Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULX5

RNF112, RING finger protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF112Q9ULX5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF112Q9ULX5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF112Q9ULX5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF112Q9ULX5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF112Q9ULX5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF112Q9ULX5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF112Q9ULX5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF112Q9ULX5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF112Q9ULX5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF112Q9ULX5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF112Q9ULX5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF112Q9ULX5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RNF112Q9ULX5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF112Q9ULX5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF112Q9ULX5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF112Q9ULX5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF112Q9ULX5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF112Q9ULX5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF112Q9ULX5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF112Q9ULX5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF112Q9ULX5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF112Q9ULX5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF112Q9ULX5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF112Q9ULX5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF112Q9ULX5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF112Q9ULX5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF112Q9ULX5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF112Q9ULX5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF112Q9ULX5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF112Q9ULX5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF112Q9ULX5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF112Q9ULX5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF112Q9ULX5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF112Q9ULX5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF112Q9ULX5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF112Q9ULX5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF112Q9ULX5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RNF112Q9ULX5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RNF112Q9ULX5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF112Q9ULX5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF112Q9ULX5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF112Q9ULX5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF112Q9ULX5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF112Q9ULX5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF112Q9ULX5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF112Q9ULX5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF112Q9ULX5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF112Q9ULX5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF112Q9ULX5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF112Q9ULX5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF112Q9ULX5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF112Q9ULX5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RNF112Q9ULX5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RNF112Q9ULX5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RNF112Q9ULX5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF112Q9ULX5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF112Q9ULX5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF112Q9ULX5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF112Q9ULX5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF112Q9ULX5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF112Q9ULX5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF112Q9ULX5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF112Q9ULX5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF112Q9ULX5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF112Q9ULX5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF112Q9ULX5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF112Q9ULX5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF112Q9ULX5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF112Q9ULX5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF112Q9ULX5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF112Q9ULX5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF112Q9ULX5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF112Q9ULX5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF112Q9ULX5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF112Q9ULX5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF112Q9ULX5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF112Q9ULX5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF112Q9ULX5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF112Q9ULX5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF112Q9ULX5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF112Q9ULX5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF112Q9ULX5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF112Q9ULX5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF112Q9ULX5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF112Q9ULX5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF112Q9ULX5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF112Q9ULX5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF112Q9ULX5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF112Q9ULX5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF112Q9ULX5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF112Q9ULX5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF112Q9ULX5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF112Q9ULX5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF112Q9ULX5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF112Q9ULX5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF112Q9ULX5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF112Q9ULX5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF112Q9ULX5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF112Q9ULX5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF112Q9ULX5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms