Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PADI4Q9UM07 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PADI4Q9UM07 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PADI4Q9UM07 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PADI4Q9UM07 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PADI4Q9UM07 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PADI4Q9UM07 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PADI4Q9UM07 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PADI4Q9UM07 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PADI4Q9UM07 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PADI4Q9UM07 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PADI4Q9UM07 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PADI4Q9UM07 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PADI4Q9UM07 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PADI4Q9UM07 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PADI4Q9UM07 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PADI4Q9UM07 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PADI4Q9UM07 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PADI4Q9UM07 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PADI4Q9UM07 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PADI4Q9UM07 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PADI4Q9UM07 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PADI4Q9UM07 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PADI4Q9UM07 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PADI4Q9UM07 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PADI4Q9UM07 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PADI4Q9UM07 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PADI4Q9UM07 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PADI4Q9UM07 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PADI4Q9UM07 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PADI4Q9UM07 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PADI4Q9UM07 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PADI4Q9UM07 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PADI4Q9UM07 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PADI4Q9UM07 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PADI4Q9UM07 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PADI4Q9UM07 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PADI4Q9UM07 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PADI4Q9UM07 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PADI4Q9UM07 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PADI4Q9UM07 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PADI4Q9UM07 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PADI4Q9UM07 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PADI4Q9UM07 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PADI4Q9UM07 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PADI4Q9UM07 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PADI4Q9UM07 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PADI4Q9UM07 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PADI4Q9UM07 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PADI4Q9UM07 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PADI4Q9UM07 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PADI4Q9UM07 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PADI4Q9UM07 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PADI4Q9UM07 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PADI4Q9UM07 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PADI4Q9UM07 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PADI4Q9UM07 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PADI4Q9UM07 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PADI4Q9UM07 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PADI4Q9UM07 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PADI4Q9UM07 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PADI4Q9UM07 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PADI4Q9UM07 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PADI4Q9UM07 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PADI4Q9UM07 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PADI4Q9UM07 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PADI4Q9UM07 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PADI4Q9UM07 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PADI4Q9UM07 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PADI4Q9UM07 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PADI4Q9UM07 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PADI4Q9UM07 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PADI4Q9UM07 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PADI4Q9UM07 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PADI4Q9UM07 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PADI4Q9UM07 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PADI4Q9UM07 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PADI4Q9UM07 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PADI4Q9UM07 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PADI4Q9UM07 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PADI4Q9UM07 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PADI4Q9UM07 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PADI4Q9UM07 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PADI4Q9UM07 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PADI4Q9UM07 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PADI4Q9UM07 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PADI4Q9UM07 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PADI4Q9UM07 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PADI4Q9UM07 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PADI4Q9UM07 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PADI4Q9UM07 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PADI4Q9UM07 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PADI4Q9UM07 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PADI4Q9UM07 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PADI4Q9UM07 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PADI4Q9UM07 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PADI4Q9UM07 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PADI4Q9UM07 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PADI4Q9UM07 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PADI4Q9UM07 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms