Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX7Q9UNH6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX7Q9UNH6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX7Q9UNH6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX7Q9UNH6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX7Q9UNH6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SNX7Q9UNH6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SNX7Q9UNH6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX7Q9UNH6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX7Q9UNH6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX7Q9UNH6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX7Q9UNH6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX7Q9UNH6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX7Q9UNH6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX7Q9UNH6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX7Q9UNH6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX7Q9UNH6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX7Q9UNH6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX7Q9UNH6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX7Q9UNH6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX7Q9UNH6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX7Q9UNH6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX7Q9UNH6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX7Q9UNH6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX7Q9UNH6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX7Q9UNH6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX7Q9UNH6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX7Q9UNH6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX7Q9UNH6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX7Q9UNH6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX7Q9UNH6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX7Q9UNH6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX7Q9UNH6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX7Q9UNH6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX7Q9UNH6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX7Q9UNH6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX7Q9UNH6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX7Q9UNH6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX7Q9UNH6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX7Q9UNH6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX7Q9UNH6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX7Q9UNH6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX7Q9UNH6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX7Q9UNH6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX7Q9UNH6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX7Q9UNH6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX7Q9UNH6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX7Q9UNH6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX7Q9UNH6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX7Q9UNH6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX7Q9UNH6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX7Q9UNH6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX7Q9UNH6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX7Q9UNH6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX7Q9UNH6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX7Q9UNH6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX7Q9UNH6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX7Q9UNH6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX7Q9UNH6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX7Q9UNH6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX7Q9UNH6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX7Q9UNH6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX7Q9UNH6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX7Q9UNH6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX7Q9UNH6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX7Q9UNH6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX7Q9UNH6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX7Q9UNH6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX7Q9UNH6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX7Q9UNH6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX7Q9UNH6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX7Q9UNH6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX7Q9UNH6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX7Q9UNH6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX7Q9UNH6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX7Q9UNH6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX7Q9UNH6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX7Q9UNH6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX7Q9UNH6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX7Q9UNH6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX7Q9UNH6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX7Q9UNH6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX7Q9UNH6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX7Q9UNH6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX7Q9UNH6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX7Q9UNH6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX7Q9UNH6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX7Q9UNH6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX7Q9UNH6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX7Q9UNH6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX7Q9UNH6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX7Q9UNH6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX7Q9UNH6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX7Q9UNH6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX7Q9UNH6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX7Q9UNH6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX7Q9UNH6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX7Q9UNH6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX7Q9UNH6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX7Q9UNH6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms