RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361132.8

RASGEF1C-201, Transcript of RasGEF domain family member 1C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RASGEF1C, Length 2,243 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1C-201ENST00000361132 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.25■■■■■ 4.99
RASGEF1C-201ENST00000361132 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.97■■■■□ 3.99
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RASGEF1C-201ENST00000361132 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.35■■■■□ 3.73
RASGEF1C-201ENST00000361132 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.33■■■■□ 3.73
RASGEF1C-201ENST00000361132 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.12■■■■□ 3.69
RASGEF1C-201ENST00000361132 ABCC9O60706 1549 aa37.63■■■■□ 3.61
RASGEF1C-201ENST00000361132 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.45■■■■□ 3.59
RASGEF1C-201ENST00000361132 NACADO15069 1562 aa37.17■■■■□ 3.54
RASGEF1C-201ENST00000361132 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.13■■■■□ 3.53
RASGEF1C-201ENST00000361132 SCRIBQ14160 1630 aa37.03■■■■□ 3.52
RASGEF1C-201ENST00000361132 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.77■■■■□ 3.48
RASGEF1C-201ENST00000361132 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
RASGEF1C-201ENST00000361132 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.1■■■■□ 3.37
RASGEF1C-201ENST00000361132 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.02■■■■□ 3.36
RASGEF1C-201ENST00000361132 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.82■■■■□ 3.32
RASGEF1C-201ENST00000361132 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.71■■■■□ 3.31
RASGEF1C-201ENST00000361132 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.71■■■■□ 3.31
RASGEF1C-201ENST00000361132 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.69■■■■□ 3.3
RASGEF1C-201ENST00000361132 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
RASGEF1C-201ENST00000361132 WIZO95785 1651 aa35.57■■■■□ 3.28
RASGEF1C-201ENST00000361132 SMARCA4P51532 1647 aa35.45■■■■□ 3.27
RASGEF1C-201ENST00000361132 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
RASGEF1C-201ENST00000361132 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.91■■■■□ 3.18
RASGEF1C-201ENST00000361132 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.85■■■■□ 3.17
RASGEF1C-201ENST00000361132 SMARCA2P51531 1590 aa34.83■■■■□ 3.17
RASGEF1C-201ENST00000361132 TRIM41Q8WV44 630 aa34.78■■■■□ 3.16
RASGEF1C-201ENST00000361132 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.78■■■■□ 3.16
RASGEF1C-201ENST00000361132 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
RASGEF1C-201ENST00000361132 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.61■■■■□ 3.13
RASGEF1C-201ENST00000361132 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.47■■■■□ 3.11
RASGEF1C-201ENST00000361132 NCAPD3P42695 1498 aa34.35■■■■□ 3.09
RASGEF1C-201ENST00000361132 ABCC8Q09428 1581 aa34.32■■■■□ 3.09
RASGEF1C-201ENST00000361132 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
RASGEF1C-201ENST00000361132 HMGXB3Q12766 1538 aa34.29■■■■□ 3.08
RASGEF1C-201ENST00000361132 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.99■■■■□ 3.03
RASGEF1C-201ENST00000361132 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.98■■■■□ 3.036e-7■■■■■ 33.4
RASGEF1C-201ENST00000361132 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.89■■■■□ 3.02
RASGEF1C-201ENST00000361132 SYNJ1O43426 1573 aa33.82■■■■□ 3
RASGEF1C-201ENST00000361132 SOGA1O94964 1423 aa33.79■■■■□ 3
RASGEF1C-201ENST00000361132 CFTRP13569 1480 aa33.74■■■□□ 2.99
RASGEF1C-201ENST00000361132 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.67■■■□□ 2.98
RASGEF1C-201ENST00000361132 EEA1Q15075 1411 aa33.65■■■□□ 2.98
RASGEF1C-201ENST00000361132 TOP2BQ02880 1626 aa33.59■■■□□ 2.97
RASGEF1C-201ENST00000361132 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.58■■■□□ 2.97
RASGEF1C-201ENST00000361132 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.56■■■□□ 2.96
RASGEF1C-201ENST00000361132 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.52■■■□□ 2.96
RASGEF1C-201ENST00000361132 PRDM2Q13029 1718 aa33.51■■■□□ 2.95
RASGEF1C-201ENST00000361132 CUX1P39880 1505 aa33.44■■■□□ 2.94
RASGEF1C-201ENST00000361132 PCGF6Q9BYE7 350 aa33.38■■■□□ 2.93
RASGEF1C-201ENST00000361132 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.28■■■□□ 2.92
RASGEF1C-201ENST00000361132 GOLGA3Q08378 1498 aa33.28■■■□□ 2.92
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RASGEF1C-201ENST00000361132 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.22■■■□□ 2.91
RASGEF1C-201ENST00000361132 KIF21BO75037 1637 aa33.2■■■□□ 2.91
RASGEF1C-201ENST00000361132 NESP48681 1621 aa33.2■■■□□ 2.91
RASGEF1C-201ENST00000361132 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.2■■■□□ 2.91
RASGEF1C-201ENST00000361132 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.2■■■□□ 2.9
RASGEF1C-201ENST00000361132 CEP162Q5TB80 1403 aa33.17■■■□□ 2.9
RASGEF1C-201ENST00000361132 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP33.16■■■□□ 2.9
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RASGEF1C-201ENST00000361132 KIF27Q86VH2 1401 aa33.05■■■□□ 2.88
RASGEF1C-201ENST00000361132 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.05■■■□□ 2.88
RASGEF1C-201ENST00000361132 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33■■■□□ 2.87
RASGEF1C-201ENST00000361132 PRXQ9BXM0 1461 aa32.94■■■□□ 2.86
RASGEF1C-201ENST00000361132 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.93■■■□□ 2.86
RASGEF1C-201ENST00000361132 CUX2O14529 1486 aa32.91■■■□□ 2.86
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RASGEF1C-201ENST00000361132 TOPBP1Q92547 1522 aa32.89■■■□□ 2.85
RASGEF1C-201ENST00000361132 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.88■■■□□ 2.85
RASGEF1C-201ENST00000361132 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.86■■■□□ 2.85
RASGEF1C-201ENST00000361132 CLIP1P30622 1438 aa32.81■■■□□ 2.84
RASGEF1C-201ENST00000361132 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
RASGEF1C-201ENST00000361132 IGF1RP08069 1367 aa32.77■■■□□ 2.84
RASGEF1C-201ENST00000361132 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.77■■■□□ 2.84
RASGEF1C-201ENST00000361132 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.75■■■□□ 2.83
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RASGEF1C-201ENST00000361132 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.72■■■□□ 2.83
RASGEF1C-201ENST00000361132 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.71■■■□□ 2.83
RASGEF1C-201ENST00000361132 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.67■■■□□ 2.82
RASGEF1C-201ENST00000361132 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.61■■■□□ 2.81
RASGEF1C-201ENST00000361132 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.55■■■□□ 2.8
RASGEF1C-201ENST00000361132 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.53■■■□□ 2.8
RASGEF1C-201ENST00000361132 WDR97A6NE52 1622 aa32.48■■■□□ 2.79
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RASGEF1C-201ENST00000361132 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
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RASGEF1C-201ENST00000361132 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.35■■■□□ 2.77
RASGEF1C-201ENST00000361132 CUL7Q14999 1698 aa32.34■■■□□ 2.77
RASGEF1C-201ENST00000361132 APLP2Q06481 763 aa32.34■■■□□ 2.77
RASGEF1C-201ENST00000361132 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.33■■■□□ 2.77
RASGEF1C-201ENST00000361132 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.33■■■□□ 2.77
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RASGEF1C-201ENST00000361132 WDR62O43379 1518 aa32.18■■■□□ 2.74
RASGEF1C-201ENST00000361132 ERCC6Q03468 1493 aa32.18■■■□□ 2.74
RASGEF1C-201ENST00000361132 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.11■■■□□ 2.73
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RASGEF1C-201ENST00000361132 IFT140Q96RY7 1462 aa32.07■■■□□ 2.72
RASGEF1C-201ENST00000361132 PBRM1Q86U86 1689 aa32.06■■■□□ 2.72
RASGEF1C-201ENST00000361132 P3H3Q8IVL6 736 aa32.03■■■□□ 2.72
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