Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ATXN10Q9UBB4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ATXN10Q9UBB4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ATXN10Q9UBB4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
ATXN10Q9UBB4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ATXN10Q9UBB4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ATXN10Q9UBB4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ATXN10Q9UBB4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
ATXN10Q9UBB4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATXN10Q9UBB4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATXN10Q9UBB4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ATXN10Q9UBB4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ATXN10Q9UBB4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
ATXN10Q9UBB4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
ATXN10Q9UBB4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ATXN10Q9UBB4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ATXN10Q9UBB4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ATXN10Q9UBB4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ATXN10Q9UBB4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATXN10Q9UBB4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ATXN10Q9UBB4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ATXN10Q9UBB4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ATXN10Q9UBB4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ATXN10Q9UBB4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ATXN10Q9UBB4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ATXN10Q9UBB4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ATXN10Q9UBB4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATXN10Q9UBB4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATXN10Q9UBB4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ATXN10Q9UBB4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ATXN10Q9UBB4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ATXN10Q9UBB4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATXN10Q9UBB4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATXN10Q9UBB4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ATXN10Q9UBB4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ATXN10Q9UBB4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATXN10Q9UBB4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATXN10Q9UBB4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ATXN10Q9UBB4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ATXN10Q9UBB4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ATXN10Q9UBB4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATXN10Q9UBB4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATXN10Q9UBB4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATXN10Q9UBB4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATXN10Q9UBB4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATXN10Q9UBB4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATXN10Q9UBB4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATXN10Q9UBB4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATXN10Q9UBB4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATXN10Q9UBB4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATXN10Q9UBB4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ATXN10Q9UBB4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ATXN10Q9UBB4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATXN10Q9UBB4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ATXN10Q9UBB4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATXN10Q9UBB4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATXN10Q9UBB4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATXN10Q9UBB4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATXN10Q9UBB4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATXN10Q9UBB4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATXN10Q9UBB4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATXN10Q9UBB4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATXN10Q9UBB4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATXN10Q9UBB4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATXN10Q9UBB4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATXN10Q9UBB4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATXN10Q9UBB4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ATXN10Q9UBB4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATXN10Q9UBB4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ATXN10Q9UBB4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATXN10Q9UBB4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ATXN10Q9UBB4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATXN10Q9UBB4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATXN10Q9UBB4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATXN10Q9UBB4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATXN10Q9UBB4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATXN10Q9UBB4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATXN10Q9UBB4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATXN10Q9UBB4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATXN10Q9UBB4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATXN10Q9UBB4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATXN10Q9UBB4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATXN10Q9UBB4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATXN10Q9UBB4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATXN10Q9UBB4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATXN10Q9UBB4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATXN10Q9UBB4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATXN10Q9UBB4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATXN10Q9UBB4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATXN10Q9UBB4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATXN10Q9UBB4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATXN10Q9UBB4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATXN10Q9UBB4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATXN10Q9UBB4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATXN10Q9UBB4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATXN10Q9UBB4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATXN10Q9UBB4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATXN10Q9UBB4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATXN10Q9UBB4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATXN10Q9UBB4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms