Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
AGAP1Q9UPQ3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
AGAP1Q9UPQ3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
AGAP1Q9UPQ3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
AGAP1Q9UPQ3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
AGAP1Q9UPQ3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
AGAP1Q9UPQ3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
AGAP1Q9UPQ3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
AGAP1Q9UPQ3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
AGAP1Q9UPQ3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
AGAP1Q9UPQ3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
AGAP1Q9UPQ3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
AGAP1Q9UPQ3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
AGAP1Q9UPQ3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
AGAP1Q9UPQ3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
AGAP1Q9UPQ3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
AGAP1Q9UPQ3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
AGAP1Q9UPQ3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
AGAP1Q9UPQ3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
AGAP1Q9UPQ3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
AGAP1Q9UPQ3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
AGAP1Q9UPQ3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
AGAP1Q9UPQ3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
AGAP1Q9UPQ3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
AGAP1Q9UPQ3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
AGAP1Q9UPQ3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
AGAP1Q9UPQ3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
AGAP1Q9UPQ3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
AGAP1Q9UPQ3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
AGAP1Q9UPQ3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
AGAP1Q9UPQ3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
AGAP1Q9UPQ3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
AGAP1Q9UPQ3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
AGAP1Q9UPQ3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
AGAP1Q9UPQ3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
AGAP1Q9UPQ3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
AGAP1Q9UPQ3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
AGAP1Q9UPQ3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
AGAP1Q9UPQ3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
AGAP1Q9UPQ3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
AGAP1Q9UPQ3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
AGAP1Q9UPQ3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
AGAP1Q9UPQ3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
AGAP1Q9UPQ3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
AGAP1Q9UPQ3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
AGAP1Q9UPQ3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AGAP1Q9UPQ3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AGAP1Q9UPQ3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
AGAP1Q9UPQ3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
AGAP1Q9UPQ3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
AGAP1Q9UPQ3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
AGAP1Q9UPQ3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
AGAP1Q9UPQ3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
AGAP1Q9UPQ3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
AGAP1Q9UPQ3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
AGAP1Q9UPQ3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
AGAP1Q9UPQ3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
AGAP1Q9UPQ3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
AGAP1Q9UPQ3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
AGAP1Q9UPQ3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
AGAP1Q9UPQ3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
AGAP1Q9UPQ3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
AGAP1Q9UPQ3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
AGAP1Q9UPQ3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
AGAP1Q9UPQ3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AGAP1Q9UPQ3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
AGAP1Q9UPQ3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AGAP1Q9UPQ3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AGAP1Q9UPQ3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AGAP1Q9UPQ3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
AGAP1Q9UPQ3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
AGAP1Q9UPQ3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
AGAP1Q9UPQ3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AGAP1Q9UPQ3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
AGAP1Q9UPQ3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
AGAP1Q9UPQ3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
AGAP1Q9UPQ3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
AGAP1Q9UPQ3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AGAP1Q9UPQ3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
AGAP1Q9UPQ3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
AGAP1Q9UPQ3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AGAP1Q9UPQ3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
AGAP1Q9UPQ3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
AGAP1Q9UPQ3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AGAP1Q9UPQ3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AGAP1Q9UPQ3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AGAP1Q9UPQ3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AGAP1Q9UPQ3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
AGAP1Q9UPQ3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AGAP1Q9UPQ3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
AGAP1Q9UPQ3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
AGAP1Q9UPQ3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
AGAP1Q9UPQ3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
AGAP1Q9UPQ3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
AGAP1Q9UPQ3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AGAP1Q9UPQ3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
AGAP1Q9UPQ3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AGAP1Q9UPQ3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
AGAP1Q9UPQ3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AGAP1Q9UPQ3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms