RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430704.6

SIMC1-204, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SIMC1, Length 1,925 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-204ENST00000430704 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.89■■■■■ 6.06
SIMC1-204ENST00000430704 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.64■■■■■ 5.06
SIMC1-204ENST00000430704 ABCC9O60706 1549 aa45.21■■■■■ 4.83
SIMC1-204ENST00000430704 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.2■■■■■ 4.67
SIMC1-204ENST00000430704 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.18■■■■■ 4.66
SIMC1-204ENST00000430704 NACADO15069 1562 aa43.7■■■■■ 4.59
SIMC1-204ENST00000430704 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.66■■■■■ 4.58
SIMC1-204ENST00000430704 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.63■■■■■ 4.57
SIMC1-204ENST00000430704 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.56■■■■■ 4.56
SIMC1-204ENST00000430704 SCRIBQ14160 1630 aa42.82■■■■■ 4.44
SIMC1-204ENST00000430704 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.76■■■■■ 4.44
SIMC1-204ENST00000430704 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.46■■■■■ 4.39
SIMC1-204ENST00000430704 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.42■■■■■ 4.38
SIMC1-204ENST00000430704 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.34■■■■■ 4.37
SIMC1-204ENST00000430704 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.23■■■■■ 4.19
SIMC1-204ENST00000430704 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
SIMC1-204ENST00000430704 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
SIMC1-204ENST00000430704 SMARCA4P51532 1647 aa40.92■■■■■ 4.14
SIMC1-204ENST00000430704 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.91■■■■■ 4.14
SIMC1-204ENST00000430704 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.87■■■■■ 4.13
SIMC1-204ENST00000430704 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.85■■■■■ 4.13
SIMC1-204ENST00000430704 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.59■■■■■ 4.09
SIMC1-204ENST00000430704 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.52■■■■■ 4.08
SIMC1-204ENST00000430704 WIZO95785 1651 aa40.48■■■■■ 4.07
SIMC1-204ENST00000430704 SMARCA2P51531 1590 aa40.45■■■■■ 4.07
SIMC1-204ENST00000430704 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.42■■■■■ 4.06
SIMC1-204ENST00000430704 NCAPD3P42695 1498 aa40.33■■■■■ 4.05
SIMC1-204ENST00000430704 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
SIMC1-204ENST00000430704 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
SIMC1-204ENST00000430704 HMGXB3Q12766 1538 aa40.19■■■■■ 4.02
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SIMC1-204ENST00000430704 NESP48681 1621 aa39.34■■■■□ 3.89
SIMC1-204ENST00000430704 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.25■■■■□ 3.87
SIMC1-204ENST00000430704 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.18■■■■□ 3.86
SIMC1-204ENST00000430704 CFTRP13569 1480 aa39.14■■■■□ 3.86
SIMC1-204ENST00000430704 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.91■■■■□ 3.82
SIMC1-204ENST00000430704 PRDM2Q13029 1718 aa38.9■■■■□ 3.82
SIMC1-204ENST00000430704 ERCC6Q03468 1493 aa38.88■■■■□ 3.81
SIMC1-204ENST00000430704 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.86■■■■□ 3.81
SIMC1-204ENST00000430704 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.83■■■■□ 3.81
SIMC1-204ENST00000430704 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.71■■■■□ 3.79
SIMC1-204ENST00000430704 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.49■■■■□ 3.75
SIMC1-204ENST00000430704 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.48■■■■□ 3.75
SIMC1-204ENST00000430704 ABCC8Q09428 1581 aa38.42■■■■□ 3.74
SIMC1-204ENST00000430704 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.42■■■■□ 3.74
SIMC1-204ENST00000430704 WDR62O43379 1518 aa38.31■■■■□ 3.72
SIMC1-204ENST00000430704 TOPBP1Q92547 1522 aa38.28■■■■□ 3.72
SIMC1-204ENST00000430704 CUX1P39880 1505 aa38.27■■■■□ 3.72
SIMC1-204ENST00000430704 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.26■■■■□ 3.72
SIMC1-204ENST00000430704 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.26■■■■□ 3.72
SIMC1-204ENST00000430704 SYNJ1O43426 1573 aa38.17■■■■□ 3.7
SIMC1-204ENST00000430704 CUX2O14529 1486 aa38.08■■■■□ 3.69
SIMC1-204ENST00000430704 TOP2BQ02880 1626 aa38.07■■■■□ 3.69
SIMC1-204ENST00000430704 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.05■■■■□ 3.68
SIMC1-204ENST00000430704 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.04■■■■□ 3.68
SIMC1-204ENST00000430704 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.02■■■■□ 3.68
SIMC1-204ENST00000430704 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.91■■■■□ 3.66
SIMC1-204ENST00000430704 TRIM41Q8WV44 630 aa37.9■■■■□ 3.66
SIMC1-204ENST00000430704 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.87■■■■□ 3.65
SIMC1-204ENST00000430704 SOGA1O94964 1423 aa37.87■■■■□ 3.65
SIMC1-204ENST00000430704 IFT140Q96RY7 1462 aa37.82■■■■□ 3.65
SIMC1-204ENST00000430704 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.8■■■■□ 3.64
SIMC1-204ENST00000430704 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.72■■■■□ 3.63
SIMC1-204ENST00000430704 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.64■■■■□ 3.62
SIMC1-204ENST00000430704 WDR97A6NE52 1622 aa37.64■■■■□ 3.62
SIMC1-204ENST00000430704 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.63■■■■□ 3.62
SIMC1-204ENST00000430704 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.59■■■■□ 3.61
SIMC1-204ENST00000430704 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.55■■■■□ 3.6
SIMC1-204ENST00000430704 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.44■■■■□ 3.58
SIMC1-204ENST00000430704 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.44■■■■□ 3.58
SIMC1-204ENST00000430704 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.38■■■■□ 3.58
SIMC1-204ENST00000430704 KIF27Q86VH2 1401 aa37.38■■■■□ 3.57
SIMC1-204ENST00000430704 PBRM1Q86U86 1689 aa37.33■■■■□ 3.57
SIMC1-204ENST00000430704 GRIN2BQ13224 1484 aa37.31■■■■□ 3.56
SIMC1-204ENST00000430704 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.24■■■■□ 3.55
SIMC1-204ENST00000430704 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.23■■■■□ 3.55
SIMC1-204ENST00000430704 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.18■■■■□ 3.54
SIMC1-204ENST00000430704 IGF1RP08069 1367 aa37.17■■■■□ 3.54
SIMC1-204ENST00000430704 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.11■■■■□ 3.53
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SIMC1-204ENST00000430704 EEA1Q15075 1411 aa37.03■■■■□ 3.52
SIMC1-204ENST00000430704 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37■■■■□ 3.51
SIMC1-204ENST00000430704 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37■■■■□ 3.51
SIMC1-204ENST00000430704 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.99■■■■□ 3.51
SIMC1-204ENST00000430704 SYNJ2O15056 1496 aa36.99■■■■□ 3.51
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SIMC1-204ENST00000430704 CHD1O14646 1710 aa36.98■■■■□ 3.51
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SIMC1-204ENST00000430704 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.83■■■■□ 3.49
SIMC1-204ENST00000430704 PRXQ9BXM0 1461 aa36.83■■■■□ 3.49
SIMC1-204ENST00000430704 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.8■■■■□ 3.48
SIMC1-204ENST00000430704 OSCARQ8IYS5 282 aa36.73■■■■□ 3.47
SIMC1-204ENST00000430704 CEP170Q5SW79 1584 aa36.67■■■■□ 3.46
SIMC1-204ENST00000430704 KIF21BO75037 1637 aa36.66■■■■□ 3.46
SIMC1-204ENST00000430704 NUP160Q12769 1436 aa36.62■■■■□ 3.45
SIMC1-204ENST00000430704 GOLGA3Q08378 1498 aa36.53■■■■□ 3.44
SIMC1-204ENST00000430704 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.5■■■■□ 3.43
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