Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E1

PCDHB9, Protocadherin beta-9, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB9Q9Y5E1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB9Q9Y5E1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHB9Q9Y5E1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHB9Q9Y5E1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB9Q9Y5E1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB9Q9Y5E1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB9Q9Y5E1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHB9Q9Y5E1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHB9Q9Y5E1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHB9Q9Y5E1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHB9Q9Y5E1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHB9Q9Y5E1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHB9Q9Y5E1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PCDHB9Q9Y5E1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHB9Q9Y5E1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHB9Q9Y5E1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHB9Q9Y5E1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHB9Q9Y5E1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PCDHB9Q9Y5E1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHB9Q9Y5E1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHB9Q9Y5E1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB9Q9Y5E1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHB9Q9Y5E1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHB9Q9Y5E1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHB9Q9Y5E1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHB9Q9Y5E1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB9Q9Y5E1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB9Q9Y5E1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB9Q9Y5E1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB9Q9Y5E1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB9Q9Y5E1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB9Q9Y5E1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHB9Q9Y5E1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHB9Q9Y5E1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB9Q9Y5E1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB9Q9Y5E1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB9Q9Y5E1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHB9Q9Y5E1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHB9Q9Y5E1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHB9Q9Y5E1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHB9Q9Y5E1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHB9Q9Y5E1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHB9Q9Y5E1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHB9Q9Y5E1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHB9Q9Y5E1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHB9Q9Y5E1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHB9Q9Y5E1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHB9Q9Y5E1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHB9Q9Y5E1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHB9Q9Y5E1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB9Q9Y5E1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB9Q9Y5E1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB9Q9Y5E1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB9Q9Y5E1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDHB9Q9Y5E1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHB9Q9Y5E1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHB9Q9Y5E1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHB9Q9Y5E1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHB9Q9Y5E1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB9Q9Y5E1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB9Q9Y5E1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHB9Q9Y5E1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHB9Q9Y5E1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHB9Q9Y5E1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHB9Q9Y5E1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHB9Q9Y5E1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHB9Q9Y5E1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHB9Q9Y5E1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHB9Q9Y5E1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHB9Q9Y5E1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHB9Q9Y5E1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDHB9Q9Y5E1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHB9Q9Y5E1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHB9Q9Y5E1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHB9Q9Y5E1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHB9Q9Y5E1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHB9Q9Y5E1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDHB9Q9Y5E1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDHB9Q9Y5E1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDHB9Q9Y5E1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHB9Q9Y5E1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHB9Q9Y5E1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHB9Q9Y5E1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDHB9Q9Y5E1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDHB9Q9Y5E1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHB9Q9Y5E1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHB9Q9Y5E1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB9Q9Y5E1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB9Q9Y5E1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB9Q9Y5E1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDHB9Q9Y5E1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDHB9Q9Y5E1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHB9Q9Y5E1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHB9Q9Y5E1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDHB9Q9Y5E1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHB9Q9Y5E1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHB9Q9Y5E1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHB9Q9Y5E1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHB9Q9Y5E1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHB9Q9Y5E1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms