Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATAD3AQ9NVI7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATAD3AQ9NVI7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATAD3AQ9NVI7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATAD3AQ9NVI7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATAD3AQ9NVI7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATAD3AQ9NVI7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATAD3AQ9NVI7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATAD3AQ9NVI7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATAD3AQ9NVI7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATAD3AQ9NVI7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATAD3AQ9NVI7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATAD3AQ9NVI7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATAD3AQ9NVI7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATAD3AQ9NVI7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATAD3AQ9NVI7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATAD3AQ9NVI7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATAD3AQ9NVI7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATAD3AQ9NVI7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATAD3AQ9NVI7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATAD3AQ9NVI7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATAD3AQ9NVI7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATAD3AQ9NVI7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATAD3AQ9NVI7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATAD3AQ9NVI7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATAD3AQ9NVI7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATAD3AQ9NVI7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATAD3AQ9NVI7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATAD3AQ9NVI7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATAD3AQ9NVI7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATAD3AQ9NVI7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATAD3AQ9NVI7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATAD3AQ9NVI7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATAD3AQ9NVI7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATAD3AQ9NVI7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATAD3AQ9NVI7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATAD3AQ9NVI7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATAD3AQ9NVI7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATAD3AQ9NVI7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATAD3AQ9NVI7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATAD3AQ9NVI7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATAD3AQ9NVI7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATAD3AQ9NVI7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATAD3AQ9NVI7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATAD3AQ9NVI7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ATAD3AQ9NVI7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATAD3AQ9NVI7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATAD3AQ9NVI7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATAD3AQ9NVI7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATAD3AQ9NVI7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATAD3AQ9NVI7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATAD3AQ9NVI7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
ATAD3AQ9NVI7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATAD3AQ9NVI7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATAD3AQ9NVI7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATAD3AQ9NVI7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATAD3AQ9NVI7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATAD3AQ9NVI7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATAD3AQ9NVI7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATAD3AQ9NVI7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATAD3AQ9NVI7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATAD3AQ9NVI7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATAD3AQ9NVI7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATAD3AQ9NVI7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATAD3AQ9NVI7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATAD3AQ9NVI7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATAD3AQ9NVI7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATAD3AQ9NVI7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATAD3AQ9NVI7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATAD3AQ9NVI7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATAD3AQ9NVI7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATAD3AQ9NVI7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATAD3AQ9NVI7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATAD3AQ9NVI7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATAD3AQ9NVI7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATAD3AQ9NVI7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATAD3AQ9NVI7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATAD3AQ9NVI7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATAD3AQ9NVI7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATAD3AQ9NVI7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATAD3AQ9NVI7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATAD3AQ9NVI7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATAD3AQ9NVI7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATAD3AQ9NVI7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATAD3AQ9NVI7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATAD3AQ9NVI7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATAD3AQ9NVI7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATAD3AQ9NVI7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATAD3AQ9NVI7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATAD3AQ9NVI7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATAD3AQ9NVI7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAD3AQ9NVI7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATAD3AQ9NVI7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATAD3AQ9NVI7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATAD3AQ9NVI7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATAD3AQ9NVI7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATAD3AQ9NVI7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATAD3AQ9NVI7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATAD3AQ9NVI7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 280.9 ms