RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430704.6

SIMC1-204, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SIMC1, Length 1,925 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-204ENST00000430704 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.89■■■■■ 6.06
SIMC1-204ENST00000430704 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.64■■■■■ 5.06
SIMC1-204ENST00000430704 ABCC9O60706 1549 aa45.21■■■■■ 4.83
SIMC1-204ENST00000430704 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.2■■■■■ 4.67
SIMC1-204ENST00000430704 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.18■■■■■ 4.66
SIMC1-204ENST00000430704 NACADO15069 1562 aa43.7■■■■■ 4.59
SIMC1-204ENST00000430704 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.66■■■■■ 4.58
SIMC1-204ENST00000430704 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.63■■■■■ 4.57
SIMC1-204ENST00000430704 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.56■■■■■ 4.56
SIMC1-204ENST00000430704 SCRIBQ14160 1630 aa42.82■■■■■ 4.44
SIMC1-204ENST00000430704 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.76■■■■■ 4.44
SIMC1-204ENST00000430704 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.46■■■■■ 4.39
SIMC1-204ENST00000430704 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.42■■■■■ 4.38
SIMC1-204ENST00000430704 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.34■■■■■ 4.37
SIMC1-204ENST00000430704 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.23■■■■■ 4.19
SIMC1-204ENST00000430704 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
SIMC1-204ENST00000430704 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
SIMC1-204ENST00000430704 SMARCA4P51532 1647 aa40.92■■■■■ 4.14
SIMC1-204ENST00000430704 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.91■■■■■ 4.14
SIMC1-204ENST00000430704 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.87■■■■■ 4.13
SIMC1-204ENST00000430704 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.85■■■■■ 4.13
SIMC1-204ENST00000430704 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.59■■■■■ 4.09
SIMC1-204ENST00000430704 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.52■■■■■ 4.08
SIMC1-204ENST00000430704 WIZO95785 1651 aa40.48■■■■■ 4.07
SIMC1-204ENST00000430704 SMARCA2P51531 1590 aa40.45■■■■■ 4.07
SIMC1-204ENST00000430704 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.42■■■■■ 4.06
SIMC1-204ENST00000430704 NCAPD3P42695 1498 aa40.33■■■■■ 4.05
SIMC1-204ENST00000430704 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
SIMC1-204ENST00000430704 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
SIMC1-204ENST00000430704 HMGXB3Q12766 1538 aa40.19■■■■■ 4.02
SIMC1-204ENST00000430704 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.98■■■■□ 3.99
SIMC1-204ENST00000430704 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.57■■■■□ 3.92
SIMC1-204ENST00000430704 NESP48681 1621 aa39.34■■■■□ 3.89
SIMC1-204ENST00000430704 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.25■■■■□ 3.87
SIMC1-204ENST00000430704 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.18■■■■□ 3.86
SIMC1-204ENST00000430704 CFTRP13569 1480 aa39.14■■■■□ 3.86
SIMC1-204ENST00000430704 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.91■■■■□ 3.82
SIMC1-204ENST00000430704 PRDM2Q13029 1718 aa38.9■■■■□ 3.82
SIMC1-204ENST00000430704 ERCC6Q03468 1493 aa38.88■■■■□ 3.81
SIMC1-204ENST00000430704 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.86■■■■□ 3.81
SIMC1-204ENST00000430704 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.83■■■■□ 3.81
SIMC1-204ENST00000430704 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.71■■■■□ 3.79
SIMC1-204ENST00000430704 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.49■■■■□ 3.75
SIMC1-204ENST00000430704 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.48■■■■□ 3.75
SIMC1-204ENST00000430704 ABCC8Q09428 1581 aa38.42■■■■□ 3.74
SIMC1-204ENST00000430704 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.42■■■■□ 3.74
SIMC1-204ENST00000430704 WDR62O43379 1518 aa38.31■■■■□ 3.72
SIMC1-204ENST00000430704 TOPBP1Q92547 1522 aa38.28■■■■□ 3.72
SIMC1-204ENST00000430704 CUX1P39880 1505 aa38.27■■■■□ 3.72
SIMC1-204ENST00000430704 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.26■■■■□ 3.72
SIMC1-204ENST00000430704 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.26■■■■□ 3.72
SIMC1-204ENST00000430704 SYNJ1O43426 1573 aa38.17■■■■□ 3.7
SIMC1-204ENST00000430704 CUX2O14529 1486 aa38.08■■■■□ 3.69
SIMC1-204ENST00000430704 TOP2BQ02880 1626 aa38.07■■■■□ 3.69
SIMC1-204ENST00000430704 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.05■■■■□ 3.68
SIMC1-204ENST00000430704 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.04■■■■□ 3.68
SIMC1-204ENST00000430704 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.02■■■■□ 3.68
SIMC1-204ENST00000430704 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.91■■■■□ 3.66
SIMC1-204ENST00000430704 TRIM41Q8WV44 630 aa37.9■■■■□ 3.66
SIMC1-204ENST00000430704 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.87■■■■□ 3.65
SIMC1-204ENST00000430704 SOGA1O94964 1423 aa37.87■■■■□ 3.65
SIMC1-204ENST00000430704 IFT140Q96RY7 1462 aa37.82■■■■□ 3.65
SIMC1-204ENST00000430704 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.8■■■■□ 3.64
SIMC1-204ENST00000430704 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.72■■■■□ 3.63
SIMC1-204ENST00000430704 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.64■■■■□ 3.62
SIMC1-204ENST00000430704 WDR97A6NE52 1622 aa37.64■■■■□ 3.62
SIMC1-204ENST00000430704 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.63■■■■□ 3.62
SIMC1-204ENST00000430704 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.59■■■■□ 3.61
SIMC1-204ENST00000430704 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.55■■■■□ 3.6
SIMC1-204ENST00000430704 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.44■■■■□ 3.58
SIMC1-204ENST00000430704 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.44■■■■□ 3.58
SIMC1-204ENST00000430704 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.38■■■■□ 3.58
SIMC1-204ENST00000430704 KIF27Q86VH2 1401 aa37.38■■■■□ 3.57
SIMC1-204ENST00000430704 PBRM1Q86U86 1689 aa37.33■■■■□ 3.57
SIMC1-204ENST00000430704 GRIN2BQ13224 1484 aa37.31■■■■□ 3.56
SIMC1-204ENST00000430704 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.24■■■■□ 3.55
SIMC1-204ENST00000430704 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.23■■■■□ 3.55
SIMC1-204ENST00000430704 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.18■■■■□ 3.54
SIMC1-204ENST00000430704 IGF1RP08069 1367 aa37.17■■■■□ 3.54
SIMC1-204ENST00000430704 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.11■■■■□ 3.53
SIMC1-204ENST00000430704 FBLN2P98095 1184 aa37.09■■■■□ 3.53
SIMC1-204ENST00000430704 ADAMTS12P58397 1594 aa37.04■■■■□ 3.52
SIMC1-204ENST00000430704 EEA1Q15075 1411 aa37.03■■■■□ 3.52
SIMC1-204ENST00000430704 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37■■■■□ 3.51
SIMC1-204ENST00000430704 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37■■■■□ 3.51
SIMC1-204ENST00000430704 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.99■■■■□ 3.51
SIMC1-204ENST00000430704 SYNJ2O15056 1496 aa36.99■■■■□ 3.51
SIMC1-204ENST00000430704 CUL7Q14999 1698 aa36.98■■■■□ 3.51
SIMC1-204ENST00000430704 CHD1O14646 1710 aa36.98■■■■□ 3.51
SIMC1-204ENST00000430704 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.97■■■■□ 3.51
SIMC1-204ENST00000430704 GRIN2AQ12879 1464 aa36.85■■■■□ 3.49
SIMC1-204ENST00000430704 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.83■■■■□ 3.49
SIMC1-204ENST00000430704 PRXQ9BXM0 1461 aa36.83■■■■□ 3.49
SIMC1-204ENST00000430704 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.8■■■■□ 3.48
SIMC1-204ENST00000430704 OSCARQ8IYS5 282 aa36.73■■■■□ 3.47
SIMC1-204ENST00000430704 CEP170Q5SW79 1584 aa36.67■■■■□ 3.46
SIMC1-204ENST00000430704 KIF21BO75037 1637 aa36.66■■■■□ 3.46
SIMC1-204ENST00000430704 NUP160Q12769 1436 aa36.62■■■■□ 3.45
SIMC1-204ENST00000430704 GOLGA3Q08378 1498 aa36.53■■■■□ 3.44
SIMC1-204ENST00000430704 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.5■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms