Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTU7

CBLN4, Cerebellin-4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN4Q9NTU7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CBLN4Q9NTU7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBLN4Q9NTU7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBLN4Q9NTU7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBLN4Q9NTU7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBLN4Q9NTU7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBLN4Q9NTU7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBLN4Q9NTU7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBLN4Q9NTU7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBLN4Q9NTU7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBLN4Q9NTU7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBLN4Q9NTU7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBLN4Q9NTU7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CBLN4Q9NTU7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBLN4Q9NTU7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBLN4Q9NTU7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBLN4Q9NTU7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBLN4Q9NTU7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBLN4Q9NTU7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBLN4Q9NTU7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBLN4Q9NTU7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBLN4Q9NTU7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBLN4Q9NTU7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBLN4Q9NTU7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBLN4Q9NTU7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBLN4Q9NTU7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBLN4Q9NTU7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBLN4Q9NTU7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CBLN4Q9NTU7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CBLN4Q9NTU7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBLN4Q9NTU7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBLN4Q9NTU7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBLN4Q9NTU7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBLN4Q9NTU7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBLN4Q9NTU7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBLN4Q9NTU7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBLN4Q9NTU7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBLN4Q9NTU7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBLN4Q9NTU7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBLN4Q9NTU7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBLN4Q9NTU7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBLN4Q9NTU7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBLN4Q9NTU7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBLN4Q9NTU7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBLN4Q9NTU7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CBLN4Q9NTU7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBLN4Q9NTU7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBLN4Q9NTU7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBLN4Q9NTU7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBLN4Q9NTU7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBLN4Q9NTU7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBLN4Q9NTU7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CBLN4Q9NTU7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CBLN4Q9NTU7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBLN4Q9NTU7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBLN4Q9NTU7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBLN4Q9NTU7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBLN4Q9NTU7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBLN4Q9NTU7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBLN4Q9NTU7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBLN4Q9NTU7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBLN4Q9NTU7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBLN4Q9NTU7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBLN4Q9NTU7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBLN4Q9NTU7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBLN4Q9NTU7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBLN4Q9NTU7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBLN4Q9NTU7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBLN4Q9NTU7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBLN4Q9NTU7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBLN4Q9NTU7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBLN4Q9NTU7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CBLN4Q9NTU7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CBLN4Q9NTU7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBLN4Q9NTU7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBLN4Q9NTU7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBLN4Q9NTU7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBLN4Q9NTU7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBLN4Q9NTU7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBLN4Q9NTU7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBLN4Q9NTU7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBLN4Q9NTU7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBLN4Q9NTU7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBLN4Q9NTU7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBLN4Q9NTU7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBLN4Q9NTU7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBLN4Q9NTU7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBLN4Q9NTU7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBLN4Q9NTU7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBLN4Q9NTU7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBLN4Q9NTU7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBLN4Q9NTU7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBLN4Q9NTU7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBLN4Q9NTU7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBLN4Q9NTU7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBLN4Q9NTU7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBLN4Q9NTU7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBLN4Q9NTU7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBLN4Q9NTU7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBLN4Q9NTU7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms