Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CTNND2Q9UQB3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CTNND2Q9UQB3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CTNND2Q9UQB3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CTNND2Q9UQB3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CTNND2Q9UQB3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CTNND2Q9UQB3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CTNND2Q9UQB3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CTNND2Q9UQB3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CTNND2Q9UQB3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CTNND2Q9UQB3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CTNND2Q9UQB3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CTNND2Q9UQB3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CTNND2Q9UQB3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CTNND2Q9UQB3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CTNND2Q9UQB3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CTNND2Q9UQB3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CTNND2Q9UQB3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CTNND2Q9UQB3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CTNND2Q9UQB3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CTNND2Q9UQB3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CTNND2Q9UQB3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CTNND2Q9UQB3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CTNND2Q9UQB3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CTNND2Q9UQB3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CTNND2Q9UQB3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CTNND2Q9UQB3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CTNND2Q9UQB3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CTNND2Q9UQB3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CTNND2Q9UQB3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CTNND2Q9UQB3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CTNND2Q9UQB3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTNND2Q9UQB3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTNND2Q9UQB3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CTNND2Q9UQB3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTNND2Q9UQB3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTNND2Q9UQB3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTNND2Q9UQB3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTNND2Q9UQB3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CTNND2Q9UQB3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CTNND2Q9UQB3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTNND2Q9UQB3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTNND2Q9UQB3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTNND2Q9UQB3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTNND2Q9UQB3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTNND2Q9UQB3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTNND2Q9UQB3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTNND2Q9UQB3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTNND2Q9UQB3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CTNND2Q9UQB3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CTNND2Q9UQB3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CTNND2Q9UQB3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CTNND2Q9UQB3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CTNND2Q9UQB3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTNND2Q9UQB3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTNND2Q9UQB3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTNND2Q9UQB3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTNND2Q9UQB3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CTNND2Q9UQB3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTNND2Q9UQB3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTNND2Q9UQB3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTNND2Q9UQB3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTNND2Q9UQB3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTNND2Q9UQB3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CTNND2Q9UQB3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTNND2Q9UQB3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTNND2Q9UQB3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CTNND2Q9UQB3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CTNND2Q9UQB3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CTNND2Q9UQB3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CTNND2Q9UQB3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CTNND2Q9UQB3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CTNND2Q9UQB3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CTNND2Q9UQB3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CTNND2Q9UQB3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CTNND2Q9UQB3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CTNND2Q9UQB3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CTNND2Q9UQB3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CTNND2Q9UQB3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CTNND2Q9UQB3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CTNND2Q9UQB3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
CTNND2Q9UQB3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CTNND2Q9UQB3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CTNND2Q9UQB3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CTNND2Q9UQB3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CTNND2Q9UQB3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CTNND2Q9UQB3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CTNND2Q9UQB3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CTNND2Q9UQB3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CTNND2Q9UQB3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CTNND2Q9UQB3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CTNND2Q9UQB3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CTNND2Q9UQB3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CTNND2Q9UQB3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CTNND2Q9UQB3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CTNND2Q9UQB3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CTNND2Q9UQB3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CTNND2Q9UQB3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CTNND2Q9UQB3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CTNND2Q9UQB3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms