Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK5

MRPL39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL39Q9NYK5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL39Q9NYK5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL39Q9NYK5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL39Q9NYK5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL39Q9NYK5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL39Q9NYK5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL39Q9NYK5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MRPL39Q9NYK5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL39Q9NYK5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL39Q9NYK5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL39Q9NYK5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL39Q9NYK5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL39Q9NYK5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL39Q9NYK5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL39Q9NYK5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL39Q9NYK5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL39Q9NYK5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL39Q9NYK5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL39Q9NYK5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL39Q9NYK5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL39Q9NYK5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL39Q9NYK5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL39Q9NYK5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL39Q9NYK5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL39Q9NYK5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL39Q9NYK5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL39Q9NYK5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL39Q9NYK5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL39Q9NYK5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL39Q9NYK5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL39Q9NYK5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL39Q9NYK5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL39Q9NYK5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MRPL39Q9NYK5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MRPL39Q9NYK5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL39Q9NYK5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL39Q9NYK5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL39Q9NYK5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL39Q9NYK5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL39Q9NYK5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL39Q9NYK5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL39Q9NYK5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL39Q9NYK5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRPL39Q9NYK5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL39Q9NYK5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL39Q9NYK5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL39Q9NYK5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL39Q9NYK5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL39Q9NYK5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL39Q9NYK5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL39Q9NYK5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL39Q9NYK5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL39Q9NYK5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL39Q9NYK5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL39Q9NYK5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL39Q9NYK5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL39Q9NYK5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL39Q9NYK5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL39Q9NYK5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL39Q9NYK5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL39Q9NYK5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL39Q9NYK5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL39Q9NYK5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL39Q9NYK5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL39Q9NYK5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL39Q9NYK5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL39Q9NYK5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL39Q9NYK5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL39Q9NYK5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL39Q9NYK5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL39Q9NYK5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL39Q9NYK5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL39Q9NYK5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL39Q9NYK5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL39Q9NYK5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL39Q9NYK5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL39Q9NYK5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL39Q9NYK5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL39Q9NYK5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL39Q9NYK5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL39Q9NYK5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL39Q9NYK5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL39Q9NYK5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL39Q9NYK5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL39Q9NYK5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL39Q9NYK5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL39Q9NYK5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL39Q9NYK5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL39Q9NYK5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL39Q9NYK5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL39Q9NYK5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL39Q9NYK5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL39Q9NYK5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL39Q9NYK5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL39Q9NYK5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL39Q9NYK5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL39Q9NYK5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRPL39Q9NYK5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL39Q9NYK5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL39Q9NYK5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms