Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC13A4Q9UKG4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC13A4Q9UKG4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC13A4Q9UKG4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC13A4Q9UKG4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC13A4Q9UKG4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC13A4Q9UKG4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC13A4Q9UKG4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC13A4Q9UKG4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC13A4Q9UKG4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC13A4Q9UKG4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC13A4Q9UKG4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC13A4Q9UKG4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC13A4Q9UKG4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC13A4Q9UKG4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC13A4Q9UKG4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC13A4Q9UKG4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC13A4Q9UKG4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC13A4Q9UKG4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC13A4Q9UKG4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC13A4Q9UKG4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC13A4Q9UKG4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC13A4Q9UKG4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC13A4Q9UKG4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC13A4Q9UKG4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC13A4Q9UKG4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC13A4Q9UKG4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC13A4Q9UKG4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC13A4Q9UKG4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC13A4Q9UKG4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC13A4Q9UKG4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC13A4Q9UKG4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC13A4Q9UKG4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC13A4Q9UKG4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC13A4Q9UKG4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC13A4Q9UKG4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC13A4Q9UKG4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC13A4Q9UKG4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC13A4Q9UKG4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC13A4Q9UKG4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC13A4Q9UKG4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC13A4Q9UKG4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC13A4Q9UKG4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC13A4Q9UKG4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC13A4Q9UKG4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC13A4Q9UKG4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC13A4Q9UKG4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC13A4Q9UKG4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC13A4Q9UKG4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC13A4Q9UKG4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC13A4Q9UKG4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC13A4Q9UKG4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC13A4Q9UKG4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC13A4Q9UKG4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC13A4Q9UKG4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC13A4Q9UKG4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC13A4Q9UKG4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC13A4Q9UKG4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC13A4Q9UKG4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC13A4Q9UKG4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC13A4Q9UKG4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC13A4Q9UKG4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC13A4Q9UKG4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC13A4Q9UKG4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC13A4Q9UKG4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC13A4Q9UKG4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC13A4Q9UKG4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC13A4Q9UKG4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC13A4Q9UKG4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC13A4Q9UKG4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC13A4Q9UKG4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC13A4Q9UKG4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC13A4Q9UKG4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC13A4Q9UKG4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC13A4Q9UKG4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC13A4Q9UKG4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC13A4Q9UKG4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC13A4Q9UKG4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC13A4Q9UKG4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC13A4Q9UKG4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC13A4Q9UKG4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC13A4Q9UKG4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC13A4Q9UKG4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC13A4Q9UKG4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC13A4Q9UKG4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC13A4Q9UKG4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC13A4Q9UKG4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC13A4Q9UKG4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC13A4Q9UKG4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC13A4Q9UKG4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC13A4Q9UKG4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC13A4Q9UKG4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC13A4Q9UKG4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC13A4Q9UKG4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC13A4Q9UKG4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC13A4Q9UKG4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC13A4Q9UKG4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC13A4Q9UKG4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC13A4Q9UKG4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC13A4Q9UKG4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms