Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM00

TMCO1, Calcium load-activated calcium channel, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO1Q9UM00 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMCO1Q9UM00 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMCO1Q9UM00 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMCO1Q9UM00 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMCO1Q9UM00 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMCO1Q9UM00 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMCO1Q9UM00 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMCO1Q9UM00 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMCO1Q9UM00 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMCO1Q9UM00 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMCO1Q9UM00 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMCO1Q9UM00 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMCO1Q9UM00 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMCO1Q9UM00 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMCO1Q9UM00 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMCO1Q9UM00 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMCO1Q9UM00 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMCO1Q9UM00 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMCO1Q9UM00 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMCO1Q9UM00 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMCO1Q9UM00 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMCO1Q9UM00 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMCO1Q9UM00 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMCO1Q9UM00 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMCO1Q9UM00 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMCO1Q9UM00 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMCO1Q9UM00 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMCO1Q9UM00 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMCO1Q9UM00 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMCO1Q9UM00 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMCO1Q9UM00 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMCO1Q9UM00 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMCO1Q9UM00 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMCO1Q9UM00 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMCO1Q9UM00 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMCO1Q9UM00 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMCO1Q9UM00 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMCO1Q9UM00 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMCO1Q9UM00 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMCO1Q9UM00 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMCO1Q9UM00 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMCO1Q9UM00 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMCO1Q9UM00 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMCO1Q9UM00 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMCO1Q9UM00 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMCO1Q9UM00 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMCO1Q9UM00 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMCO1Q9UM00 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMCO1Q9UM00 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMCO1Q9UM00 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMCO1Q9UM00 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMCO1Q9UM00 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMCO1Q9UM00 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMCO1Q9UM00 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMCO1Q9UM00 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMCO1Q9UM00 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TMCO1Q9UM00 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMCO1Q9UM00 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMCO1Q9UM00 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMCO1Q9UM00 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMCO1Q9UM00 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMCO1Q9UM00 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMCO1Q9UM00 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMCO1Q9UM00 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMCO1Q9UM00 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMCO1Q9UM00 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMCO1Q9UM00 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMCO1Q9UM00 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMCO1Q9UM00 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMCO1Q9UM00 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMCO1Q9UM00 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMCO1Q9UM00 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMCO1Q9UM00 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMCO1Q9UM00 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMCO1Q9UM00 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMCO1Q9UM00 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMCO1Q9UM00 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMCO1Q9UM00 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMCO1Q9UM00 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMCO1Q9UM00 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMCO1Q9UM00 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMCO1Q9UM00 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMCO1Q9UM00 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMCO1Q9UM00 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMCO1Q9UM00 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMCO1Q9UM00 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMCO1Q9UM00 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMCO1Q9UM00 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMCO1Q9UM00 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMCO1Q9UM00 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMCO1Q9UM00 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMCO1Q9UM00 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMCO1Q9UM00 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMCO1Q9UM00 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TMCO1Q9UM00 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMCO1Q9UM00 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMCO1Q9UM00 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TMCO1Q9UM00 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMCO1Q9UM00 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMCO1Q9UM00 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms