Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PUF60Q9UHX1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PUF60Q9UHX1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PUF60Q9UHX1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PUF60Q9UHX1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PUF60Q9UHX1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PUF60Q9UHX1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PUF60Q9UHX1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PUF60Q9UHX1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PUF60Q9UHX1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PUF60Q9UHX1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PUF60Q9UHX1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PUF60Q9UHX1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PUF60Q9UHX1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PUF60Q9UHX1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PUF60Q9UHX1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PUF60Q9UHX1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PUF60Q9UHX1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PUF60Q9UHX1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PUF60Q9UHX1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PUF60Q9UHX1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PUF60Q9UHX1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PUF60Q9UHX1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PUF60Q9UHX1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PUF60Q9UHX1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PUF60Q9UHX1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PUF60Q9UHX1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PUF60Q9UHX1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PUF60Q9UHX1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PUF60Q9UHX1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PUF60Q9UHX1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PUF60Q9UHX1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PUF60Q9UHX1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PUF60Q9UHX1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PUF60Q9UHX1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PUF60Q9UHX1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PUF60Q9UHX1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PUF60Q9UHX1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PUF60Q9UHX1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PUF60Q9UHX1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PUF60Q9UHX1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PUF60Q9UHX1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PUF60Q9UHX1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PUF60Q9UHX1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PUF60Q9UHX1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PUF60Q9UHX1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PUF60Q9UHX1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PUF60Q9UHX1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PUF60Q9UHX1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PUF60Q9UHX1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PUF60Q9UHX1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PUF60Q9UHX1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PUF60Q9UHX1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PUF60Q9UHX1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PUF60Q9UHX1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PUF60Q9UHX1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PUF60Q9UHX1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PUF60Q9UHX1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PUF60Q9UHX1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PUF60Q9UHX1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PUF60Q9UHX1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PUF60Q9UHX1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PUF60Q9UHX1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PUF60Q9UHX1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PUF60Q9UHX1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PUF60Q9UHX1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PUF60Q9UHX1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PUF60Q9UHX1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PUF60Q9UHX1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PUF60Q9UHX1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PUF60Q9UHX1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PUF60Q9UHX1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PUF60Q9UHX1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PUF60Q9UHX1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PUF60Q9UHX1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PUF60Q9UHX1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PUF60Q9UHX1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PUF60Q9UHX1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PUF60Q9UHX1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PUF60Q9UHX1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PUF60Q9UHX1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PUF60Q9UHX1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PUF60Q9UHX1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PUF60Q9UHX1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PUF60Q9UHX1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PUF60Q9UHX1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PUF60Q9UHX1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PUF60Q9UHX1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PUF60Q9UHX1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PUF60Q9UHX1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PUF60Q9UHX1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PUF60Q9UHX1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PUF60Q9UHX1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PUF60Q9UHX1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PUF60Q9UHX1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PUF60Q9UHX1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PUF60Q9UHX1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PUF60Q9UHX1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PUF60Q9UHX1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PUF60Q9UHX1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.7 ms