Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD5-AS1Q9Y6J3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD5-AS1Q9Y6J3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms