Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RLIMQ9NVW2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RLIMQ9NVW2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RLIMQ9NVW2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RLIMQ9NVW2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RLIMQ9NVW2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RLIMQ9NVW2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RLIMQ9NVW2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLIMQ9NVW2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLIMQ9NVW2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLIMQ9NVW2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLIMQ9NVW2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RLIMQ9NVW2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RLIMQ9NVW2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RLIMQ9NVW2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLIMQ9NVW2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLIMQ9NVW2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RLIMQ9NVW2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RLIMQ9NVW2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RLIMQ9NVW2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RLIMQ9NVW2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RLIMQ9NVW2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RLIMQ9NVW2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RLIMQ9NVW2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RLIMQ9NVW2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RLIMQ9NVW2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RLIMQ9NVW2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RLIMQ9NVW2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RLIMQ9NVW2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RLIMQ9NVW2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RLIMQ9NVW2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RLIMQ9NVW2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RLIMQ9NVW2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RLIMQ9NVW2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RLIMQ9NVW2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RLIMQ9NVW2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RLIMQ9NVW2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RLIMQ9NVW2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RLIMQ9NVW2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RLIMQ9NVW2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RLIMQ9NVW2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RLIMQ9NVW2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RLIMQ9NVW2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RLIMQ9NVW2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RLIMQ9NVW2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RLIMQ9NVW2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RLIMQ9NVW2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RLIMQ9NVW2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RLIMQ9NVW2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RLIMQ9NVW2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RLIMQ9NVW2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RLIMQ9NVW2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RLIMQ9NVW2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RLIMQ9NVW2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RLIMQ9NVW2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RLIMQ9NVW2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RLIMQ9NVW2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RLIMQ9NVW2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RLIMQ9NVW2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RLIMQ9NVW2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RLIMQ9NVW2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RLIMQ9NVW2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RLIMQ9NVW2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RLIMQ9NVW2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RLIMQ9NVW2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RLIMQ9NVW2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RLIMQ9NVW2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RLIMQ9NVW2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RLIMQ9NVW2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RLIMQ9NVW2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RLIMQ9NVW2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RLIMQ9NVW2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RLIMQ9NVW2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RLIMQ9NVW2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RLIMQ9NVW2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RLIMQ9NVW2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RLIMQ9NVW2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RLIMQ9NVW2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RLIMQ9NVW2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RLIMQ9NVW2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RLIMQ9NVW2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RLIMQ9NVW2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RLIMQ9NVW2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RLIMQ9NVW2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RLIMQ9NVW2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RLIMQ9NVW2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RLIMQ9NVW2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RLIMQ9NVW2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RLIMQ9NVW2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RLIMQ9NVW2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RLIMQ9NVW2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RLIMQ9NVW2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RLIMQ9NVW2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RLIMQ9NVW2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RLIMQ9NVW2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RLIMQ9NVW2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RLIMQ9NVW2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RLIMQ9NVW2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RLIMQ9NVW2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLIMQ9NVW2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms