Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY5

LPAR3, Lysophosphatidic acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPAR3Q9UBY5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPAR3Q9UBY5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPAR3Q9UBY5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPAR3Q9UBY5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LPAR3Q9UBY5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LPAR3Q9UBY5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LPAR3Q9UBY5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LPAR3Q9UBY5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LPAR3Q9UBY5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LPAR3Q9UBY5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPAR3Q9UBY5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPAR3Q9UBY5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPAR3Q9UBY5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPAR3Q9UBY5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPAR3Q9UBY5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LPAR3Q9UBY5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LPAR3Q9UBY5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LPAR3Q9UBY5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LPAR3Q9UBY5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LPAR3Q9UBY5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LPAR3Q9UBY5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LPAR3Q9UBY5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LPAR3Q9UBY5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LPAR3Q9UBY5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LPAR3Q9UBY5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LPAR3Q9UBY5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LPAR3Q9UBY5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LPAR3Q9UBY5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LPAR3Q9UBY5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LPAR3Q9UBY5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LPAR3Q9UBY5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LPAR3Q9UBY5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LPAR3Q9UBY5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LPAR3Q9UBY5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LPAR3Q9UBY5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPAR3Q9UBY5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPAR3Q9UBY5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPAR3Q9UBY5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPAR3Q9UBY5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPAR3Q9UBY5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LPAR3Q9UBY5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPAR3Q9UBY5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPAR3Q9UBY5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPAR3Q9UBY5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LPAR3Q9UBY5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LPAR3Q9UBY5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LPAR3Q9UBY5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LPAR3Q9UBY5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LPAR3Q9UBY5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LPAR3Q9UBY5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LPAR3Q9UBY5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LPAR3Q9UBY5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LPAR3Q9UBY5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LPAR3Q9UBY5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LPAR3Q9UBY5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LPAR3Q9UBY5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LPAR3Q9UBY5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LPAR3Q9UBY5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LPAR3Q9UBY5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LPAR3Q9UBY5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LPAR3Q9UBY5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LPAR3Q9UBY5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LPAR3Q9UBY5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LPAR3Q9UBY5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LPAR3Q9UBY5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LPAR3Q9UBY5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LPAR3Q9UBY5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LPAR3Q9UBY5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LPAR3Q9UBY5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPAR3Q9UBY5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPAR3Q9UBY5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPAR3Q9UBY5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPAR3Q9UBY5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPAR3Q9UBY5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LPAR3Q9UBY5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LPAR3Q9UBY5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LPAR3Q9UBY5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LPAR3Q9UBY5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LPAR3Q9UBY5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LPAR3Q9UBY5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPAR3Q9UBY5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPAR3Q9UBY5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPAR3Q9UBY5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPAR3Q9UBY5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LPAR3Q9UBY5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPAR3Q9UBY5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPAR3Q9UBY5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPAR3Q9UBY5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPAR3Q9UBY5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPAR3Q9UBY5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPAR3Q9UBY5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LPAR3Q9UBY5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPAR3Q9UBY5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPAR3Q9UBY5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LPAR3Q9UBY5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LPAR3Q9UBY5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPAR3Q9UBY5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPAR3Q9UBY5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPAR3Q9UBY5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPAR3Q9UBY5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms