Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN6

TNFRSF10D, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10D, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10DQ9UBN6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF10DQ9UBN6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF10DQ9UBN6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF10DQ9UBN6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF10DQ9UBN6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF10DQ9UBN6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF10DQ9UBN6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF10DQ9UBN6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF10DQ9UBN6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNFRSF10DQ9UBN6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF10DQ9UBN6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF10DQ9UBN6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF10DQ9UBN6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF10DQ9UBN6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF10DQ9UBN6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF10DQ9UBN6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF10DQ9UBN6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF10DQ9UBN6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF10DQ9UBN6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF10DQ9UBN6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF10DQ9UBN6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF10DQ9UBN6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF10DQ9UBN6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF10DQ9UBN6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF10DQ9UBN6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF10DQ9UBN6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF10DQ9UBN6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF10DQ9UBN6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF10DQ9UBN6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF10DQ9UBN6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF10DQ9UBN6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF10DQ9UBN6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF10DQ9UBN6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF10DQ9UBN6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFRSF10DQ9UBN6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF10DQ9UBN6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF10DQ9UBN6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF10DQ9UBN6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF10DQ9UBN6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF10DQ9UBN6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF10DQ9UBN6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF10DQ9UBN6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF10DQ9UBN6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF10DQ9UBN6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNFRSF10DQ9UBN6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNFRSF10DQ9UBN6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFRSF10DQ9UBN6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFRSF10DQ9UBN6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF10DQ9UBN6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF10DQ9UBN6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF10DQ9UBN6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF10DQ9UBN6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF10DQ9UBN6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNFRSF10DQ9UBN6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF10DQ9UBN6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF10DQ9UBN6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF10DQ9UBN6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF10DQ9UBN6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF10DQ9UBN6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF10DQ9UBN6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF10DQ9UBN6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF10DQ9UBN6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF10DQ9UBN6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF10DQ9UBN6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF10DQ9UBN6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF10DQ9UBN6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF10DQ9UBN6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF10DQ9UBN6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF10DQ9UBN6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF10DQ9UBN6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF10DQ9UBN6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF10DQ9UBN6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF10DQ9UBN6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF10DQ9UBN6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF10DQ9UBN6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF10DQ9UBN6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF10DQ9UBN6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF10DQ9UBN6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF10DQ9UBN6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF10DQ9UBN6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF10DQ9UBN6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF10DQ9UBN6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF10DQ9UBN6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF10DQ9UBN6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF10DQ9UBN6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF10DQ9UBN6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF10DQ9UBN6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF10DQ9UBN6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF10DQ9UBN6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF10DQ9UBN6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF10DQ9UBN6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF10DQ9UBN6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF10DQ9UBN6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF10DQ9UBN6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF10DQ9UBN6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF10DQ9UBN6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF10DQ9UBN6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF10DQ9UBN6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF10DQ9UBN6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms