Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
HMG20BQ9P0W2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
HMG20BQ9P0W2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
HMG20BQ9P0W2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
HMG20BQ9P0W2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
HMG20BQ9P0W2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
HMG20BQ9P0W2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
HMG20BQ9P0W2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
HMG20BQ9P0W2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
HMG20BQ9P0W2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
HMG20BQ9P0W2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
HMG20BQ9P0W2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
HMG20BQ9P0W2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
HMG20BQ9P0W2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
HMG20BQ9P0W2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
HMG20BQ9P0W2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HMG20BQ9P0W2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
HMG20BQ9P0W2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
HMG20BQ9P0W2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
HMG20BQ9P0W2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
HMG20BQ9P0W2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
HMG20BQ9P0W2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
HMG20BQ9P0W2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
HMG20BQ9P0W2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
HMG20BQ9P0W2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
HMG20BQ9P0W2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
HMG20BQ9P0W2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
HMG20BQ9P0W2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
HMG20BQ9P0W2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
HMG20BQ9P0W2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
HMG20BQ9P0W2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
HMG20BQ9P0W2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
HMG20BQ9P0W2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
HMG20BQ9P0W2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
HMG20BQ9P0W2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
HMG20BQ9P0W2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
HMG20BQ9P0W2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
HMG20BQ9P0W2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
HMG20BQ9P0W2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
HMG20BQ9P0W2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
HMG20BQ9P0W2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
HMG20BQ9P0W2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
HMG20BQ9P0W2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
HMG20BQ9P0W2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
HMG20BQ9P0W2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
HMG20BQ9P0W2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
HMG20BQ9P0W2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
HMG20BQ9P0W2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HMG20BQ9P0W2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HMG20BQ9P0W2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
HMG20BQ9P0W2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
HMG20BQ9P0W2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
HMG20BQ9P0W2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
HMG20BQ9P0W2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
HMG20BQ9P0W2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
HMG20BQ9P0W2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
HMG20BQ9P0W2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
HMG20BQ9P0W2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
HMG20BQ9P0W2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
HMG20BQ9P0W2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
HMG20BQ9P0W2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
HMG20BQ9P0W2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
HMG20BQ9P0W2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
HMG20BQ9P0W2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
HMG20BQ9P0W2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
HMG20BQ9P0W2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
HMG20BQ9P0W2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
HMG20BQ9P0W2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
HMG20BQ9P0W2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
HMG20BQ9P0W2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
HMG20BQ9P0W2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
HMG20BQ9P0W2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
HMG20BQ9P0W2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
HMG20BQ9P0W2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
HMG20BQ9P0W2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
HMG20BQ9P0W2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
HMG20BQ9P0W2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
HMG20BQ9P0W2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
HMG20BQ9P0W2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
HMG20BQ9P0W2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
HMG20BQ9P0W2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
HMG20BQ9P0W2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
HMG20BQ9P0W2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
HMG20BQ9P0W2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
HMG20BQ9P0W2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
HMG20BQ9P0W2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
HMG20BQ9P0W2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
HMG20BQ9P0W2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
HMG20BQ9P0W2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
HMG20BQ9P0W2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
HMG20BQ9P0W2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
HMG20BQ9P0W2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
HMG20BQ9P0W2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
HMG20BQ9P0W2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
HMG20BQ9P0W2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
HMG20BQ9P0W2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
HMG20BQ9P0W2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
HMG20BQ9P0W2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
HMG20BQ9P0W2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
HMG20BQ9P0W2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms