Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J0

RPH3A, Rabphilin-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPH3AQ9Y2J0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPH3AQ9Y2J0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPH3AQ9Y2J0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPH3AQ9Y2J0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPH3AQ9Y2J0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RPH3AQ9Y2J0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPH3AQ9Y2J0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPH3AQ9Y2J0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RPH3AQ9Y2J0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPH3AQ9Y2J0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPH3AQ9Y2J0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPH3AQ9Y2J0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPH3AQ9Y2J0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPH3AQ9Y2J0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPH3AQ9Y2J0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPH3AQ9Y2J0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPH3AQ9Y2J0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RPH3AQ9Y2J0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPH3AQ9Y2J0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPH3AQ9Y2J0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPH3AQ9Y2J0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPH3AQ9Y2J0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPH3AQ9Y2J0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPH3AQ9Y2J0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPH3AQ9Y2J0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPH3AQ9Y2J0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPH3AQ9Y2J0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPH3AQ9Y2J0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPH3AQ9Y2J0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPH3AQ9Y2J0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPH3AQ9Y2J0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPH3AQ9Y2J0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPH3AQ9Y2J0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPH3AQ9Y2J0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPH3AQ9Y2J0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPH3AQ9Y2J0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPH3AQ9Y2J0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPH3AQ9Y2J0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPH3AQ9Y2J0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPH3AQ9Y2J0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPH3AQ9Y2J0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPH3AQ9Y2J0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPH3AQ9Y2J0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPH3AQ9Y2J0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPH3AQ9Y2J0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPH3AQ9Y2J0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPH3AQ9Y2J0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPH3AQ9Y2J0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPH3AQ9Y2J0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPH3AQ9Y2J0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPH3AQ9Y2J0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPH3AQ9Y2J0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPH3AQ9Y2J0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPH3AQ9Y2J0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPH3AQ9Y2J0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPH3AQ9Y2J0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPH3AQ9Y2J0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPH3AQ9Y2J0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPH3AQ9Y2J0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPH3AQ9Y2J0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPH3AQ9Y2J0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RPH3AQ9Y2J0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPH3AQ9Y2J0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPH3AQ9Y2J0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPH3AQ9Y2J0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RPH3AQ9Y2J0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPH3AQ9Y2J0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPH3AQ9Y2J0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPH3AQ9Y2J0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPH3AQ9Y2J0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPH3AQ9Y2J0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPH3AQ9Y2J0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPH3AQ9Y2J0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPH3AQ9Y2J0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPH3AQ9Y2J0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPH3AQ9Y2J0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPH3AQ9Y2J0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPH3AQ9Y2J0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPH3AQ9Y2J0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPH3AQ9Y2J0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPH3AQ9Y2J0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RPH3AQ9Y2J0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPH3AQ9Y2J0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPH3AQ9Y2J0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RPH3AQ9Y2J0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPH3AQ9Y2J0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RPH3AQ9Y2J0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPH3AQ9Y2J0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPH3AQ9Y2J0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPH3AQ9Y2J0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPH3AQ9Y2J0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RPH3AQ9Y2J0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPH3AQ9Y2J0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPH3AQ9Y2J0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPH3AQ9Y2J0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPH3AQ9Y2J0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPH3AQ9Y2J0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPH3AQ9Y2J0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPH3AQ9Y2J0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPH3AQ9Y2J0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms