Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MAD1L1Q9Y6D9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MAD1L1Q9Y6D9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MAD1L1Q9Y6D9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MAD1L1Q9Y6D9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MAD1L1Q9Y6D9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MAD1L1Q9Y6D9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MAD1L1Q9Y6D9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MAD1L1Q9Y6D9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MAD1L1Q9Y6D9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAD1L1Q9Y6D9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MAD1L1Q9Y6D9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MAD1L1Q9Y6D9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MAD1L1Q9Y6D9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAD1L1Q9Y6D9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAD1L1Q9Y6D9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAD1L1Q9Y6D9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MAD1L1Q9Y6D9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAD1L1Q9Y6D9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAD1L1Q9Y6D9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAD1L1Q9Y6D9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAD1L1Q9Y6D9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAD1L1Q9Y6D9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MAD1L1Q9Y6D9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MAD1L1Q9Y6D9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MAD1L1Q9Y6D9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MAD1L1Q9Y6D9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAD1L1Q9Y6D9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAD1L1Q9Y6D9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAD1L1Q9Y6D9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAD1L1Q9Y6D9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAD1L1Q9Y6D9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAD1L1Q9Y6D9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAD1L1Q9Y6D9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAD1L1Q9Y6D9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAD1L1Q9Y6D9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAD1L1Q9Y6D9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAD1L1Q9Y6D9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MAD1L1Q9Y6D9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MAD1L1Q9Y6D9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MAD1L1Q9Y6D9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MAD1L1Q9Y6D9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MAD1L1Q9Y6D9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MAD1L1Q9Y6D9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MAD1L1Q9Y6D9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MAD1L1Q9Y6D9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MAD1L1Q9Y6D9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MAD1L1Q9Y6D9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MAD1L1Q9Y6D9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAD1L1Q9Y6D9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAD1L1Q9Y6D9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAD1L1Q9Y6D9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAD1L1Q9Y6D9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
MAD1L1Q9Y6D9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MAD1L1Q9Y6D9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MAD1L1Q9Y6D9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MAD1L1Q9Y6D9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MAD1L1Q9Y6D9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MAD1L1Q9Y6D9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MAD1L1Q9Y6D9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MAD1L1Q9Y6D9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MAD1L1Q9Y6D9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MAD1L1Q9Y6D9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MAD1L1Q9Y6D9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MAD1L1Q9Y6D9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MAD1L1Q9Y6D9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MAD1L1Q9Y6D9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MAD1L1Q9Y6D9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MAD1L1Q9Y6D9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MAD1L1Q9Y6D9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MAD1L1Q9Y6D9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MAD1L1Q9Y6D9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MAD1L1Q9Y6D9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MAD1L1Q9Y6D9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAD1L1Q9Y6D9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAD1L1Q9Y6D9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MAD1L1Q9Y6D9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MAD1L1Q9Y6D9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MAD1L1Q9Y6D9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MAD1L1Q9Y6D9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MAD1L1Q9Y6D9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MAD1L1Q9Y6D9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MAD1L1Q9Y6D9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MAD1L1Q9Y6D9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MAD1L1Q9Y6D9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MAD1L1Q9Y6D9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MAD1L1Q9Y6D9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MAD1L1Q9Y6D9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MAD1L1Q9Y6D9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MAD1L1Q9Y6D9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MAD1L1Q9Y6D9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MAD1L1Q9Y6D9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MAD1L1Q9Y6D9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MAD1L1Q9Y6D9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MAD1L1Q9Y6D9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MAD1L1Q9Y6D9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MAD1L1Q9Y6D9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms