
PXK-211ENST00000484288 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.08■■■□□ 2.89
PXK-211ENST00000484288 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.89
PXK-211ENST00000484288 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.06■■■□□ 2.88
PXK-211ENST00000484288 ERCC6Q03468 1493 aa33.04■■■□□ 2.88
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PXK-211ENST00000484288 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.01■■■□□ 2.88
PXK-211ENST00000484288 WDR62O43379 1518 aa33.01■■■□□ 2.87
PXK-211ENST00000484288 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.99■■■□□ 2.87
PXK-211ENST00000484288 ARAP1Q96P48 1450 aa32.89■■■□□ 2.86
PXK-211ENST00000484288 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.86■■■□□ 2.85
PXK-211ENST00000484288 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.84■■■□□ 2.85
PXK-211ENST00000484288 IFT140Q96RY7 1462 aa32.84■■■□□ 2.85
PXK-211ENST00000484288 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.84■■■□□ 2.85
PXK-211ENST00000484288 PBRM1Q86U86 1689 aa32.82■■■□□ 2.84
PXK-211ENST00000484288 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.81■■■□□ 2.84
PXK-211ENST00000484288 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.75■■■□□ 2.83
PXK-211ENST00000484288 APLP2Q06481 763 aa32.74■■■□□ 2.83
PXK-211ENST00000484288 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.73■■■□□ 2.83
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