Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALKBH4Q9NXW9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALKBH4Q9NXW9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALKBH4Q9NXW9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALKBH4Q9NXW9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKBH4Q9NXW9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALKBH4Q9NXW9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALKBH4Q9NXW9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALKBH4Q9NXW9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALKBH4Q9NXW9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKBH4Q9NXW9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKBH4Q9NXW9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKBH4Q9NXW9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALKBH4Q9NXW9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALKBH4Q9NXW9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALKBH4Q9NXW9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALKBH4Q9NXW9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALKBH4Q9NXW9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALKBH4Q9NXW9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ALKBH4Q9NXW9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALKBH4Q9NXW9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALKBH4Q9NXW9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALKBH4Q9NXW9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALKBH4Q9NXW9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALKBH4Q9NXW9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALKBH4Q9NXW9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALKBH4Q9NXW9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALKBH4Q9NXW9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALKBH4Q9NXW9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALKBH4Q9NXW9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALKBH4Q9NXW9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALKBH4Q9NXW9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ALKBH4Q9NXW9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALKBH4Q9NXW9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ALKBH4Q9NXW9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ALKBH4Q9NXW9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALKBH4Q9NXW9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALKBH4Q9NXW9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ALKBH4Q9NXW9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALKBH4Q9NXW9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALKBH4Q9NXW9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALKBH4Q9NXW9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALKBH4Q9NXW9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALKBH4Q9NXW9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALKBH4Q9NXW9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALKBH4Q9NXW9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALKBH4Q9NXW9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALKBH4Q9NXW9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ALKBH4Q9NXW9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALKBH4Q9NXW9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALKBH4Q9NXW9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALKBH4Q9NXW9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALKBH4Q9NXW9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALKBH4Q9NXW9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALKBH4Q9NXW9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALKBH4Q9NXW9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALKBH4Q9NXW9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALKBH4Q9NXW9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ALKBH4Q9NXW9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALKBH4Q9NXW9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALKBH4Q9NXW9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALKBH4Q9NXW9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ALKBH4Q9NXW9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALKBH4Q9NXW9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALKBH4Q9NXW9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALKBH4Q9NXW9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALKBH4Q9NXW9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ALKBH4Q9NXW9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALKBH4Q9NXW9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALKBH4Q9NXW9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALKBH4Q9NXW9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALKBH4Q9NXW9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALKBH4Q9NXW9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALKBH4Q9NXW9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALKBH4Q9NXW9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALKBH4Q9NXW9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALKBH4Q9NXW9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ALKBH4Q9NXW9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALKBH4Q9NXW9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALKBH4Q9NXW9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALKBH4Q9NXW9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALKBH4Q9NXW9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALKBH4Q9NXW9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALKBH4Q9NXW9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALKBH4Q9NXW9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ALKBH4Q9NXW9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALKBH4Q9NXW9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALKBH4Q9NXW9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALKBH4Q9NXW9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALKBH4Q9NXW9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALKBH4Q9NXW9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALKBH4Q9NXW9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALKBH4Q9NXW9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALKBH4Q9NXW9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALKBH4Q9NXW9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALKBH4Q9NXW9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALKBH4Q9NXW9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALKBH4Q9NXW9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALKBH4Q9NXW9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ALKBH4Q9NXW9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms