Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F9

WNT6, Protein Wnt-6, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT6Q9Y6F9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
WNT6Q9Y6F9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
WNT6Q9Y6F9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
WNT6Q9Y6F9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
WNT6Q9Y6F9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
WNT6Q9Y6F9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
WNT6Q9Y6F9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
WNT6Q9Y6F9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
WNT6Q9Y6F9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
WNT6Q9Y6F9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
WNT6Q9Y6F9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
WNT6Q9Y6F9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
WNT6Q9Y6F9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
WNT6Q9Y6F9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
WNT6Q9Y6F9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
WNT6Q9Y6F9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
WNT6Q9Y6F9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
WNT6Q9Y6F9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
WNT6Q9Y6F9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
WNT6Q9Y6F9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
WNT6Q9Y6F9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
WNT6Q9Y6F9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
WNT6Q9Y6F9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
WNT6Q9Y6F9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
WNT6Q9Y6F9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
WNT6Q9Y6F9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WNT6Q9Y6F9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
WNT6Q9Y6F9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
WNT6Q9Y6F9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
WNT6Q9Y6F9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WNT6Q9Y6F9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
WNT6Q9Y6F9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WNT6Q9Y6F9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WNT6Q9Y6F9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WNT6Q9Y6F9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WNT6Q9Y6F9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WNT6Q9Y6F9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WNT6Q9Y6F9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
WNT6Q9Y6F9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
WNT6Q9Y6F9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
WNT6Q9Y6F9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
WNT6Q9Y6F9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
WNT6Q9Y6F9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
WNT6Q9Y6F9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
WNT6Q9Y6F9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
WNT6Q9Y6F9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
WNT6Q9Y6F9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
WNT6Q9Y6F9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28■■■□□ 2.07
WNT6Q9Y6F9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
WNT6Q9Y6F9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
WNT6Q9Y6F9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
WNT6Q9Y6F9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
WNT6Q9Y6F9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
WNT6Q9Y6F9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
WNT6Q9Y6F9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
WNT6Q9Y6F9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
WNT6Q9Y6F9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
WNT6Q9Y6F9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
WNT6Q9Y6F9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
WNT6Q9Y6F9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
WNT6Q9Y6F9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
WNT6Q9Y6F9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
WNT6Q9Y6F9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
WNT6Q9Y6F9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
WNT6Q9Y6F9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
WNT6Q9Y6F9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
WNT6Q9Y6F9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
WNT6Q9Y6F9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
WNT6Q9Y6F9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
WNT6Q9Y6F9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
WNT6Q9Y6F9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
WNT6Q9Y6F9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
WNT6Q9Y6F9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
WNT6Q9Y6F9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
WNT6Q9Y6F9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
WNT6Q9Y6F9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
WNT6Q9Y6F9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
WNT6Q9Y6F9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
WNT6Q9Y6F9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
WNT6Q9Y6F9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
WNT6Q9Y6F9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
WNT6Q9Y6F9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
WNT6Q9Y6F9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
WNT6Q9Y6F9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
WNT6Q9Y6F9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
WNT6Q9Y6F9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
WNT6Q9Y6F9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
WNT6Q9Y6F9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
WNT6Q9Y6F9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
WNT6Q9Y6F9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
WNT6Q9Y6F9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
WNT6Q9Y6F9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
WNT6Q9Y6F9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
WNT6Q9Y6F9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
WNT6Q9Y6F9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
WNT6Q9Y6F9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
WNT6Q9Y6F9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
WNT6Q9Y6F9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
WNT6Q9Y6F9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
WNT6Q9Y6F9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms