Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ATAD3AQ9NVI7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ATAD3AQ9NVI7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
ATAD3AQ9NVI7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ATAD3AQ9NVI7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ATAD3AQ9NVI7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ATAD3AQ9NVI7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ATAD3AQ9NVI7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ATAD3AQ9NVI7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ATAD3AQ9NVI7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATAD3AQ9NVI7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ATAD3AQ9NVI7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATAD3AQ9NVI7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATAD3AQ9NVI7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATAD3AQ9NVI7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATAD3AQ9NVI7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ATAD3AQ9NVI7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATAD3AQ9NVI7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATAD3AQ9NVI7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATAD3AQ9NVI7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATAD3AQ9NVI7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ATAD3AQ9NVI7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATAD3AQ9NVI7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATAD3AQ9NVI7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATAD3AQ9NVI7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATAD3AQ9NVI7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATAD3AQ9NVI7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATAD3AQ9NVI7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATAD3AQ9NVI7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATAD3AQ9NVI7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATAD3AQ9NVI7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATAD3AQ9NVI7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATAD3AQ9NVI7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATAD3AQ9NVI7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATAD3AQ9NVI7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ATAD3AQ9NVI7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATAD3AQ9NVI7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATAD3AQ9NVI7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATAD3AQ9NVI7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATAD3AQ9NVI7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATAD3AQ9NVI7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATAD3AQ9NVI7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATAD3AQ9NVI7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATAD3AQ9NVI7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATAD3AQ9NVI7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATAD3AQ9NVI7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATAD3AQ9NVI7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATAD3AQ9NVI7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATAD3AQ9NVI7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATAD3AQ9NVI7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATAD3AQ9NVI7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATAD3AQ9NVI7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATAD3AQ9NVI7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATAD3AQ9NVI7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATAD3AQ9NVI7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATAD3AQ9NVI7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATAD3AQ9NVI7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATAD3AQ9NVI7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATAD3AQ9NVI7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATAD3AQ9NVI7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATAD3AQ9NVI7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATAD3AQ9NVI7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATAD3AQ9NVI7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATAD3AQ9NVI7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATAD3AQ9NVI7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATAD3AQ9NVI7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATAD3AQ9NVI7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATAD3AQ9NVI7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATAD3AQ9NVI7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATAD3AQ9NVI7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATAD3AQ9NVI7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATAD3AQ9NVI7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATAD3AQ9NVI7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ATAD3AQ9NVI7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATAD3AQ9NVI7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATAD3AQ9NVI7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATAD3AQ9NVI7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATAD3AQ9NVI7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATAD3AQ9NVI7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATAD3AQ9NVI7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATAD3AQ9NVI7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATAD3AQ9NVI7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATAD3AQ9NVI7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATAD3AQ9NVI7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATAD3AQ9NVI7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ATAD3AQ9NVI7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ATAD3AQ9NVI7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATAD3AQ9NVI7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
ATAD3AQ9NVI7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATAD3AQ9NVI7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATAD3AQ9NVI7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATAD3AQ9NVI7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATAD3AQ9NVI7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATAD3AQ9NVI7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATAD3AQ9NVI7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATAD3AQ9NVI7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATAD3AQ9NVI7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms