Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIC8

LCMT1, Leucine carboxyl methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCMT1Q9UIC8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LCMT1Q9UIC8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LCMT1Q9UIC8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LCMT1Q9UIC8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LCMT1Q9UIC8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LCMT1Q9UIC8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LCMT1Q9UIC8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LCMT1Q9UIC8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LCMT1Q9UIC8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LCMT1Q9UIC8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LCMT1Q9UIC8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LCMT1Q9UIC8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LCMT1Q9UIC8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LCMT1Q9UIC8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LCMT1Q9UIC8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LCMT1Q9UIC8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LCMT1Q9UIC8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LCMT1Q9UIC8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LCMT1Q9UIC8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LCMT1Q9UIC8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LCMT1Q9UIC8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LCMT1Q9UIC8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LCMT1Q9UIC8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LCMT1Q9UIC8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LCMT1Q9UIC8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LCMT1Q9UIC8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LCMT1Q9UIC8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LCMT1Q9UIC8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LCMT1Q9UIC8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LCMT1Q9UIC8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LCMT1Q9UIC8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LCMT1Q9UIC8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LCMT1Q9UIC8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LCMT1Q9UIC8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LCMT1Q9UIC8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LCMT1Q9UIC8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LCMT1Q9UIC8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LCMT1Q9UIC8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LCMT1Q9UIC8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LCMT1Q9UIC8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LCMT1Q9UIC8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LCMT1Q9UIC8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LCMT1Q9UIC8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LCMT1Q9UIC8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LCMT1Q9UIC8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LCMT1Q9UIC8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LCMT1Q9UIC8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LCMT1Q9UIC8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LCMT1Q9UIC8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LCMT1Q9UIC8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LCMT1Q9UIC8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
LCMT1Q9UIC8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LCMT1Q9UIC8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LCMT1Q9UIC8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
LCMT1Q9UIC8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LCMT1Q9UIC8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LCMT1Q9UIC8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LCMT1Q9UIC8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LCMT1Q9UIC8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LCMT1Q9UIC8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LCMT1Q9UIC8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LCMT1Q9UIC8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LCMT1Q9UIC8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LCMT1Q9UIC8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LCMT1Q9UIC8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LCMT1Q9UIC8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LCMT1Q9UIC8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LCMT1Q9UIC8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LCMT1Q9UIC8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LCMT1Q9UIC8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LCMT1Q9UIC8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LCMT1Q9UIC8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LCMT1Q9UIC8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LCMT1Q9UIC8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LCMT1Q9UIC8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LCMT1Q9UIC8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LCMT1Q9UIC8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LCMT1Q9UIC8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LCMT1Q9UIC8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LCMT1Q9UIC8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LCMT1Q9UIC8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LCMT1Q9UIC8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LCMT1Q9UIC8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LCMT1Q9UIC8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LCMT1Q9UIC8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LCMT1Q9UIC8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LCMT1Q9UIC8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LCMT1Q9UIC8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LCMT1Q9UIC8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LCMT1Q9UIC8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LCMT1Q9UIC8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LCMT1Q9UIC8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LCMT1Q9UIC8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LCMT1Q9UIC8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LCMT1Q9UIC8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LCMT1Q9UIC8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LCMT1Q9UIC8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LCMT1Q9UIC8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LCMT1Q9UIC8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LCMT1Q9UIC8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms