Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P2

CSAG2, Chondrosarcoma-associated gene 2/3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG2Q9Y5P2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSAG2Q9Y5P2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSAG2Q9Y5P2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSAG2Q9Y5P2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CSAG2Q9Y5P2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSAG2Q9Y5P2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSAG2Q9Y5P2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CSAG2Q9Y5P2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CSAG2Q9Y5P2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSAG2Q9Y5P2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSAG2Q9Y5P2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSAG2Q9Y5P2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSAG2Q9Y5P2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSAG2Q9Y5P2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSAG2Q9Y5P2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSAG2Q9Y5P2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSAG2Q9Y5P2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSAG2Q9Y5P2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSAG2Q9Y5P2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSAG2Q9Y5P2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSAG2Q9Y5P2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSAG2Q9Y5P2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSAG2Q9Y5P2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSAG2Q9Y5P2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSAG2Q9Y5P2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSAG2Q9Y5P2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSAG2Q9Y5P2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSAG2Q9Y5P2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSAG2Q9Y5P2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSAG2Q9Y5P2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSAG2Q9Y5P2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSAG2Q9Y5P2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSAG2Q9Y5P2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSAG2Q9Y5P2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSAG2Q9Y5P2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSAG2Q9Y5P2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSAG2Q9Y5P2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSAG2Q9Y5P2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSAG2Q9Y5P2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSAG2Q9Y5P2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSAG2Q9Y5P2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSAG2Q9Y5P2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSAG2Q9Y5P2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSAG2Q9Y5P2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSAG2Q9Y5P2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSAG2Q9Y5P2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSAG2Q9Y5P2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSAG2Q9Y5P2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSAG2Q9Y5P2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSAG2Q9Y5P2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSAG2Q9Y5P2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSAG2Q9Y5P2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSAG2Q9Y5P2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSAG2Q9Y5P2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSAG2Q9Y5P2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSAG2Q9Y5P2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSAG2Q9Y5P2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSAG2Q9Y5P2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSAG2Q9Y5P2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSAG2Q9Y5P2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSAG2Q9Y5P2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSAG2Q9Y5P2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CSAG2Q9Y5P2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSAG2Q9Y5P2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSAG2Q9Y5P2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSAG2Q9Y5P2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSAG2Q9Y5P2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSAG2Q9Y5P2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSAG2Q9Y5P2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSAG2Q9Y5P2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSAG2Q9Y5P2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSAG2Q9Y5P2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSAG2Q9Y5P2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSAG2Q9Y5P2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CSAG2Q9Y5P2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSAG2Q9Y5P2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSAG2Q9Y5P2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSAG2Q9Y5P2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSAG2Q9Y5P2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSAG2Q9Y5P2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSAG2Q9Y5P2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSAG2Q9Y5P2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSAG2Q9Y5P2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSAG2Q9Y5P2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSAG2Q9Y5P2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSAG2Q9Y5P2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSAG2Q9Y5P2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSAG2Q9Y5P2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSAG2Q9Y5P2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSAG2Q9Y5P2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSAG2Q9Y5P2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSAG2Q9Y5P2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSAG2Q9Y5P2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSAG2Q9Y5P2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSAG2Q9Y5P2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSAG2Q9Y5P2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSAG2Q9Y5P2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSAG2Q9Y5P2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CSAG2Q9Y5P2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSAG2Q9Y5P2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms