Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATXN10Q9UBB4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATXN10Q9UBB4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATXN10Q9UBB4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATXN10Q9UBB4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATXN10Q9UBB4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATXN10Q9UBB4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ATXN10Q9UBB4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATXN10Q9UBB4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATXN10Q9UBB4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATXN10Q9UBB4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ATXN10Q9UBB4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATXN10Q9UBB4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATXN10Q9UBB4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATXN10Q9UBB4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATXN10Q9UBB4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATXN10Q9UBB4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATXN10Q9UBB4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATXN10Q9UBB4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATXN10Q9UBB4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATXN10Q9UBB4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATXN10Q9UBB4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATXN10Q9UBB4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATXN10Q9UBB4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATXN10Q9UBB4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATXN10Q9UBB4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATXN10Q9UBB4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ATXN10Q9UBB4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ATXN10Q9UBB4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATXN10Q9UBB4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATXN10Q9UBB4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATXN10Q9UBB4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATXN10Q9UBB4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATXN10Q9UBB4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATXN10Q9UBB4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATXN10Q9UBB4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
ATXN10Q9UBB4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATXN10Q9UBB4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATXN10Q9UBB4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATXN10Q9UBB4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATXN10Q9UBB4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATXN10Q9UBB4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATXN10Q9UBB4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATXN10Q9UBB4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATXN10Q9UBB4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATXN10Q9UBB4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATXN10Q9UBB4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATXN10Q9UBB4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATXN10Q9UBB4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATXN10Q9UBB4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATXN10Q9UBB4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATXN10Q9UBB4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATXN10Q9UBB4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATXN10Q9UBB4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATXN10Q9UBB4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATXN10Q9UBB4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATXN10Q9UBB4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATXN10Q9UBB4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATXN10Q9UBB4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATXN10Q9UBB4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATXN10Q9UBB4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATXN10Q9UBB4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATXN10Q9UBB4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATXN10Q9UBB4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATXN10Q9UBB4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATXN10Q9UBB4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATXN10Q9UBB4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATXN10Q9UBB4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATXN10Q9UBB4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATXN10Q9UBB4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATXN10Q9UBB4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATXN10Q9UBB4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATXN10Q9UBB4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ATXN10Q9UBB4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATXN10Q9UBB4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATXN10Q9UBB4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATXN10Q9UBB4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATXN10Q9UBB4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATXN10Q9UBB4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATXN10Q9UBB4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ATXN10Q9UBB4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATXN10Q9UBB4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATXN10Q9UBB4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATXN10Q9UBB4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATXN10Q9UBB4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATXN10Q9UBB4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATXN10Q9UBB4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATXN10Q9UBB4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ATXN10Q9UBB4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATXN10Q9UBB4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATXN10Q9UBB4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATXN10Q9UBB4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATXN10Q9UBB4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATXN10Q9UBB4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATXN10Q9UBB4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATXN10Q9UBB4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATXN10Q9UBB4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATXN10Q9UBB4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATXN10Q9UBB4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ATXN10Q9UBB4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms